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Introdução à BioquímicaIntrodução à Bioquímica Erika Cristina G. Aguieiras LaBiM (IQ Lab. 549-1) erikaaguieiras@gmail.com Bloco I aminoácidos proteínas enzimas Bloco II Ácidos nucleicos DNA e RNA Replicação, transcrição e tradução Bloco III Metabolismo Açúcares Lipídeos • M.Total=(2. M.Teórica+M.Prática)/3 M.Total>=7,0 aprovado 3,0<=M.Total<7,0 prova final M.Total <3,0 reprovado • M.Final = (M.Total+ProvaFinal)/2 • M.Final >= 5,0 aprovado BIBLIOGRAFIA: • Jeremy M Berg, John L Tymoczko and Lupert Stryer, Biochemistry 8th edition • David L, Nelson, Michael M Cox, Lehninger, Principles of Biochemistry, 6th edition • Donald Voet, Judith G, Voet, Biochemistry, 4th edition BIOQUÍMICA “Bioquímica descreve em termos moleculares as estruturas, os mecanismos e os processos químicos compartilhados por todos os organismos, e fornece princípios organizacionais que fundamentam a vida em todas as suas diferentes formas, princípios esses que coletivamente serão referidos como a lógica molecular da vida.” (Nelson e Cox, 2002) Bioquímica Emergência da vida Big Bang Emergência da vida 4 a 5 bilhões de anos NH3, H2S, CO, CO2, CH4, N2 e H2O Ambiente Redutor Alexander Oparin e John B. S. Haldane propuseram nos anos de 1920 que a radiação UV do sol e descargas elétricas proporcionaram a reação de substâncias simples para a formação de substâncias mais complexas: biomoléculas Emergência da vida – Experimento de Miller-Urey Stanley Miller Stanley Miller e Harold Urey (1953) Formaldeído, HCN e Biomoléculas Simples Emergência da vida – Experimento de Miller-Urey Stanley Miller Composto Rendimento (%) Glicina 2,1 Ácido Glicólico 1,9 Sarcosina 0,25 Alanina 1,7 Ácido Lático 1,6 N-Metilalanina 0,07 Ácido a-amino-n-isobutírico 0,34 Ácido a-hidroxiaminobutírico 0,007 Ácido a-hidroxibutirico 0,34 b-Alanina 0,76 Ácido Succínico 0,27 Ácido Aspártico 0,024 Ácido Glutâmico 0,051 Ácido Iminodiacético 0,37 Ácido Iminoaceticopropiônico 0,13 Ácido Fórmico 4,0 Ácido Acético 0,51 Ácido Propiônico 0,66 Uréia 0,034 N-Metiluréia 0,051 BIOMOLÉCULAS “ As moléculas que exercem uma função em células vivas hoje são as mesmas encontradas em química orgânica – simplesmente, elas operam em um contexto diferente.” (Campbell e Farell, 2007) Todos os processos que ocorrem nos organismos vivos seguem todas leis físicas e químicas. O estudo da bioquímica mostra como o conjunto de moléculas inanimadas que constituem os organismos vivos interage para manter e perpetuar a vida exclusivamente pelas leis físicas e químicas que regem o universo inanimado. O que então distingue os organismos vivos dos objetos inanimados? 1. O alto grau de complexidade química e de organização microscópica; 2. A existência de sistemas para extrair, transformar e utilizar energia do meio ambiente; 3. Ter funções definidas para cada um dos seus componentes e a capacidade de regular as interações entre eles; 4. A existência de mecanismos para sentir e responder a alterações do meio ambiente; 5. A capacidade quase perfeita de auto-replicação e auto- organização; 6. Capacidade de se alterar ao longo do tempo por evolução. Células A árvore filogenética da vida Ancestral comum Célula procariótica Pro (antes); karyon (núcleo) Célula eucariótica Eu (verdadeiro); karyon (núcleo) Hierarquia estrutural Composição celular • Moléculas orgânicas pequenas dissolvidas na fase aquosa metabólitos centrais das principais vias metabólicas (aminoácidos, nucleotídeos, açúcares e seus derivados fosforilados, ácidos mono, di e tricarboxílicos) • Metaboloma conjunto completo de moléculas pequenas em uma dada célula sob um conjunto específico de condições Composição celular • Macromoléculas principais constituintes celulares • Montadas a partir de precursores simples (oligômeros) Proteínas aminoácidos Ácidos nucleicos (DNA, RNA) nucleotídeos Polissacarídeosmonossacarídeos Lipídeos não são classificados como macromoléculas Composição celular Era dos “OMAS” • Proteoma conjunto de todas as proteínas em funcionamento na célula • Genoma sequência completa da DNA (ou RNA viral) da célula • Glicoma conjunto de todas as moléculas contendo carboidratos • Lipidoma conjunto de todas as molécula contendo lipídeos BIOLOGIA DE SISTEMAS Apesar da superposição com muitas outras disciplinas, a bioquímica procura responder, principalmente, às seguintes perguntas: 1. Quais são as estruturas químicas e tridimensionais das biomoléculas? 