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Composição Química da célula • Os compostos celulares são baseados em compostos de carbono • C, H, N e O constituem quase 99% do peso celular • Água = 70% do peso da célula, logo a maioria das reações químicas da célula ocorrem em ambiente aquoso. Composição química Componente Porcentagem do peso total E. Coli Célula de mamífero H2O 70 70 Íons inorgânicos (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl-, etc.) 1 1 Várias substâncias metabólicas 3 3 Proteínas 15 18 RNA 6 1,1 DNA 1 0,25 Fosfolipídeos 2 3 Outros lipídeos - 2 Polissacarídeos 2 2 Volume total da célula 2 × 10-12 cm3 4 × 10-9 cm3 Volume celular relativo 1 2000 Composição química Presença de elementos químicos nos seres vivos e superfície da terra Macromoléculas • As interações entre as macromoléculas em uma célula depende de ligações fracas não-covalentes • Forças de Van Der Waals (distância = 0,35 nm e força = 0,1 Kcal); • Pontes de hidrogênio (distância = 0,3 nm e força = 4 Kcal/mol no vácuo e 1 Kcal/mol na água); • Forças ou ligações hidrofóbicas • Ligações iônicas (distância = 0,25 nm e força = 80 Kcal/mol no vácuo e 3 Kcal/mol na água); Átomo e camadas eletrônicas Ligação covalente e iônica Força de van-der Vaals Representação de uma molécula de água FORÇAS DE VAN DER WAALS OU FORÇAS DE LONDON OU DIPOLO INDUZIDO - DIPOLO INDUZIDO: Ocorre entre moléculas apolares ou entre átomos de gases nobres, quando por um motivo qualquer ocorre uma assimetria na nuvem eletrônica, gerando um dipolo que induz as demais moléculas ou átomos a também formarem dipolos. São de intensidade fraca. Ex.: H2; N2; O2; I2; Br2; CO2; BF3; He; Ne; Ar. FORÇAS DO TIPO DIPOLO PERMANENTE – DIPOLO PERMANENTE: Ocorrem em moléculas polares, de modo que a extremidade negativa do dipolo de uma molécula se aproxime da extremidade positiva do dipolo de outra molécula. São mais fortes que as forças de London; Ex.: HCl; HBr (acido bromídrico); HI ( ácido iodídrico); H2S; PH3 (Hidreto de fósforo). + - + - + - + - + - + - + + - + - + - + - + - + - + +++++ ----- - -- +++++ ----- - -- PONTES DE HIDROGÊNIO: Forças de natureza elétrica do tipo dipolo permanente - dipolo permanente, porém bem mais intensas. O corre quando a molécula é polar e possui H ligado a elemento muito eletronegativo e de pequeno raio (F, O, N), de modo que o hidrogênio de uma molécula estabelece uma ligação com o átomo muito eletronegativo de outra molécula. Ex.: H2O; HF (ácido fluorídrico); NH3. Composição química da célula • Estrutura da molécula da água • Pontes de hidrogênio • Moléculas hidrofílicas e hidrofóbicas • Ligações covalentes • Hidrocarbonetos Ponte de H = 4 Kcal/mol Ligação covalente = 90 Kcal/mol Ligação iônica = 80 Kcal/mol sem H20 e 3 Kcal/mol em H2O Força de van der waals e pontes de H em moléculas orgânicas Água como solvente Ácidos Bases pH Forças hidrofóbicas Ligações iônicas Ligações iônicas em solução • Compostos de carbono e oxigênio • Compostos de carbono e nitrogênio • Fosfatos Molaridade A molaridade é uma medida de concentração de um soluto em uma solução ou de qualquer molécula iônica ou espécie atômica em um dado volume. Um mol é x g de uma substância qualquer, onde x é a massa molecular relativa. Um mol contém 6 x 1023 moléculas dessa substância. Soluções molares têm uma concentração de 1 mol de uma substância em 1 litro de solução. 1 M de glicose possui 180 g/L e 1 mM de glicose possui 180 mg /L. 1º Calcular a massa molar da glicose(C6H12O6) : Massas atômicas ( C -12 , H -1 , O -16) MM C6H12O6 = 6*12 + 12*1 + 6*16 = 180g/mol Principais moléculas orgânicas encontradas nas células • Açúcares; • Lipídios; • Ácidos nucleícos (DNA e RNA); • Proteínas Açúcares • Monossacarídeos= fórmula geral= (CH2O)n, possuem em geral entre três e sete átomos de carbono (trioses, tetroses, pentoses, hexoses e heptoses) Estrutura de um monossacarídeo Monossacarídeos • Aldoses: Monossacaríd eos de função mista poliálcool-aldeido • Cetoses: Monossacaríd eos de função mista poliálcool-cetona • Isômeros (glicose, manose e galactose) = C6H12O6 Ligações a e b • Ligações a e b • Derivados de açúcar • Dissacarídeos • Oligossacarídeos e polissacarídeos • Oligossacarídeos complexos Formação de um dissacarídeo Lipídios • São definidos como sendo moléculas celulares insolúveis em água mas solúveis em solventes orgânicos • Ácidos graxos • Triglicerídeos • Fosfolipídio • Outros lipídios (isoprenóides, esteróides e glicolipídios) • Ácidos graxos comuns • Triglicerídios • Ácidos graxos insaturados (com dupla