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Princípios de Genética Quantitativa Capítulo 19 – Fundamentos de genética (Snustad & Simmons) Capítulo 22 - Genética um enfoque conceitual (Pierce) Capítulo 18 - Introdução à Genética (Griffiths) Características descontínuas X características contínuas Características contínuas • Vários genes • Cada gene – pouco efeito no fenótipo Ex: cor dos olhos – melanina, feomelanina Lipofucsina – íris ambar, verde e violeta Genótipo X fenótipo Relação complexa - número de genes Características quantitativas • Grande influência de fatores ambientais Características quantitativas • Grande influência de fatores ambientais mesmo genótipo → diferentes fenótipos Características quantitativas • Grande influência de fatores ambientais mesmo genótipo → diferentes fenótipos Ex: altura de uma planta de 10 cm – 3 genes – 2 alelos cada gene A+, B+, C+ → 1 cm A-, B-, C- → 0 cm Ex: altura de uma planta 10 cm – 3 genes – 2 alelos cada gene A+, B+, C+ → 1 cm A-, B-, C- → 0 cm A+A+, A+A-, A-A- = 3 genótipos 3n = genótipos 33 = 27 genótipos n = no de loci 7 fenótipos Tipos de características quantitativas • Contínuas • Merística – medidas em números inteiros Ex: tamanho de uma ninhada • Com limiar – está presente ou ausente Ex: propensão a alguma doença Herança de características poligênicas Ex: tamanho da corola – flor de tabaco Determinação do número de genes 1/4n no de indivíduos da F2 com fenótipo igual a um dos parentais n= número de loci P: AA X aa F1: Aa F2: ¼ AA, ½ Aa, ¼ aa Aplicação limitada: • linhagens homozigotas e contrastantes • genes com efeitos iguais e aditivos • ausência de ligação gênica Estimativa da variação hereditária - Distribuição de frequência – distribuição normal - Altura em humanos (amostra da população) - 1,52 X 1,88 Análise Quantitativa - Variância: variabilidade de um grupo de medidas Herdabilidade - Variação fenotípica – resultante de fatores genéticos - Variância fenotípica (VP) VP = VG + VE + VGE ↓ - Variância genética (VG) = diferença nos genótipos - Variância ambiental (VE) = toda variação que não é herdada - Variância genético-ambiental (VGE) = efeito do gene depende do ambiente Herdabilidade - Componentes da variância genética (VG) ↓ - Variância genética aditiva (VA) - efeito aditivo dos alelos A1 = 2g; A2 = 4g A1A1 = 4g A1A2 = 6g A2A2 = 8g - Variância de dominância genética (VD) - efeito de um alelo depende do outro alelo A1A1 = 10g A1A2 = 10g A2A2 = 50g - Variância de interação gênica (VI) – loci diferentes podem interagir (epistasia) VG = VA + VD + VI Tipos de Herdabilidade Herdabilidade em sentido amplo (H2) - Proporção da variância fenotípica que é devido à variância genética H2 = VG / VP ↓ Variável de 0 a 1 0 = variância fenotípica não é resultado de diferenças no genótipo 1 = toda a variância fenotípica é resultado de diferenças no genótipo Tipos de Herdabilidade Herdabilidade em sentido restrito (h2) - Proporção da variância fenotípica que que resulta da variância genética aditiva - Determina a semelhança entre genitores e prole h2 = VA / VP Cálculo da Herdabilidade • Eliminar um ou mais componentes da variância - Eliminar a variância ambiental VE=0 VGE=0 VP = VG - Obter indivíduos geneticamente idênticos VG=0 VGE=0 VP = VE Exemplo: padrão de manchas em porquinhos da índia População variável: VP = 573 População endocruzada: VP = 340 • Nesse caso VP=VE VG= VP-VE → VG = 573- 340 = 233 H2= VG/VP → 0,41 Cálculo da Herdabilidade • Comparar os fenótipos de genitores e prole Cálculo da Herdabilidade • Comparar os fenótipos de genitores e prole Cálculo da Herdabilidade • Estudo da herdabilidade em gêmeos 0,62 Limitações da Herdabilidade - Informação sobre as causas da