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Universidade Federal de Pelotas Instituto de Química e Geociências Departamento de Bioquímica 04 BÁSICA EM IMAGENS - um guia para a sala de aula Aminoácidos, peptídeos e proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4 Hierarquia estrutural na organização molecular das células Nível 4: Célula e organelas Nível 3: Complexos Supramoleculares Nível 2: Macromoléculas Nível 1: Unidades Monoméricas Proteínas Celulose Glicídios Parede Celular Cromossomos Membrana Plasmática Aminoácidos DNA Nucleotídeos Lipídios ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula 4. Proteínas • Conceito encefalina canal de K insulina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Importância e diversidade funcional substâncias + abundantes nos seres vivossubstâncias + abundantes nos seres vivos n Expressão gênica (papel central): a informação contida no DNA é expressa através das proteínas; o Estrutural (plástica): matéria-prima para a construção e reparo das biológica”) estruturas celulares; p Dinâmica (“atividade : catálise, transporte, regulação, ncia as proteínas de outros componentes celulares (glicídios, lipídios) considerados substâncias inertes. reserva, defesa, etc. * difere natureza protéicanatureza protéica≈70% da MS da célula≈70% da MS da célula Proteína G © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas © C o p y r i g h t 2 0 0 8 – C h a v e s & M e l l o - F a r i a s – I S B N 9 7 8 - 8 5 - 7 1 9 2 - 3 8 7 - 4 B Á S I C A E M I M A G E N S – u m g u i a p a r a a s a l a d e a u l a Proteína n Síntese de mRNA no núcleo o Movimento do mRNA para o citoplasma p Síntese de proteínas CITOPLASMA Polipeptídeo Aminoácidos Ribossomo Dogma Central da Biologia Molecular • I m p o r t â n c i a e d i v e r s i d a d e f u n c i o n a l proteínas • Importância e diversidade funcional Dogma central da Biologia Molecular DNA RNA proteína Transcrição Tradução Replicação ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Importância e diversidade funcional Transcrição Tradução Proteína Fita molde © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Exemplos e etimologia da palavra Insulina Glutamina sintetase Hemoglobina Citocromo c Ribonuclease Lisozima Mioglobina Imunoglobulina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas Composição em AA de três proteínas Nº de AA por molécula de proteína AA Quimotripsinogênio (bovino) Lisozima (clara de ovo) Citocromo c (humano) Glicina 23 12 13 Alanina 22 12 6 Valina 23 6 3 Leucina 19 8 6 Isoleucina 10 6 8 Metionina 2 2 3 Prolina 9 2 4 Fenilalanina 6 3 3 Triptofano 8 6 1 Serina 28 10 2 Treonina 23 7 7 Asparagina 15 13 5 Glutamina 10 3 2 Tirosina 4 3 5 Cisteína 10 8 2 Lisina 14 6 18 Arginina 4 11 2 Histidina 2 1 3 Aspartato 8 8 3 Glutamato 5 2 8 © C o p y r i g h t 2 0 0 8 – C h a v e s & M e l l o - F a r i a s – I S B N 9 7 8 - 8 5 - 7 1 9 2 - 3 8 7 - 4 B Á S I C A E M I M A G E N S – u m g u i a p a r a a s a l a d e a u l a • C o m p o s i ç ã o proteínas • Composição Composição de algumas proteínas Proteínas Números de aminoácidos Número de cadeias polipetídicas Insulina (bovina) 51 2 Lisozima (clara do ovo) 129 1 Mioglobina (equina) 153 1 Hemoglobina (humana) 574 4 Aspartato transcarbamoilase (E. coli) 2700 12 RNA polimerase (E. coli) 4100 5 Apoliproteína B (Humana) 4536 1 © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula 4.1. Classificação proteínas a) Quanto à forma • Globulares • Fibrosas • Monoméricas • Oligoméricas • Multiméricas b) Quanto ao n° de cadeias polipeptídicas mioglobina • Simples • Conjugadas c) Quanto à composição química ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas c) Quanto à composição química – proteínas conjugadas ClasseClasse AA + ...AA + ... ExemploExemplo Glicoproteínas Glicídeos proteínas da MP, proteínas secretadas Lipoproteínas Lipídeos Ácidos graxos Colesterol Triacilgliceróis Fosfolipídios lipoproteínas de transporte de lipídeos no sangue Nucleoproteínas Ácidos nucléicos ribossomos, nucleossomos, spliceossomos Metaloproteínas Fe, Cu, Mn, Mo, Zn ceruloplasminas, prots FS e RSP Fosfoproteínas Fósforo caseína Hemeproteínas Heme hemoglobina, mioglobina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Nucleoproteínas Nucleossomo • DNA • Histonas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Hemeproteínas HEME • Complexo orgânico • Anel porfirina + Fe+2 © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Classificação - exemplos Colágeno Mioglobina Glicoproteína Insulina Actina Hemoglobina ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Classificação - exemplos Caseína ATP sintase Albumina ImunoglobulinaLisozima ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula 4.2. Conformação espacial conformação espacial que permite a sua funcionalidade Proteína seqüência de AA conformação espacial função descrita em níveis estruturais de complexidade crescente didaticamente → 4 níveis estruturais proteínas Proteína nativa © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Conformação espacial – Cristais de proteínas d) Azidomete mio-hemeritatina (verme marinho Siphonosoma funafuti) e) Hemoglobina de lampréia f) Bacterioclorofila uma proteína (Prosthecochloris aestuarii) a) Azurita (Pseudomonas aeruginosa) b) Flavodoxina (Desulfovibrio vulgaris) c) Rubredoxina (Clostridium pasterianum) © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – Cristais de proteínas proteínas Representação de preenchimento estereoespacial de um segmento de alfa-hélice de mioglobina de esperma de baleia, determinado por cristalografia de raios-X. Fotografia de difração de raio-X de um cristal de mioglobina de esperma de baleia. ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aulaproteínas • Conformação espacial – estrutura 1ária determinada geneticamente (DNA) determinada geneticamente (DNA) determina a função da proteína (níveis estruturais superiores) determina a função da proteína (níveis estruturais superiores) Ligações: peptídicas *posição das cys Ligações: peptídicas *posição das cys ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínasproteínas • Conformação espacial – estrutura 1ária RNA DNA Thr Pro Glu Lys Thr Lys Pro Glu Glu Val A mudança em uma única base leva a uma doença chamada anemia falciforme RNA DNA mutado Hemácia normalsubstituição Hemácia alterada determinada geneticamente (DNA) determinada geneticamente (DNA) determina a função da proteína (níveis estruturais superiores) determina a função da proteína (níveis estruturais superiores) Ligações: peptídicas *posição das cys Ligações: peptídicas *posição das cys ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 1ária proteínas Transcrição Tradução Proteína Fita molde © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Cadeia lateral Cα pontes de H entre átomos que participam das ligações peptídicas estabilizam a estrutura helicoidal paralelas ao eixo da cadeia α - hélices: enrolamento da cadeia ao redor de um eixo α - hélicesα - hélices proteínas • Conformação espacial – estrutura 2ária cadeias laterais (R) projetadas para fora da hélice ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas α - hélicesα - hélices Estrutura de uma cadeia polipeptídica em α-hélice, estabilizada por pontes de H intra-cadeia ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula α - hélicesα - hélices Representação de preenchimento estereoespacial de um segmento de alfa-hélice de mioglobina de esperma de baleia, determinado por cristalografia de raios-X. • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas Proteina-Gα - hélicesα - hélices ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas folhas β pregueadas: interação lateral de segmentos - da mesma cadeia - de cadeias diferentes pontes de H entre átomos que participam das ligações peptídicas perpendiculares ao eixo da cadeia Folhas β−pregueadasFolhas β−pregueadas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Folhas β−pregueadasFolhas β−pregueadas Organização de duas cadeias polipeptídicas em folha β- pregueada, estabilizadas por pontes de H inter-cadeias • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas Disposição antiparalela das cadeias polipeptídicas Vista superior Vista lateral Folhas β−pregueadasFolhas β−pregueadas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Disposição paralela das cadeias polipeptídicas Vista superior Vista lateral • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas Folhas β−pregueadasFolhas β−pregueadas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 2ária proteínas