ligação) • Ácidos graxos saturados (sem dupla ligação) • Grupo carboxila geralmente ligado a outros grupos para formar ésteres ou amidas • Fosfolipídeos os maiores constituintes das membranas celulares Ácido graxo Fosfolipídio • Isoprenóides • Esteróides • Glicolipídeos Ácidos nucléicos • Bases purinas e pirimidinas • Fosfatos, Açúcar pentose (ribose ou desoxiribose) •Nucleotídeo e nucleosídeo •Ligação fosfodiéster • Funções = informação genética (DNA e RNA), energia (ATP), sinalização celular (cAMP) e enzimática (coenzima A). Esquema de um nucleotídeo 5´ e 3´ ATP DNA e RNA • Os genes são constituídos de DNA • Seqüência do DNA codifica os diferentes genes. • As fitas de DNA são anti-paralelas • Replicação do DNA é semi-conservativa • A seqüência de nt de um gene determina a seqüência de AAs de uma proteína • Transcrição (introns e exons), código genético • Tradução (tRNA e Ribossomos) Os genes são constituídos de DNA A seqüência de nucleotídeos de um gene determina a seqüência de AAs de uma proteína Transcrição e tradução Transcrição e tradução Seqüência do DNA codifica os diferentes genes Porção do gene da b-globina humana Introns e exons As fitas de DNA são anti-paralelas Replicação do DNA é semi- conservativa RNA Tradução (tRNA e Ribossomos) tRNA e código genético Código genético T C A G T TTT Fenilalanina (F) TCT Serina (S) TAT Tirosina (Y) TGT Cisteína (C) T TTC TCC TAC TGC C TTA Leucina (L) TCA TAA Códon de parada TGA Códon de parada A TTG TCG TAG TGG Triptofano (W) G C CTT Leucina (L) CCT Prolina (P) CAT Histidina (H) CGT Arginina (A) T CTC CCC CAC CGC C CTA CCA CAA Glutamina (Q) CGA A CTG CCG CAG CGG G A ATT Isoleucina (I) ACT Treonin a (T) AAT Asparagina (N) AGT Serina (S) T ATC ACC AAC AGC C ATA ACA AAA Lisina (K) AGA Arginina (A) A ATG Metionina (M) ACG AAG AGG G G GTT Valina (V) GCT Alanina (A) GAT Ácido Aspártico (D) GGT Glicina (G) T GTC GCC GAC GGC C GTA GCA GAA Ácido Glutâmico (E) GGA A GTG GCG GAG GGG G tRNA Ribossomos O genoma humano haplóide possui mais de 3 bilhões de bases nucleotídicas. Sequenciado nos anos 2000 a um custo de 2 bilhões de dólares e hoje sai menos de 1000 dólares o genoma. O número total de genes no genoma humano é estimado entre 30.000 – 40.000. Nematóides possuem 19.098 genes, moscas das frutas 13.602 e leveduras 6.034. Quase todas as bases nucleotídicas (99.9%) são exatamente as mesmsas em todas as pessoas.Fatos sobre o genoma humano A maioria do DNA no genoma humano (>97%) não possui função conhecida A função de mais de 50% das proteínas preditas no genoma não têm função conhecida. O cromosssomo 1 possui a maior quantidade de genes (2,968) e o cromossomo Y a menor (231). O DNA humano é 98% idêntico ao DNA do chimpanzé. Existem 100 trillhões de células no corpo humano . Se as fitas de DNA de uma célula forem desenroladas e ligadas, o seu comprimento seria de 1,8 metros. Se todas as fitas de DNA dos 100 trilhões de células de seu corpo fossem desenroladas e ligadas, elas poderíam esticar até o sol e voltar a terra mais de 600 vezes. Se uma pessoa recitasse as bases do genoma humano a uma velocidade de 1 base por segundo, vinte e quatro horas por dia, ele levaria um século para terminar. Fonte: http://www.ebi.ac.uk/2can/disease/genes12.html Espécie Familia(número de espécies estimados no Brasil) Genoma ORF G+C Hospedeiro 1 DisaGV Crambidae (2.100) 98,407 121 34.9 Diatraea saccharalis 2 DijuMNPV Nymphalidae (800) 122,049 153 50.8 Dione juno juno 3 ErelGV Sphingidae (180) 102,759 130 38.7 Erinnyis ello ello 4 LoobMNPV Saturniidae (380) 120,022 136 35.7 Lonomia obliqua 5 MospGV Noctuidae (7.090) 134,272 145 38.2 Mocis latipes 6 PeluSNPV Sphingidae 132,831 145 39.5 Perigonia lusca ilus 7 RanuNPV Noctuidae 128,582 130 37.9 Rachiplusia nu 8 SpfrGV Noctuidae 139,676 159 46.3 Spodoptera frugiperda 9 UrprNPV Hesperiidae (1.165) 105,678 123 34.7 Urbanus proteus 10 BmNPV Bombycidae (130) 126,861 143 40.4 Bombyx mori 11 HzSNPV Noctuidae 129,694 146 39.1 Helicoverpa armigera 12 AgMNPV Noctuidae 130,134 152 44.5 Alabama argilacea 13 ChinSNPV Noctuidae 138,478 150 39.1 Anagrapha falcifera 14 CoveMNPV Canbridae (2.100) 125,770 138 42,9 Condylorrhiza vestigialis Novas espécies: 10 Isolados: 4Alphabaculovirus: 10 Betabaculovirus: 4 Source: Wikimedia Commons Condylorrhiza vestigialis Erinnyis ello ello Perigonia lusca ilus Dione juno juno Diatraea saccharalis Lonomia obliqua Mocis latipes Rachiplusia nu Spodoptera frugiperda Urbanus proteus Bombyx mori Helicoverpa armigera Pseudoplusia includens NPV H. zea SNPV Bombyx mori Iflavirus