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1-Estrutura da Bactéria 1.1-Capsula Substâncias poliméricas extracelulares• Reservatório de água> Para proteção contra dissecação• Aderência• Fator de virulência (Atributos que favorecem o desenvolvimento de patogênese)• 1.2-Parede Celular Gram-positivas• Gram-negativas• A Estrutura da parede celular nos permite dividir as bactérias em dois grandes grupos: -Gram-positivas Possui uma camada grande de peptidoglicano (por possui uma bicamada de lipidio. -Gram-negativas Porque a coloração destas difere? Papel da bioinformática identificar e combater esses fatores. 1.3-Peptido Glicano Esquema da parede celular de uma célula Gram-positiva. É possível observar a camada espessa de peptidoglicano e as ligações feitas pelos ácidos teicóicos na parede ou na membrana plasmática Esquema da parede celular de uma célula Gram-negativa. É possível observar a camada fina (em comparação com as Gram-positivas) de peptidoglicano e a camada externa que forma uma membrana de lipopolissacarídeos. Existem as proteínas que permitem a comunicação (transporte de substâncias) do meio externo com o periplasma. Biologia Geral das Bactérias domingo, 21 de abril de 2013 15:45 Resumo Page 1 Da formato à célula• A penicilina se liga ao sitio ativo da transpeptidase, inibindo sua ação. Não permitindo a formação do peptidoglicano e , consequentemente, matando a bactéria. • 1.4-Membrana Plasmatica -Composição Transporte de solutos• Produção de energia• Acomoda proteinas responsaveis pela biosintese de lipidios• Acomoda proteinas responsaveis pela duplicação do DNA• Secreção• Existe uma resposta do sistema imune ao LPS○ Na parede das Gram-negativas, encontra-se o LPS (Lipossacaridio Bacteriano)• -Funções 1.5- Flagelo Estrutura Basal• Gancho• Filamento• Locomoção• Fator de virulência• Quimiotaxia (Mecanismo de mudança de direção, regulados por kinases intracelulares)• -Função 1.6-Esporos(Gram-positivas) Formada em condição de carência de água ou nutrientes• Geralmente bactérias do solo• Formados a partir de uma divisão assimétrica• Resumo Page 2 Formados a partir de uma divisão assimétrica• 1.7-Ribossomos Responsaveis pela sintese proteica• Livres no citoplasma• 1.8-Fimbria Pequenos filamentos proteicos e mais numerosos que os flagelos• Adesão• Fator de virulência• Importantes para a conjugação• 1.9- Nucleoide Região Nuclear (Ausência de membranas)• DNA Dupla Helice Estabilizado por poliaminas (Similar à Histonas)• Cromossomo Circular• 1.10-Plasmidio Pequenas moléculas de DNA celulares• Duplicação independente da cromossomal, números variados• Geralmente não caracteriza Estruturas• Fatores de resistência (Ponto positivo para as bactérias, pois estas trocam plasmidios entre si)• 2-Transferência Gênica em Bactérias Existem 3 modos: Transferência Horizontal• Cruzamento HFr• Conjugação F• Tudo isso aumenta a varabialidade gênica, consequentemente o aumento de bactérias mais fortes, com fatores de virtulência mais fortes e variados(Resistência a antibioticos) Estamos chegando ao ponto onde a eficacia de antibioticos está sendo ultrapassada pela resistência das bactérias. -Conjugação Bactéria recebe DNA nu do ambiente• -Transformação Transferência de genes bacterianos por intermédio de bacteriofagos• -Transdução O Desafio? Criar alternativas par ao treinamento de antibioticos. Resumo Page 3 Diferenças entrea Archeas, bactéria e eucarioto Pontos Importantes do seminário Evolui para se adaptar ao estresse crônico de energia• -Ecologia e evolução das Archeas Teoria de que ao invés de uma bactérias, a endossimbiose teria se originado de uma archea• -Archeas: Origem do núcleo nas celulas eucarioticas? Formular e testar Integras diversos tipos de dados Desenvolver software para explorar modelos e hipoteses Caracterizar subcircuitos Como é feita a pesquisa?○ Como as moleculas se relacionam com os seres vivos.• -Biologia Sistêmica Facilidade de cultivo• Disponibilidade de ferramentas para transformação• Ex de amostra: Halabactarium salinarum NRC-1 -Rede de Circulação gênica (Modelos Preditivos) -Dinâmica de Transcriptoma -Integração do CHIP-CHIP e estrutura do transcriptoma -RNA não codificantes. Archeas: Desvendando o terceiro dominio da vida através da Bioinformática domingo, 21 de abril de 2013 18:50 Resumo Page 4 São eucariotos, aeróbios e heterotróficos que se nutrem por absorção, parasitando organismos vivos ou atacando materia orgâni ca em decomposição.• Parede Celular formada por Quitina• A síntese do ergosterol é inibido por Fluconazole A presença do ergosterol em membranas celulares de fungos, em conjunção com a sua ausência em membranas celulares de animais, tornam-no um alvo útil para a ação de drogas antifúngicas. Membrana Celular possui Ergosterol• Possui 2 tipos de reprodução, Sexuada e Assexuada• Habitat Natural: Solo (Devido a presença de matéria orgânica), principalmente em cima de vegetais.