Folhas β−pregueadasFolhas β−pregueadas IgG ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Mioglobina • pontes dissulfeto (S-S) • pontes de H • forças de Van der Waals • ligações iônicas • interações hidrofóbicas • pontes dissulfeto (S-S) • pontes de H • forças de Van der Waals • ligações iônicas • interações hidrofóbicas • Conformação espacial – estrutura 3ária proteínas A maioria das proteínas estrutura 3ária globular Resíduos hidrofóbicos: interior hidrofílicos: exterior A maioria das proteínas estrutura 3ária globular Resíduos hidrofóbicos: interior hidrofílicos: exterior ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 3ária proteínas Interações que mantêm a estrutura terciária de proteínas (1) hidrofóbica (2) ponte de H (3) eletrostática © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 3ária proteínas Interações que mantêm a estrutura terciária de proteínas ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 3ária proteínas Ornitina descarboxilase Ovoalbumina ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 3ária proteínas Estrutura de raio-X da enzima triose fosfato isomerase (TIM), com 247 resíduos de aminoácidos, isolada de músculo de frango © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – estrutura 4ária proteínas • pontes de H • forças de Van der Waals • ligações iônicas • interações hidrofóbicas • pontes de H • forças de Van der Waals • ligações iônicas • interações hidrofóbicas Associação de 2 ou + cadeias polipeptídicasAssociação de 2 ou + cadeias polipeptídicas Funcionalidade conjunto de todas as subunidadesFuncionalidade conjunto de todas as subunidades ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – resumo proteínas Hemoglobina estrutura 1ária estrutura 2ária estrutura 3ária estrutura 4ária © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Conformação espacial – resumo proteínas estrutura 1ária estrutura 2ária estrutura 3ária estrutura 4ária © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Folha β AA (monômero) Cadeias laterais dos AA são diferentes em cada um dos 20 AA Cadeia polipeptídica Estrutura 1ária Estrutura 4ária Estrutura 3ária Estrutura 2ária α hélice Ponte de H Ligação S-S • Conformação espacial – resumo proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Ligações iônicas ou eletrostáticas: são o resultado da força de atração entre grupos ionizados de carga contrária; • Ligações ou pontes de hidrogênio: formadas quando um próton (H+) é compartilhado entre dois átomos eletronegativos muito próximos. O H+ pode ser partilhado entre átomos de hidrogênio ou de oxigênio próximos entre si. São essenciais para o pareamento específico entre as bases de ácidos nucléicos, proporcionandoa força que mantém unidas as duas cadeias do DNA e permite a codificação específica do DNA em RNA. • Interações hidrofóbicas: correspondem à associação de grupos não polares, que a fazem de modo a excluir o contato com a água. Nas proteínas globulares, as cadeias laterais dos aminoácidos mais hidrofóbicos tendem a agregar-se no interior da molécula, e os grupos hidrofílicos sobressaem na superfície das mesmas. Os resíduos hidrofóbicos repelem as moléculas de água que envolve a proteína e determinam que a estrutura globular torne-se mais compacta. • Interações de Van der Waals: só se produzem quando os átomos estão mais próximos. Esta proximidade de duas moléculas pode induzir flutuações de carga, produzindo atrações mútuas à curta distância. A diferença fundamental entre ligações covalentes e não-covalentes está na quantidade de energia necessária para romper esta ligação. Em geral as ligações são rompidas pela intervenção de enzimas, enquanto as não-covalentes se dissociam com facilidade através de forças físico-químicas. • Ligações não covalentes de ocorrência em proteínas Fonte: www.ciagri.usp © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula 4.3. Funções e exemplos Estrutural Queratina Colágeno (tec. conjuntivo fibroso) Fibroína Elastina (tec. conjuntivo elástico) Reguladora Insulina Hormônio de crescimento Repressores Defesa Anticorpos Fibrinogênio , Trombina Toxina botulínica Veneno de serpentes, apitoxina Ricina (mamona) Transporte Hemoglobina Albumina do soro Mioglobina β1-lipoproteína Contrátil (movimento) Actina Miosina Tubulina Dineína