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03/03/2017 1 Profa Dra Ilana L. B. C. Camargo Ciências Físicas e Biomoleculares IFSC - USP Microbiologia e Biotecnologia Industrial FFI 0740 ilanacamargo@ifsc.usp.br www.ifsc.usp.br/~ilanacamargo 1 – Descobertas e evolução 2 – Procarioto x Eucarioto 3- Crescimento dos microrganismos 4 – Microbiologia Industrial 5 – Biotecnologia 6- Disciplina Microbiologia e Biotecnologia Industrial FFI 0740 03/03/2017 2 1. Descobertas e evolução Microbiologia 1665 - Robert Hooke – Microscópio simples – Células - Início da Teoria Celular 1673 – 1723 – Antoni van Leeuwenhoek Microrganismos vivos - Cartas para Sociedade Real de Londres – Animáculos Origem da Matéria morta – Teoria da Geração Espontânea Larvas de Moscas, insetos – corpos em decomposição (!) Origem de células vivas preexistentes - Teoria da Biogênese 1861 – Louis Pasteur – microrganismos presentes no ar!! Na matéria não viva: sólidos, líquidos, ar. Vida microbiana é destruída pelo calor!! 03/03/2017 3 03/03/2017 4 1929 – Alexander Fleming e a penicilina Penicillium Penicillium x Staphylococcus 15 de Fevereiro de 2001 2001 – Primeiro genoma humano 16 de Fevereiro de 2001 J Craig Venter et al, 2001International Human Genome Sequencing Consortium et al., 2001 03/03/2017 5 Outubro de 2007 Dezembro de 2007 Watson & Crick – 1953 Estrutura do DNA Wheeler et al. (2008) The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequencing. Nature 452, 872-876 (17 April 2008) “James Watson - primeiro genoma individual sequencia do por menos de US$ 1 milhão” 03/03/2017 6 https://www.genome.gov/images/content/costpergenome2015_4.jpg the cost of sequencing a human-sized genome 2. Procarioto x Eucarioto 03/03/2017 7 Origens Procariotos 1 2 3 4 5 6 7 10 8 9 03/03/2017 8 3 4 1 1 2 2 6 7 8910 5 Composição da parede celular das bactérias Curva de crescimento 03/03/2017 9 Procariotos - bactéria 1 Cromossomo DNA de dupla fita, circular, grande E. coli – 1,3 m de comprimento - 4,2 x 103 kb Mycoplasma – 750 kb Exceção: Brucella abortus – 2 cromossomos diferentes http://www.sciencebuddies.org/mentoring/plugin_bac_diversity_bacteria_and_dna.jpg Replicação de DNA bacteriano Plasmídeos – elementos de DNA móveis que não são essenciais para a vida do microrganismo, mas que traz vantagens Procariotos - bactéria Plasmídeos de 70 kb – grandes 3.5 kb - pequenos enovelado 03/03/2017 10 - Genes de virulência ou de resistência às drogas, - Origem de replicação para produzir cópias que passam para células filhas na divisão celular ou para outra célula através da conjugação, - Integrativos que se inserem no cromossomo bacteriano ou não Conjugação Plasmídeos Resistência aos antimicrobianos 03/03/2017 11 Eucariotos Fungos Animais Plantas Fungos filamentosos e leveduras Eucariotos – Núcleo, Ribossomo 80S, mitocôndria Parede celular complexa: quitina, manana, glucano Podem ser: -Filamentosos (hifas) – septadas - Não-septadas - Leveduriformes - unicelulares Fungos Dimórficos 03/03/2017 12 Estruturas Macroconídios Fungos Dimórficos Blastomyces dermatitidis 03/03/2017 13 - Possuem mais de um cromossomo. - Cada cromossomo possui um número característico de genes. A quantidade de DNA chega a ser 4 a 100 vezes maior que a quantidade de DNA presente em E. coli, dependendo do organismo. Eucariotos • Célula animal tem DNA nuclear e DNA mitocondrial • Célula vegetal tem DNA nuclear, DNA do cloroplasto e DNA mitocondrial Eucarioto: homem - 46 cromossomos Grande – 1,8m - 6 x 106 Kb Cromossomo mitocondrial Cromossomo nuclear 03/03/2017 14 Fluxo da informação genética em eucariotos e procariotos Ilana Camargo •Cromossomo contém somente uma cópia dos