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1. FUNDAMENTOS 1.1. BIOLOGIA 1.1.1. Aponte quais são as unidades estruturais e funcionais comuns aos organismos vivos? Justifique sua resposta. 1.1.2. Explique porque a difusão limita as dimensões celulares e qual a relação disso com as membranas biológicas? 1.1.3. Quais os três domínios da vida e quais características os agrupam e os diferenciam? 1.1.4. Como é a classificação dos organismos quanto a obtenção de energia? 1.1.5. Qual a principal diferença entre procariotos e eucariotos? 1.1.6. Qual a diferença entre as células de eucariotos vegetais e animais? 1.2. QUÍMICA 1.2.1. Descreva os principais grupos funcionais que os compostos de carbonos (orgânicos) apresentam? 1.2.2. Descreva as principais unidades moleculares (metabólitos) que são moléculas orgânicas pequenas e comuns aos organismos vivos. 1.2.3. Quais são macromoléculas, aponte sua função e importância para as células? 1.2.4. Quanto a estrutura tridimensional das moléculas, descreva os isômeros e a relação com as interações entre as biomoléculas? 1.3. FÍSICA 1.3.1. Explique qual o significado biológico do estado estacionário dinâmico? 1.3.2. Como os conceitos das 1a e 2a Leis da Termodinâmica estão relacionados com os eventos metabólicos e celulares? Dê um exemplo para cada Lei. 1.4. EVOLUÇÃO 1.4.1. Descreva e explique o conceito que é a base para a evolução de organismos vivos? 2. ESTRUTURA E CATÁLISE 2.1. ÁGUA E AMINOÁCIDOS 2.1.1. Aponte as principais propriedades estruturas, químicas e funcionais que a água apresenta em sistemas biológicos? Faça um resumo. 2.1.2. Descreva em detalhes a estrutura de um aminoácido e que características são comuns a todos eles? 2.1.3. Cite todos os aminoácidos protéicos e classifique-o com base na polaridade e carga de sua cadeia lateral (grupo R) 2.1.4. Descreva alguns aminoácidos incomuns e suas funções para o organismo. 2.2. PROTEÍNAS 2.2.1. O que são proteínas e peptídeos e o que os diferencia? 2.2.2. Quais as características de uma ligação peptídica? 2.2.3. Como uma seqüência de aminoácidos pode fornecer importantes informações bioquímicas? 2.2.4. Qual a importância dos bancos de dados de proteínas para a ciência? 2.2.5. Escreva um resumo sobre estrutura de proteína e a hierarquia estrutural (explique o que são: estruturas primária, secundária, terciária e quaternária), comente sobre proteínas fibrosas e globulares 2.2.6. O que é a desnaturação de uma proteína e qual a conseqüência para sua função biológica? 2.2.7. O processo de renaturação de uma proteína é sempre espontâneo? Explique. 2.3. ENZIMA 2.3.1. Toda a enzima é uma proteína? Explique. 2.3.2. O que é uma enzima e que atributos ela precisa ter? 2.3.3. Considerando o funcionamento de uma enzima, como elas conseguem aumentar a velocidade de catálise? 2.3.4. O que é energia de ligação? 2.3.5. Quais são os quatro mecanismos catalíticos que contribuem para a energia de ligação e conseqüentemente aumentam a velocidade de catálise? Por que? 2.3.6. Quais são os mecanismos catalíticos, que envolvem interações covalentes transitórias? Por que? 2.3.7. O que é uma pró-enzima ou um zimogênio? De exemplos. 2.4. CINÉTICA ENZIMÁTICA 2.4.1. Como a concentração do substrato influi na velocidade de reação catalisada por enzimas? 2.4.2. Defina estado pré-estacionário e estado estacionário numa reação enzimática e como esses conceitos foram importantes para a definição da constante de Michaelis? 2.4.3. Qual o significado de Km? 2.4.4. Qual o objetivo de se transformar a equação de Michaelis-Menten no gráfico de duplos recíprocos? 2.4.5. Qual o significado de Kcat e Kcat/Km? 2.5. INIBIÇÃO ENZIMÁTICA 2.5.1. Descreva o que é uma inibição reversível e irreversível? 2.5.2. Explique e caracterize as inibições competitiva, incompetitiva, mista e não competitiva. 2.5.3. Explique o funcionamento dos compostos químicos (inibidores) que agem como inativadores suicidas e análogos do estado de transição. 2.5.4. Explique como o pH e a temperatura podem influenciar na atividade enzimática? 2.6. MEMBRANAS BIOLÓGICAS E TRANSPORTE 2.6.1. Faça um resumo sobre a composição e a arquitetura das membranas biológicas. 2.6.2. Qual a importância funcional das membranas biológicas? 2.6.3. Quais são as propriedades fundamentais que as membranas biológicas compartilham? 2.6.4. Explique o que são proteínas periféricas, integrais e anfitrópicas? 2.6.5. Explique o que é o transporte passivo e diferencie a difusão simples da difusão facilitada. 2.6.6. Descreva o funcionamento e as diferenças existentes entre os canais e os transportadores? 2.6.7. Quis são as três classes gerais de transportadores que descrevem os movimentos dos solutos e explique-os? 2.6.8. Explique o que é o gradiente químico e potencial elétrico de membrana e estabeleça uma relação disto com a 1a e 2a Leis da termodinâmica. 2.6.9. O que é o transporte ativo-primário e ativo-secundário e qual a relação entre eles? 3. BIOENERGÉTICA E METABOLISMO 3.1. BIOENERGÉTICA 3.1.1. O que é a variação de energia livre numa dada reação enzimática 3.1.2. Explique o que são reações exergônicas e endergônicas. 3.1.3. Qual a importância para o metabolismo o fato de que as variações de energia livre padrão são aditivas? 3.1.4. Explique porque a hidrólise de ATP possui variação de energia grande e negativa? 3.1.5. Somente o ATP pode armazenar ou atuar como doador de energia após hidrólise? Explique. 3.2. METABOLISMO 3.2.1. Faça um resumo para explicar a importância e o papel das reações de oxidação- redução para o metabolismo. 3.2.2. Diferencie grupos prostéticos de coenzimas? 3.2.3. Descreva as principais coenzimas e grupos prostéticos envolvidos no transporte de elétrons no metabolismo. 3.2.4. Qual a relação existente entre algumas vitaminas com coenzimas e grupos prostéticos? De exemplos.
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