2. Como as moléculas biológicas interagem? 3. Como as células sintetizam e degradam as moléculas biológicas? 4. Como a informação genética é armazenada, transmitida e expressa? 5. Como a energia é conservada e usada pelas células? 6. Quais os mecanismos para organizar as biomoléculas e para coordenar suas atividades? BIOQUÍMICA NA ENGENHARIA QUÍMICA O papel de uma Engenheiro Químico é a elaboração de projetos, instalações, operação de indústrias e desenvolvimento de novos processos, moléculas e materiais. Combinação de princípios das disciplinas básicas como matemática, física, química e biologia para atuar no desenvolvimento de processos na produção de diversos produtos em qualquer escala. Bioquímica na Engenharia Química Bioquímica como ferramenta no entendimento, desenvolvimento e melhoramento de processos de transformação associados a células e a biomoléculas como enzimas. A célula pode ser um reator a serviço da tecnologia! BIOPROCESSOS O processamento de biomateriais a partir de agentes como enzimas e microrganismos exige conhecimentos de bioquímica e de engenharia visando aplicação industrial ENGENHARIA METABÓLICA obtenção de produtos de interesse industrial por modificação de vias metabólicas por engenharia genética ENGENHARIA VERDE desenvolvimento de produtos e processos onde o impacto no ambiente é nulo ou muito pequeno ENGENHARIA DE TECIDOS modelagem do funcionamento de órgão do corpo humano e desenvolvimento de materiais poliméricos biocompatíveis. Desafios futuros Cerveja Etapas Formação do malte Preparação do mosto Adição de leveduras Fermentação alcoólica do mosto Diversos processos bioquímicos envolvidos!! Síntese de enzimas, ação de enzimas, respiração, fermentação. Biocombustíveis Atualmente, 90% das substâncias químicas orgânicas são produzidas a partir do petróleo. Devido as preocupações ambientais e os preços flutuantes, os biocombustíveis têm recebido muita atenção nos últimos tempos como alternativas ao petróleo. Etanol Biobutanol Hidrocarbonetos renováveis→ produzidos a partir da biomassa por processos termoquímicos (pirólise ou liquefação) e bioquímicos (fermentação: açúcares →hidrocarbonetos) gasolina, diesel e jet fuel renováveis Diesel renovável Biodiesel Engenharia metabólica • Melhoramento genético continuado para obtenção de linhagens microbianas para aumentar a produção ou mesmo produzir novas moléculas de interesse • Passo que auxiliará o desenvolvimento de biorrefinarias • Exemplo: técnicas de melhoramento genético continuado para o desenvolvimento de leveduras para fermentação de açúcares C5 provenientes de biomassas lignocelulósicas • A engenharia metabólica permite a inserção de novas vias metabólicas e, consequentemente, novas características em organismos tradicionalmente utilizados na indústria. Engenharia metabólica Engenharia metabólica • Produção de ácidos orgânicos como succínico, málico e fumárico, por microrganismos geneticamente modificados • Acido succínico usado como matéria-prima para precursores plásticos como1,4-butanediol (BDO) monômeros para poliésteres. • Atualmente, o succinato é produzido através de processos petroquímicos. • Uma bactéria produtora de succinato com alto rendimento permitiria a substituição de um produto petrolífero por uma matéria-prima que usa resíduos agrícolas. • A produção de succinato, ácido málico e ácido fumárico a partir de glicose, xilose e outras fontes "verdes" por Escherichia coli fornece uma fonte renovável de fontes químicas de baixo custo. Engenharia metabólica Biorrefinaria A biomassa irá substituir o petróleo nas aplicações industriais Uma biorrefinaria pode produzir produtos múltiplos a partir da biomassa da mesma forma que uma refinaria que refina petróleo bruto em combustíveis e produtos químicos. Os mesmos blocos de construção químicos que atualmente são derivados de petróleo podem ser produzidos a partir da biomassa por meio de métodos químicos, bioquímicos ou conversão termoquímica.
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