genes. •Poucos genes como os rRNA estão repetidos várias vezes no genoma. •Em geral, quase todos os genes são precisamente colineares com a sequência de aminoácidos o qual ele codifica (há uma exata equivalência entre a sequência de nucleotídeos do gene e a sequência de aminoácidos da proteína). Procariotos - bactéria 03/03/2017 15 Transcrição e tradução em bactérias 5´3´ http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/M/Miller_Hamkalo.html http://www.cbs.dtu.dk/staff/dave/roanoke/fig1348a.jpg Procariotos 03/03/2017 16 Eucariotos Capeamento Poliadenilação Splicing e splicing alternativo em eucariotos Splicing alternativo: Importante mecanismo para produção de diferentes formas de uma proteína (isoformas) 03/03/2017 17 Características Procariotos Eucariotos Estrutura nuclear Molécula de DNA circular sem proteínas Complexo de DNA e proteínas básicas Localização da estrutura nuclear Aglomerado denso de DNA do citoplasma, sem membrana nuclear ou núcleo equivalente Núcleo cercado por membrana nuclear DNA Nucleóide e plasmídeos Nuclear e mitocondrial Citoplasma Sem mitocondria, e sem retículo endoplasmático Mitocôndria e retículo endoplasmático Ribossomo 70S 80S Parede celular Geralmente paredes rígidas com camadas de mureína (exceção: Mycoplasma) Presente somente em fungos: glucana, manana, chitina, chitosana e celulose Reprodução Assexual, por fissão binária Na maioria dos casos sexual, possivelmente assexual Diferenças Procariotos x Eucariotos 3. Crescimento dos microrganismos 03/03/2017 18 Condições físicas para o cultivo dos microrganismos 1. Temperatura; 2. pH; 3. Pressão osmótica; 4. Atmosfera gasosa. Cultivo bem sucedido depende de uma combinação de nutrientes apropriados e de uma condição física apropriada. Condições físicas para o cultivo dos microrganismos Fatores que influenciam a atividade enzimática: 1.Temperatura; A altas temperaturas, as enzimas sofrem desnaturação e perdem suas propriedades catalíticas; A baixas temperaturas, a taxa de reação diminui 2. pH; pH no qual a atividade enzimática é máxima é conhecido como pH ótimo. 3. Concentração do substrato; Dentro de limites, a atividade enzimática aumenta com o aumento da concentração do substrato. 03/03/2017 19 1. Temperatura Todos os processos de crescimento são dependentes de reações químicas que são afetadas pela temperatura. Os microrganismos podem crescer em uma faixa de temperatura muito grande. Esta variação pode maior para alguns microrganismos do que para outros. Ex.: Bacillus subtilis – 8 a 53ºC – variação de 45ºC! Neisseria gonorrhoeae – 30 a 40ºC – variação de 10ºC! Condições físicas para o cultivo dos microrganismos: Temperatura (Tortora, Funke & Case, 2000) 1 e 2 - Encontrados no oceano ou regiões polares; 3- Patogênicos – temperatura corpórea; 4 e 5 - Encontrados em áreas vulcânicas, mistura de fertilizantes e em nascentes quentes. temperatura ótima 03/03/2017 20 2. pH Melhor crescimento dentro de variações pequenas de pH sempre perto da neutralidade, entre pH 6,5 e 7,5. Bactérias acidófilas – tolerantes altos graus de acidez. A alcalinidade também inibe o crescimento microbiano. Condições físicas para o cultivo dos microrganismos: Isto explica como picles e queijos não deterioram, pois contém muitos ácidos produzidos durante a fermentação bacteriana. 