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MICROBIOLOGIA GERAL CARACTERIZAÇÃO E CLASSIFICAÇÃO DOS MICRORGANISMOS TAXONOMIA FERNANDA MORCATTI COURA Introdução ▪ Taxonomia: classificar e nomear os organismos em categorias ou taxa (singular: taxón) – grau de similaridade ▪ Filogenia: estudo da história evolutiva dos organismos ▪ A hierarquia dos taxa reflete esta relação evolutiva ou filogenética Classificação dos seres vivos ▪ Aristóteles: duas categorias apenas (plantas ou animais) ▪ Carolus Linnaeus (1753): botânico sueco classificou em 2 Reinos (Plantae e Animalia) ▪ Carl von Nägeli (1857): propôs que as bactérias e os fungos fossem colocados no reino das plantas ▪ Ernest Haeckel: propôs o reino protista para incluir bactérias, protozoários, algas e fungos Classificação dos seres vivos ▪ Edward Chatton: 1937, termo procarioto para distinguir células que NÃO POSSUEM NÚCLEO das nucleadas ▪ Roger Stainer: 1961, definição atual de procarioto, células nas quais o material nuclear não é envolto por uma membrana nuclear ▪ Robert Murray: 1968, propôs o Reino Prokaryotae Classificação dos seres vivos § Robert H. Whittaker em 1969 ◦Sistema de cinco reinos ◦Monera, Fungi, Animalia, Protista, Plantae Classificação dos seres vivos § Robert H. Whittaker ◦Nível de organização celular ◦Tipos de nutrição ◦ Interação Classificação dos seres vivos ▪ TRÊS DOMÍNIOS ▪ Carl R Woese – 1978 ▪ Propôs elevar os três tipos de células (eucarioto e dois tipos distintos de procariotos) para um nível acima de Reino - Domínio ▪ Os três diferentes Domínios são diferenciados quanto às diferenças nas sequências de nucleotídeos do rRNA, na estrutura da membrana lipídica, nas moléculas de tRNA, sensibilidade a antibióticos e metabolismo Classificação dos seres vivos ▪ TRÊS DOMÍNIOS ▪ Carl R Woese – 1978 ▪ O primeiro a reconhecer o rRNA como uma ferramenta na construção de relações filogenéticas ◦ Todas as células possuem ribossomos - Genes de rRNA têm sofrido poucas mudanças ao longo do tempo, de modo que membros de um domínio, filo e/ou gênero têm a mesma sequência do seu rRNA Classificação dos seres vivos § Três domínios ◦Bacteria ◦Archaea ◦Eukaryota Domínio Bacteria § Procariotos patogênicos e não patogênicos encontrados no solo e água § Procariotos fotoautotróficos Árvore filogenética do Domínio Bacteria Domínio Bacteria ▪ Apresentam parede celular composta por peptidioglicano [Exceções: Planctomyces-Pirella (proteínas) e Mycoplasma-Chlamydia (desprovidas de parede celular)] ▪ Bicamada lipídica; Ribossomos 70S; Algumas fazem fotossíntese; Primeiro aminoácido das proteínas - Formylmetionina; Sensibilidade a antibióticos que inibem ribossomos 70S... Domínio Archea § Procariotos que não tem peptidioglicano nas suas paredes celulares e que frequentemente vivem em ambientes extremos e realizam processos metabólicos incomuns Árvore filogenética do Domínio Archea Domínio Archea ▪ Membrana lipídica diferente; Apresentam parede celular composta de pseudopeptideoglicano ou proteínas, glicoproteínas ou polissacarídeos; Ribossomos 70S, com algumas etapas da síntese proteica semelhante a de eucariotos; Não realizam fotossíntese; Primeiro aminoácido das proteínas – Metionina; Sem Sensibilidade a antibióticos ▪ Metanogênicos, halófilos, acidófilos e hipertermófilos Domínio Eukarya § Animais, plantas, fungos e protistas § Algas - fototróficos; cloroplastos – organelas ricas em clorofila § Fungos - leveduras – unicelulares; fungos filamentosos; Principais agentes de reciclagem de MO na natureza § Protozoários - não possuem PC; móveis; algumas espécies patogênicas Domínio Eukarya ▪ Geralmente apresentam celulose ou quitina na parede celular; ▪ Ribossomos 80S; ▪ Crescimento na temperatura máxima de 62oC; Domínio Eukarya ▪ Fotossíntese baseada na clorofila presente nos cloroplastos; ▪ Primeiro aminoácido das proteínas – Metionina; ▪ Núcleo envolto por membrana. Seis reinos ▪ Thomas Cavalier-Smith ▪ Análises de características ultra estruturais, proteína e DNA ▪ Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev., 73, pp. 203-266, 1998. ▪ Cavalier-Smith, T. Only six kingdoms of life. Proc. R. Soc. Lond., 271, pp. 1251-1262, 2004. Seis reinos ▪ Império Prokaryota ◦ Reino Bacteria ▪ Império Eukaryota ◦ Reinos Protozoa Animalia Fungi Plantae Chromista ◦ 34 filos kingdom Protozoa (Alveolata, cabozoa, Amoebozoa and Choanozoa) Classificação dos seres vivos Filogenia molecular ▪ Requisitos para que uma molécula possa representar relações evolutivas verdadeiras entre os organismos: 1- Deve ser de distribuição universal no grupo escolhido para o estudo 2- Deve ser funcionalmente homóloga em cada organismos – função idêntica 3- Sequência de nucleotídeos das moléculas podem ser alinhadas adequadamente, permitindo a identificação de regiões com homologia de sequência, bem como variância de sequência 4- Deve sofrer alterações em uma taxa comensurável em relação à distância medida Filogenia molecular ▪ Carl Woese e seus colaboradores escolheram o rRNA como uma ferramenta para estudos de sistemática molecular (cronômetro evolutivo): 1- Encontrado em todas as células e mesmo no genoma de organelas (mitocôndrias e cloroplastos) 2- Funcionalmente constantes 3- Abundante - 0,3- 0,4% do genoma 4- Fácil de ser isolado e purificado Filogenia molecular 5. Interage com várias outras moléculas de RNA e proteínas 6. O rRNA contêm regiões com taxas de evolução distintas (regiões de alta pressão de seleção e regiões de baixa pressão de seleção) 7. Possui tamanho adequado para estudos comparativos e análise estatística rRNA rRNA ▪ Preparo de uma árvore filogenética a partir de sequências de rRNA 16S Nomenclatura científica ▪ Todo organismo recebe dois nomes ou um binômio ▪ Carolus von Linnaeus ▪ Gênero e espécie ▪ Em latim ▪ Grifado ou em itálico ▪ O primeiro indica gênero e o segundo espécie Nomenclatura científica ▪ A NOMENCLATURA CIENTÍFICA DESIGNA PARA CADA ORGANISMO DOIS NOMES GÊNERO - PRIMEIRO NOME, COM LETRA MAIÚSCULA ESPÉCIE - SEGUNDO NOME, SEMPRE LETRA MINÚSCULA SEMPRE EM ITÁLICO OU SUBLINHADOS EXEMPLOS: Salmonella typhimurium – bactéria Saccharomyces cerevsae – levedura Trypanosoma cruzi - protozoário Nomenclatura científica ▪ VÍRUS INTERNATIONAL COMMITEE ON TAXONOMY OF VIRUSES (ICTV) OS VÍRUS NÃO EVOLUÍRAM DE UM ANCESTRAL COMUM ALTA TAXA DE MUTAÇÃO E RECOMBINAÇÃO GENÉTICA GERALMENTE SÃO CLASSIFICADOS EM FAMÍLIAS DE ACORDO COM CARACTERÍSTICAS MORFOLÓGICAS E O TIPO DE ÁCIDO NUCLEICO (COMPOSIÇÃO E POLARIDADE), ESTRATÉGIA DE REPLICAÇÃO, HOSPEDEIRO E DOENÇA NÃO SÃO COMPOSTOS POR CÉLULAS UTILIZAM A CÉLULA HOSPEDEIRA PARA SE MULTIPLICAR – PARASITAS INTRACELULARES OBRIGATÓRIOS Nomenclatura científica ▪ PRÍONS PARTÍCULAS INFECTANTES MENORES QUE OS VÍRUS QUE CAUSAM DOENÇAS NEUROLÓGICAS NOS SERES HUMANOS E ANIMAIS DIFERENTEMENTE DOS VÍRUS, NÃO POSSUEM ÁCIDO NUCLEICO SÃO ISOFORMAS ANORMAIS DE PROTEÍNAS PRIÔNICAS CODIFICADAS PELOS HOSPEDEIROS Hierarquia taxonômica ▪ Todos os organismos podem ser agrupados em uma série de subdivisões que formam uma hierarquia taxonômica Exemplo: Taxonomia Salmonella § Domínio: Bacteria § Filo: Proteobacteria § Classe: Gammaproteobacteria § Ordem: Enterobacterioles § Família: Enterobacteriaceae § Gênero: Salmonella § Espécie: enterica Característica Procarioto Eucarioto Tamanho da célula 0,2 a 2,0 µm de diâmetro 10 a 100 µm de diâmetro Núcleo Sem membrana nuclear Núcleoverdadeiro Organelas revestidas por membrana Ausentes Presentes Parede celular Complexa (peptidioglicano) Se presente, simples (celulose, quitina) Membrana plasmática Sem carboidratos Esteróis e carboidratos – receptores Citoplasma Sem citoesqueleto Citoesqueleto presente Ribossomos Menor (70S) Maior (80S) Cromossomo (DNA) Um único, sem histonas Múltiplos com histonas Divisão celular Fissão binária Mitose Recombinação sexual Ausente, transferência DNA Meiose Procariotos e Eucariotos ▪ Procariotos e eucariotos são quimicamente similares - ambos contem ácidos nucleicos, proteínas, lipídeos e carboidrato, membrana plasmática ▪ Usam os mesmos tipos de reações químicas para metabolizar o alimento, formar proteínas e armazenar energia ▪ Informação genética contida no DNA Procariotos ▪ DNA não está envolvido por uma membrana e é um cromossomo de arranjo circular (algumas tem dois cromossomos ou um cromossomo com arranjo linear) ▪ DNA não está associado com histonas (proteínas cromossômicas especiais encontradas em eucariotos) Procariotos ▪ Não possuem organelas revestidas por membrana (estruturas celulares especializadas que possuem funções especificas) ▪ Suas paredes celulares quase sempre contém o polissacarídeo complexo peptideoglicano ▪ Normalmente se dividem por fissão binária Bactérias ▪ Bactérias patogênicas e não patogênicas encontrados no solo e água ▪ Bactérias fotossintetizadoras ◦ Cianobactérias ◦Bactérias verdes não sulfurosas ◦Bactérias verdes sulfurosas ◦Bactérias púrpuras sulfurosas Arquibactérias (Archaea) ▪ Procariotos que não tem peptidioglicano nas suas paredes celulares e que frequentemente vivem em ambientes extremos e realizam processos metabólicos incomuns ▪ Extremofílicos – halófilos, hipertermófilos e acidófilos ▪ Metanogênicos ▪ Não existem arquibactérias patogênicas Eucariotos ▪ Animais, plantas, fungos, algas e protozoários ▪ DNA contido em um núcleo separado do citoplasma por uma membrana nuclear, em cromossomos múltiplos ▪ DNA associado as proteínas cromossômicas (histonas e não histonas) ▪ Diversas organelas revestidas por membranas ▪ Paredes celulares, quando presentes, são quimicamente simples Eucariotos Procariotos Archaea Bactéria Protozoários ▪ Sistema de cinco reinos - Reino Protista (Whittaker) ▪ Três domínios - Reino Protozoa (Woese) ▪ Microrganismos eucarióticos, unicelulares ▪ Não contem clorofila Protozoários ▪ Alguns são móveis em água – cílios ou flagelos ▪ Amebas – movimento ameboide ▪ Habitam a água e o solo ▪ Podem fazer parte da microbiota normal de alguns animais Protozoários ▪ Não apresentam parede celular ▪ Aproximadamente 20 mil espécies, sendo poucas patogênicas ▪ Filogeneticamente diversos, alguns aeróbios e outros anaeróbios Protozoários ▪ Os protozoários podem ser agrupados conforme seu aparelho locomotor ou filos de acordo com o rRNA Protozoários ▪ Amebóide (Filo: Amoebozoa): deslocam-se por pseudópodes; maioria vida livre ▪ Entamoeba histolytica - Agente causador da disenteria amebiana; única das amebas patogênica encontradas no intestino humano; transmissão entre humanos: ingestão de cistos que são excretados nas fezes de um infectado Protozoários ▪ Pseudópodes: são prolongamentos citoplasmáticos encontrados em amebas. Geralmente emite apenas um prolongamento citoplasmático e o corpo acompanha Amoeba Protozoários ▪ Filo Flagellata (Filo: Euglenozoa): utilizam-se de flagelos ▪ Movem em um movimento tipo chicote (Mastigophora) ▪ Possuem dois ou mais flagelos, algumas espécies possuem até oito ▪ Hemoflagelados – parasitas sanguíneos ▪ Doença de Chagas Protozoários ▪ Flagelo: A função é criar movimento (locomoção) da célula em si ou do fluido envolvente. Precisa de muita energia Trypanossoma cruzi Protozoários ▪ Filo Ciliophora ou ciliados: possuem cílios ▪ Balatidium coli – único ciliado parasita de humanos - disenteria Protozoários ▪ Cílios: movimento constante numa única direção. São estruturalmente idênticos aos flagelos e geralmente usa-se o termo quanto eles são numerosos e curtos Protozoários ▪ Classe Sporozoa (Filo: Apicomplexa): desprovidos de aparelho locomotor – não se locomovem quando adultos e são parasitas intracelulares obrigatórios ▪ Malária, toxoplasmose, Eimeria, Isospora Isospora Protozoários ▪ Filo Archeozoa: Formas primitivas de eucariotos ◦Muitos vivem no trato digestório de animais ◦Trichomonas vaginalis ◦Possuem flagelo ▪ Filo Microspora - não possuem mitocôndrias, parasitas IC Giardia lamblia Algas ▪ Antigas algas* azuis-verdes - cianobactérias não são algas e sim bactérias ▪ Algas verdes e vermelhas: Reino Plantae ▪ Criação do Reino Chromista: Algas marrons, algas marrons-douradas, diatomáceas, oomicetos, dinoflagelados, etc. ▪ Dinoflagelados: mais relacionados filogeneticamente aos protozoários ciliados (Reino Protista ou Reino Chromista) ▪ São classificadas de acordo com seu rRNA, estrutura, pigmentos e outras propriedades Algas ▪ Características gerais ◦ Utilizam a luz como fonte de energia e CO2 como sua principal fonte de carbono ◦ Produzem aproximadamente 80% do oxigênio contido na atmosfera ◦ Não possuem tecidos (raízes, caule ou folhas) ◦ Vivem em ambientes de água doce (rios, lagos ou superfícies úmidas) ou salgada (mares e oceanos) ◦ Árvores com grande umidade podem ser hospedeiras de algas em associação com fungos (liquens) Algas ▪ Características gerais ◦Unicelular ou multicelular (filamentosos) macroscópicas e microscópicas ◦Podem ser usadas como fonte de nutrientes ou causar problemas como entupimentos de canos e produção de toxinas Algas Líquens = algas + fungos A alga fornece nutriente para o fungo - o fungo proteção, umidade, nutrientes fotossíntese Os líquens são indicadores biológicos da qualidade do ar - não sobrevivem quando a poluição atmosférica é alta Algas ▪ O Papel das Algas ◦ Parte importante na cadeia alimentar aquática ◦ Convertem CO2 em carboidratos que podem ser consumidos pelos organismos ◦ O2 é subproduto de sua fotossíntese - estima-se que 80% do oxigênio presente na Terra seja produzido por algas planctônicas ◦ Fluorescência de certas espécies de algas indica que as águas onde crescem estão poluídas- desenvolvem-se em altas [ ] de material orgânico que existe no esgoto ou dejetos industriais - quando a alga morre, a decomposição de um grande número de células associadas com a fluorescência diminui o O2 dissolvido na água Algas ▪ Extrato de algas têm sido utilizados como fertilizantes Algas ▪ Muitas algas unicelulares são simbiontes em animais ◦ Ex. Molusco gigante Tridacna se fixa em água rasa, as algas proliferam em seus órgãos quando os moluscos estão expostos ao sol e liberam glicerol na circulação dos moluscos, o que supre a necessidade de carboidratos desses animais Algas ▪ Algas na alimentação humana ▪ Indústria alimentar - emulsificante e conservante, como pectina em gelatinas, compotas e marmeladas ▪ Ágar-ágar, substância gelatinosa, é usado na indústria alimentícia para dar viscosidade a molhos e doces ▪ Doenças - ingestão toxinas DÚVIDAS?
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