Reserva (nutritivas) Gliadina (trigo) Ovoalbumina (ovo) Caseína (leite) Ferritina enzimática (catálise) Ribonuclease, Tripsina proteínas © C o p y r i g h t 2 0 0 8 – C h a v e s & M e l l o - F a r i a s – I S B N 9 7 8 - 8 5 - 7 1 9 2 - 3 8 7 - 4 B Á S I C A E M I M A G E N S – u m g u i a p a r a a s a l a d e a u l a • Função estrutural A tripla hélice de colágeno (tropocolágeno) Micrografia eletrônica de fibrilas de colágeno da pele Seqüência de aminoácidos da porção C-terminal da região tríplice hélice da cadeia de colágeno bovino α1(I). proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Colágeno Colágeno • Cadeia simples • Tropocolágeno • Glicinas centrais • Função estrutural proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função estrutural - colágeno Cadeia simples Tropocolágeno Glicinas centrais © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função estrutural - α-Queratina A organização microscópica do fio de cabelo cabelos, lã, chiffres, unhas, cascos, epiderme ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula α-Queratina α hélice Enrolamento de 2 α hélices Protofilamento Filamento (4 protofibrilas) Secção transversal de um fio de cabelo α hélice protofilamento filamento intermediário filamento enrolamento de 2 α hélices Mamíferos: cabelos, lã, chiffres, unhas, cascos, epiderme * β-queratina: aves e répteis → penas, escamas proteínas • Função estrutural - queratina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula α-hélices adjacentes interligações de cistina (dois resíduos de cisteína ligados pelos grupos sulfidrílicos) entre α-hélices adjacentes da α-queratina. Nas queratinas “duras” como aquelas do casco da tartaruga, as interligações por resíduos de cistina são muito numerosas. proteínas • Função estrutural α-Queratina Pontes dissulfeto entre α-hélices © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Pontes dissulfeto entre α-hélices proteínas • Função estrutural α-Queratina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Cadeia lateral de Ala Cadeia lateral de Gly proteínas • Função estrutural © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Fibroína Ala (-CH3) Gly (-H) Cadeia lateral Ala ou Ser Gly Cadeia lateral proteínas • Função estrutural Fibroína © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula • Função estrutural proteínas Glicoproteína © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Calcitonina (metabolismo do Ca++) Hormônio do crescimento Glucagon Insulina • Função reguladora proteínas Hormônios © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula IgG • Função de defesa proteínas Imunoglobulinas (anticorpos) © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função de defesa Trombina Mamona Peptídeos e proteínas da Apitoxina Ricina © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Heme Hemoglobina Hemácia As hemácias contêm centenas de moléculas de hemoglobina que transportam O2 O O2 se fixa ao heme na hemoglobina Mioglobina Hys • Função de transporte proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Complexos da Cadeia Transportadora de Elétrons • Função de transporte proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função de transporte Apolipoproteínas Colesterol Fosfolipídios TAGs e ésteres do colesterol © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Miosina Tubulina Dineína Filamento de Actina • Função contrátil proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Caseína Ovoalbumina Gliadina Glutenina • Função de reserva proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função enzimática - catálise Complexo Enzima- Substrato o Substrato é convertido nos produtos Enzima (sacarase) Substrato (sacarose) nSubstrato se liga à enzima qEnzima disponível para a molécula de substrato pProdutos são liberados Glicose Frutose Enzimas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • Função enzimática - catálise Glutamina sintetase de Salmonella typhimurium © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula 4.4. Propriedades proteínas • especificidade • solubilidade • desnaturação • ponto isoelétrico • tamponamento Proteína G © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a salade aula Estrutura da Insulina – Cadeias aminoacídicas Idêntico para vertebrados