3. Pressão osmótica A água traz nutrientes para os microrganismos; Cerca de 80 a 90% do conteúdo celular dos microrganismos é água; Solução de [sal] (hipertônica) – passagem da água de dentro para fora da célula: plasmólise ou diminuição (encolhimento) da membranaplasmática da célula. Inibição do crescimento no momento em que a membrana plasmática se separa da parede celular. Preservação de alimentos!!! Condições físicas para o cultivo dos microrganismos: 03/03/2017 21 http://www.fathom.com/course/21701753/21701753-psa.jpg 4. Atmosfera Gases atmosféricos apropriados para que as bactérias sejam cultivado com sucesso. O oxigênio e o dióxido de carbono - gases principais que afetam o crescimento dos microrganismos: CO2 é utilizado por todas as células para certas reações químicas O2 é requerido por uns e para outros é tóxico. Condições físicas para o cultivo dos microrganismos: 03/03/2017 22 Exigências nutricionais Elementos químicos essenciais: -Carbono; - Enxofre; - Nitrogênio; - Fósforo. - Hidrogênio; -Oxigênio; Elementos químicos como nutrientes Necessários para síntese Funções normais dos componentes celulares Compostos Orgânicos - Glicose Inorgânicos - CO2 03/03/2017 23 Energia Processo de degradação de substratos e conversão em energia utilizável Catabolismo Processo de utilização de energia na síntese de constituintes celulares Anabolismo Metabolismo microbiano Carboidratos Lipídios Proteínas Catabolismo 03/03/2017 24 Catabolismo de Carboidratos - Glicose Carboidrato padrão Produz energia e outros substratos utilizáveis. As bactérias degradam a glicose em etapas distintas para permitir que a energia seja captada em formas aproveitáveis! Têm a capacidade de produzir energia a partir da glicose através dos processos de fermentação ou respiração anaeróbia (ambos na ausência de oxigênio) ou respiração aeróbia, por ordem de eficácia crescente. (Tortora, Funke & Case, 2000) 03/03/2017 25 Os metabólitos são convertidos por uma ou mais vias num intermediário comum universal: O Ácido Pirúvico Carbonos são encaminhados para: • Produção de energia; • Síntese de novos carboidratos; • Aminoácidos; • Lipídios; • Ácido nucléico; (Tortora, Funke & Case, 2000) 03/03/2017 26 Metabolismo da Glicose Ciclo do Ácido Tricarboxílico Principais funções: 1) Principal mecanismo de produção de ATP 2) Atua como via comum final para a oxidação completa de aminoácidos, ácidos graxos e carboidratos; 3) Fornece intermediários-chaves (alfa-cetoglutarato, succinil CoA, oxaloacetato) para a síntese final de aminoácidos, lipídios, purinas e pirimidinas. Cadeia de Transporte de elétrons Respiração aeróbia – O2 é o aceptor final de elétrons Respiração anaeróbia – substância diferente do O2 é o aceptor final de elétrons (Tortora, Funke & Case, 2000) 03/03/2017 27 Respiração anaeróbia Quantidade de ATP gerada varia com o microrganismo e a via; Rendimento mais baixo que respiração aeróbia: ✓ Grande parte do ciclo de Krebs não funciona sob condições anaeróbias; ✓ Nem todos os transportadores participam da cadeia de transporte de elétrons. Crescimento mais lento!! 03/03/2017 28 Fermentação ✓ Libera energia de açúcares ou moléculas orgânicas; ✓ Não requer oxigênio; ✓ Não requer ciclo de Krebs ou cadeia transportadora de elétrons; ✓ Utiliza molécula orgânica como aceptor final de elétrons. Transferência de elétrons (Tortora, Funke & Case, 2000) Produtos finais da Fermentação (Tortora, Funke & Case, 2000) 03/03/2017 29 Dois principais processos: Fermentação do Ácido Lático Streptococcus Lactobacillus Fermentação Alcoólica Algumas bactérias, mas a fermentação alcoólica mais conhecida é a da levedura Saccharomyces Oxidação Redução (Tortora, Funke & Case, 2000) (Tortora, Funke & Case, 2000) 03/03/2017 30 Utilização da Energia - Biossíntese Biossíntese de Compostos Nitrogenados Biossíntese de Carboidratos Biossíntese de lipídios Fixação de nitrogênio - Aminoácidos, Proteínas, Nucleotídeos e ácidos nucléicos Fixação de CO2 -- Triose, pentose, hexoses, nucleotídeos e polissacarídeos Biossíntese