MarchesiSIGM2016 Segmentosdehomozigoseesuarelaocomaendogamiaemumapopulaodefrangosdecorte

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Segmentos	de	homozigose	e	sua	relação	com	a
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corte
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Marcos	Eli	Buzanskas
Universidade	Federal	da	Paraíba,	Areia,	Brazil
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Mauricio	Cantão
Brazilian	Agricultural	Research	Corporation	(E…
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Segmentos de homozigose e sua relação com a endogamia em uma população de 
frangos de corte 
Jorge Augusto Petroli Marchesi124, Marcos Eli Buzanskas24, Maurício Egídio Cantão3, Jane de Oliveira 
Peixoto3, Mônica Corrêa Ledur3, Danísio Prado Munari2 
 
Segmentos do genoma que contêm genótipos homozigotos, conhecidos como “runs of homozygosity” 
(ROH), podem ser utilizados para inferir sobre possíveis regiões herdadas a partir de um ancestral comum, 
e estimar o coeficiente de endogamia genômico de uma população. Os objetivos deste trabalho foram estimar, 
a partir de painel de genótipos de alta densidade, a quantidade e tamanho de ROH e o coeficiente de 
endogamia (FROH) de uma linha paterna de frangos de corte. Foram utilizadas 1.433 aves provenientes da 
expansão de uma linha paterna de frangos de corte desenvolvida pela Embrapa Suínos e Aves genotipadas 
com o painel 600K Affymetrix® Axiom® HD (Affymetrix®). No controle de qualidade foram excluídos 
70.552 SNPs com taxa de leitura abaixo de 98%, 13.749 polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) com 
base nos desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg (p ≤ 1x10-6), e 121.199 SNPs cuja frequência do alelo 
menor foi inferior a 2%, permanecendo o total de 355.680 SNPs de cromossomos autossômicos. O controle 
de qualidade de amostras considerou a exclusão de indivíduos que apresentaram taxa de leitura de SNPs 
inferiores a 90%, resultando em 1.408 animais. Os ROH foram identificados utilizando o programa Plink 
v.1.9, em que foram considerados segmentos de no mínimo 100 SNPs com comprimento mínimo de 1000 
Kb, sendo permitida a presença de um SNP heterozigoto e a ausência de um SNP em uma janela de 100 
SNPs. Para o cálculo do FROH, a quantidade de ROH identificada por indivíduo foi multiplicada pelo tamanho 
médio dos segmentos de ROH e dividido pelo tamanho total do genoma da galinha (Gallus_gallus 4.0). Neste 
estudo, 1.279 indivíduos apresentaram ROH, com número médio e máximo de ROH igual a 7 e 30, 
respectivamente. Já o tamanho médio e máximo dos ROH foi de 5,76 Mb e 59,24 Mb, respectivamente. O 
número total de segmentos genômicos em homozigose observados neste estudo foi de 9.414, dos quais 5.462 
estão presentes em mais de 1% da população. Apenas uma região, a do microcromossomo GGA15, com 
comprimento de 2,81 Mb (entre 2.214.888 e 5.022.515 pb), apresentou ROH que ocorreu em 52,41% da 
população (738 aves). Esta região abriga 2 miRNAS, um miscRNA e 40 genes codificadores de proteínas. 
Nesta região, 10 genes apresentam função relacionada com a formação e maturação de células germinativas. 
O FROH médio nesta população foi de 0,05593, variando de 0 a 0,1617. Assim, a presença de grande 
quantidade de ROH de tamanho pequeno pode ser atribuída ao baixo coeficiente de endogamia estimado por 
FROH, logo os acasalamentos na formação desta linhagem ocorreram de forma controlada. A existência de 
pequenos segmentos de ROH com grande quantidade de genes relacionados à reprodução indica uma 
possível pressão seletiva sobre esta característica em um passado distante. 
 
Apoio: EMBRAPA e CAPES. 
Área de concentração: Melhoramento Animal. 
1Mestrando em Genética e Melhoramento Animal, e-mail: jorgea_petroli@hotmail.com 
2UNESP – Universidade Estadual Paulista, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Jaboticabal, SP 
3Embrapa Suínos e Aves, Concórdia, SC 
4Bolsa CAPES/EMBRAPA 
 
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