Idêntico – bov., suínos e hum. Mutações hum.A3B10 B24B25 Diferente p/ bov. A8 A10; bov e suíno B30 proteínas • especificidade © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • especificidade Seqüências de aminoácidos dos citocromos c de 38 espécies © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Seqüências de aminoácidos dos citocromos c de 38 espécies proteínas • especificidade © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Árvore filogenética do citocromo c proteínas • especificidade © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • solubilidade © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • solubilidade • Cadeia simples • Tropocolágeno • Glicinas centrais © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • desnaturação lisozima • Proteína nativa © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Estado nativo, cataliticamente ativo Adição de uréia e mercaptoetanol Remoção de uréia e mercaptoetanol Estado nativo, cataliticamente ativo. Pontes dissulfeto corretamente refeitas Estado desenovelado, inativo. Pontes dissulfeto reduzidas formando resíduos de Cys proteínas • desnaturação © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • desnaturação © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula Estado nativo, cataliticamente ativo Adição de uréia e mercaptoetanol Remoção de uréia e mercaptoetanol Estado nativo, cataliticamente ativo. Pontes dissulfeto corretamente refeitas Estado desenovelado, inativo. Pontes dissulfeto reduzidas formando resíduos de Cys proteínas • desnaturação © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • ponto isoelétrico Carga elétrica total Σ cargas dos R dos AAΣ cargas dos R dos AA PKa PH do meio PKa PH do meio pI n° cargas + = n° cargas – molécula e- neutra n° cargas + = n° cargas – molécula e- neutra Proteínas não pode ser calculado pelos pKas dos AA ↑ n° AA localização não pode ser calculado pelos pKas dos AA ↑ n° AA localização determinado experimentalmente determinado experimentalmente pH no qual a molécula não migra qdo. Submetida a um campo e- pH no qual a molécula não migra qdo. Submetida a um campo e- pI's característicospI's característicos refletem proporção AA ác. / AA bas.refletem proporção AA ác. / AA bas. © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula a) amostras diferentes são colocadas nos poços ou depressões no topo do gel de poliacrilamida. As proteínas movem-se para o interior do gel quando um campo elétrico é aplicado. b) as proteínas podem ser visualizadas depois da eletroforese pelo tratamento do gel com um corante. Cada banda no gel representa uma proteína diferente (ou uma subunidade protéica). Sentido da migração Amostra Eletroforese • ponto isoelétrico proteínas © Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula proteínas • ponto isoelétrico Ponto isoelétrico (pI) de algumas proteínas e sua composição em AA ácidos e básicos AA (%) Ácidos Básicos Proteinas pI Asp Glu Arg His Lys Pepsina 1,0 16,6 11,3 1,0 0,5 0,4 15 Albumina 4,8 10,4 17,4 6,2 3,5 12,3 1,3 Mioglobina 7,0 4,7 8,3 1,9 7,5 12,8 0,6 Citocromo c 10,6 3,6 5,9 2,2 2,5 15,2 0,5 Ác / Bas ©Copyright 2008 – Chaves & Mello-Farias – ISBN 978-85-7192-387-4BÁSICA EM IMAGENS – um guia para a sala de aula pI = 1,0 R ács. >ria dos protonados COOH poucos desproton. COO- R básicos (poucos) NH3+ pI = 1,0 R ács. >ria dos protonados COOH poucos desproton. COO- R básicos (poucos) NH3+ © C o p y r i g h t 2 0 0 8 – C h a v e s & M e l l o - F a r i a s – I S B N 9 7 8 - 8 5 - 7 1 9 2 - 3 8 7 - 4 B Á S I C A E M I M A G E N S – u m g u i a p a r a a s a l a d e a u l a + AA ácidos (28%) - AA básicos (2%) + AA ácidos (28%) - AA básicos (2%) PepsinaPepsina pI = 10,6 R bás. ½ desprotonados NH2 ½ protonados NH3+ R ácidos COO- pI = 10,6 R bás. ½ desprotonados NH2 ½ protonados NH3+ R ácidos COO- AA básicos (20%) AA ácidos (10%) AA básicos (20%) AA ácidos (10%) Cit cCit c • p o n t o i s o e l é t r i c o pH < pI carga líquida + (COOH e NH3+) pH > pI carga líquida - (COO- e NH2) Proteínas 1 pI 14 ácidas básicas Proteínas 1 pI 14 ácidas básicas pI das proteínas n° R ács. desprotonados COO- = n° R bás. protonados NH3+ pI das proteínas n° R ács. desprotonados COO- = n° R bás. protonados NH3+
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