de fosfolípides e ácidos graxos de cadeia longa Conhecendo o metabolismo microbiano para saber controlar o crescimento dos microrganismos e aproveitar seus produtos 03/03/2017 31 Utilização da Energia - Biossíntese Pelczar Jr. et al., Microbiologia e aplicações, 2 ed., Makron Books, 1996 4. Microbiologia Industrial 03/03/2017 32 Uso dos microrganismos – Pão e vinho Microbiologia Industrial Microrganismos larga escala Produtos de valor comercial (Produtos farmacêuticos = antibióticos) Importantes transformações químicas (Produção de cerveja e vinho) 03/03/2017 33 Processos microbiológicos industriais correspondem à otimização de reações metabólicas já realizadas naturalmente por microrganismos. Objetivo na Microbiologia Industrial: Superprodução do composto de interesse Microbiologia Industrial Início – fermentação de cerveja e vinho Depois – Síntese de produtos farmacêuticos (Antibióticos) - Aditivos alimentares (aminoácidos) - Enzimas - Compostos químicos (butanol e ácido cítrico) Processos otimizados a partir de reações metabólicas já realizadas naturalmente por microrganismos 03/03/2017 34 5. Biotecnologia 03/03/2017 35 Uma nova era – Biotecnologia Métodos de manipulação genética permitiram a geração de novos produtos microbianos, muitos dos quais não são produzidos naturalmente por microrganismos Manipular DNA e inserí-lo em um microrganismo visando sua expressão! Proteínas de mamíferos Novas vacinas Hormônios Enzimas O que é Biotecnologia?? 1 - Aplicação de processos, sistemas ou organismos biológicos para manufatura e serviços industriais. 5- Ciência dos processos de produção baseados na ação de microrganismos e seus componentes ativos e dos processos de produção envolvendo o uso de células e tecidos de organismos superiores. 2- O uso integrado de bioquímica, microbiologia e ciências da engenharia para adquirir capacidade de aplicações tecnológicas (industriais) de microrganismos, cultura de células e tecidos. 3- Uma tecnologia usando fenômeno biológico para copiar e produzir vários tipos de substâncias úteis. 4- Aplicação de princípios científicos e de engenharia para o processamento de materiais por agentes biológicos para produzir bens e serviços. 03/03/2017 36 Principais objetivos do Biotecnologista: Inovar, desenvolver e otimizar o processo no qual a catálise bioquímica tem um papel fundamental e insubstituível. Biotecnologistas precisam trabalhar em cooperação com experts de outros campos como medicina, nutrição, indústrias químicas e farmacêuticas, proteção ambiental e tecnologia de processamento de resíduos Precisam entender o potencial assim como as limitações de outras áreas!! Para produzir o mesmo produto, porém: em menor tempo em maior quantidade gastando menos Produto da Biotecnologia pode não ser visto como “novo” No entanto, o processo de produção pode ter sido alterado!! Mas por que alterar o processo de algo que eu já consigo produzir? 03/03/2017 37 O que é Biotecnologia?? Enfim, Biotecnologia, em sua essência implica no uso de microrganismos, células de animais e plantas ou enzimas para sintetizar, quebrar ou transformar materiais. Novos processos biotecnológicos irão, em muitos casos, funcionar a baixas temperaturas, consumirão menos energia e se basearão principalmente no uso de substratos mais baratos para a biossíntese Indústrias dependem da biotecnologia para desenvolvimento de novos produtos e vantagem competitiva 6. Disciplina -Escolha dos Microrganismos -Estágios no processo produtivo -Sistemas de expressão-Biorreatores -Processos pós-fermentação - Visitas técnincas Microbiologia e Biotecnologia Industrial
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