variação - valores estatísticos para um grupo de indivíduos - Não existe herdabilidade universal para uma característica. Ex: altura humana em países diferentes (diferença nas condições ambientais) - Mesmo quando a herdabilidade é alta – fatores ambientais podem influenciar a expressão da característica. Ex: fome - Não indica a natureza das diferenças populacionais. Ex: altura humana em países diferentes (diferenças nas condições ambientais) Questão A variação fenotípica na produção de leite em um rebanho de gado leiteiro foi analisada, sendo que os seguintes componentes de variância foram obtidos: Variância genética aditiva = 0,4 Variância de dominância genética = 0,1 Variância de interação gênica = 0,2 Variância ambiental = 0,5 Variância de interação genético‐ambiental = 0,0 a. Qual é a herdabilidade de sentido restrito para a produção de leite? b. Qual é a herdabilidade de sentido amplo para a produção de leite? a. Qual é a herdabilidade de sentido restrito para a produção de leite? VP = VG + VE + VGE VP= (0,4 + 0,1 + 0,2) + 0,5 + 0,0 VP= 1,2 h2 = VA/VP h2 = 0,4/1,2 = 0,33 b. Qual é a herdabilidade de sentido amplo para a produção de leite? H2 = VG/VP H2 = 0,7/1,2 = 0,58 Resposta à Seleção • Seleção natural X Seleção artificial Resposta à seleção (R): mudança de uma característica de uma geração para outra ↓ herdabilidade em sentido restrito (h2): semelhança genitores/prole seleção diferencial (S): diferença entre indivíduos selecionados e população original R = h2 x S Resposta à Seleção Limites da Resposta à Seleção - Resposta à seleção atinge um nivelamento ↓ - falta de variação genética - seleção natural Respostas correlatas à Seleção - Correlação fenotípica: dois fenótipos no mesmo indivíduo • Componente ambiental Ex: Umidade afetando o tamanho da planta e quantidade de sementes • Correlação genética: genes que afetam uma característica estão associados – efeito pleotrópico dos genes - correlação positiva ou negativa Respostas correlatas à Seleção Questão Um fazendeiro está criando coelhos. O peso corpóreo médio de sua população de coelhos é de 3kg. O fazendeiro seleciona os 10 maiores coelhos nessa população, cujo peso corpóreo médio é de 4kg, e os entrecruza. Se a herdabilidade em sentido restrito (h2) do peso corpóreo na população de coelhos é de 0.7, qual o peso corpóreo esperado entre a prole de coelhos selecionados? Questão Um fazendeiro está criando coelhos. O peso corpóreo médio de sua população de coelhos é de 3kg. O fazendeiro seleciona os 10 maiores coelhos nessa população, cujo peso corpóreo médio é de 4kg, e os entrecruza. Se a herdabilidade em sentido restrito (h2) do peso corpóreo na população de coelhos é de 0,7; qual o peso corpóreo esperado entre a prole de coelhos selecionados? Seleção diferencial (S) = 4kg – 3kg = 1kg R= h2 x S = 0,7 x 1 = 0,7 Peso após a seleção: 3kg + 0,7 = 3,7 kg Estudos de características quantitativas (QTLs) • QTL – locus de caracteristicas quantitativas • Mapeamento de QTLs. Ex: Estudos do tamanho do fruto em tomates - Cruzamento de duas espécies com frutos de tamanho muito distinto - Caracterização dos alelos de cada espécie com base no padrão de enzimas de restrição (RLFP) - Caracterização dos alelos da F2 - Relação dos alelos com o aumento de peso do fruto - Mapeamento dos QTLs nos cromossomos Estudos de características quantitativas (QTLs) Localização dos genes Estudos de associação do genoma inteiro das doenças humanas • Chips gênicos – detecção de polimorfimos de nucleotídeo único (SNP) • Rastreamentode mais de um milhão de SNPs • Verificação da frequência de SNPs em pacientes (casos) e em não portadores da doença (controle)
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