• O corpo dos fungos é geralmente formado pelo talo ou soma (corpo vegetativo) que é composto por hifas (finos filamentos unice lulares)• 1-Caractéristicas Gerais 2-Patologias produzidas por fungos Alergias• Micetismo (Ingestão de fungos venenosos)○ Micotoxicose (Ingestão de alimentos contaminados com toxina pré-formada)○ Toxicoses:• Micoses: Decorrente da presença e crescimento do fungo no tecido• O homem é naturalmente resistente às infecções fúngicas- Micose Cutânea: Alta Incidência• Micose Sistêmica: Áreas Endêmicas• Micoses Oportunistas• Tipos de Micose:- -Infecções Oportunista Tipos Fatores Predisponentes:- Intrisecos• Extrinsicos• Manisfestação Clinica• Candidiase- Adesão• Nanoproteinas• Genes ALC• Celulas Epiteliais e Endoteliais• Celulas Imunes• Matri Extracelular• Superficies Inertes• - Fatores de Virulência 3-Reprodução Biologia Geral dos Fungos domingo, 21 de abril de 2013 22:03 Resumo Page 5 4-Perguntas Presença de Vacúolo, Membrana Plasmatica formada por Ergosterol e presença de Parede Celular formada por Quitina. Como se diferencia uma célula fúngica de uma célula eucariótica humana?• Leveduras, Fungos Filamentosos e Fungos Dimorficos. Como se classificam os fungos morfologicamente?• São heterotróficos, sua nutrição é feita por absorção. A maioria dos fungos são aeróbios e outros fermentadores. Quais as exigências metabólicas dos fungos?• São medicamentes que combatem o desenvolvimento do fungo, podem atuar na parede celular, funcionamento da membrana, sintese do ergosterol, divisão celular, sintese de proteina e inibidores metabolicos. Ex: Estes medicamentos actuam sobre a síntese e permeabilidade das membranas celulares, inibir uma enzima envolvida na conversão de ergosterol Quais são e como agem os antifúngicos?• Alergias, Toxicoses e Micoses Quais são as patologias ocasionadas por fungos?• Quais são as vias de transmissão das infecções fúngicas?• Inalação, Contato direto, Traumatismo e Iatrogênica (Manipulação, ventiladores e etc) Quais são os métodos de diagnóstico das infecções fíungicas?• Alguns métodos são: apresentações típicas e atípicas, demosntração de fungos no tecido e reação tecidual a infecção. O que é uma micotoxina? Como é produzida, onde e como age?• Micotoxinas são substâncias químicas tóxicas produzidas por fungos. Na sua ação de decomposição dos alimentos, os fungos são capazes de produzir metabólitos secundários, não essenciais para sua manutenção primária, mas capazes de atingir outras espécies. Esses compostos, denominados genericamente micotoxinas, conferem aos fungos uma vantagem competitiva sobre outros fungos e sobre bactérias presentes no ambiente. Quase todas são citotóxicas, resultando na ruptura de membranas celularese outras estruturas, ou interferindo em processos vitais como síntese protéica e de RNA ou DNA. Resumo Page 6 1-Caractéristicas Gerais São eucariotos• O glicocalix é extremamente escpecializado• Proteina Variante de Superficie• Exemplos de doenças: Malária, Leishimaniose, Amebiase, Doença de Chagas e sono.• Amastigota, pro-mastigota○ Devido a expressão gênica○ Cascata de sinalização○ Possui diferentes formas durante seu ciclo reprodutivo• Controle de expressão pós-transcricional (Inviavel para o Genoma Humano)• Diversidade Estrutural• Adesão (Moléculas ligantesdo parasita)• Invasão (Via de transdução de sinais da célula hospedeira)• Biologia Geral dos Protozoários domingo, 21 de abril de 2013 23:33 Resumo Page 7 Pontos Importantes do seminário Aplicação de tecnicas computacionais como ferramentas de estudo de questões biológicas○ Bioinformatica: Definição e Razões Históricas• Risco zero Custo menor que a bancada Alta velocidade Alta flexibilidade Direcionar Experimentos Criar e testar hipoteses○ O que é possivel?- Genoma de referência>Genomas Similares• O Bioinformata possui conhecimento do parametros e suas utilidades• Montagem de Genomas- Permitemestudo in silico• Esses modelos se valem de grande quantidade de dados• Modelos matemáticos e a biologia molecular- Conservação é rara em regiões intergênicas• Diferença entre os tipos- Possuem uma infinidade de filtros de busca• Ferramentas de busca- Genoma de referência >Genomas similares• O Bioinformatica possui conhecimento dos parametros e suas utilidades• Montagem de genomas- Genome Browser• Anotação de genomas- Softwares que modelam fenómeno biológico• Preditores- Alinhamento de Sequência- Verificar se organismos (sequencias) diferentes podem apresentar alguma relação• Permite inferir função e nivel de divergência entre os organismos.• Bioinformatica na Parasitologia domingo, 21 de abril de 2013 23:52 Resumo Page 8 1-Caractéristicas Gerais Espécie de vida livre e parasitaria• Especies adaptadas ao parasitismo• Hospedeiros intermediarios ou não• Atingem adultos e crianças• Destes 450 milhões de doentes○ Existem bilhões de parasitoses• Prevalência em regiões menos desenvolvidas• Condições sanitarias precárias, crescimento urbano desorganizado.• 2-Helmintos: Critérios de Classificação Forma e função• São vermes cilindricos, com extremidade afiladas• Corpo alongado, não segmentado organizado em orgãos e sistemas• Sistema digestivo completo• Aparelho reprodutor completo• Sexos separados e dimorfismo sexual (fêmeas maiores que os machos por precisarem guardar os ovos) • Clivagem e eclosão dependem de condições ideais e especificas do ambiente Ovoposição• Nematoides- Estão entre os maiores nematoides• Conhecido como lombriga ou bicha• Contato: Ingestão de ovos na água, verduras frutas, contato, solo contaminado.• Ingestão de ovos>Invasão da corrente sanguinea (Ciclo Pulmonar)>Desglutição> Adultos no intestino>Acasalamento Ciclo de vida• Eles tem 3 camadas Os ovos fertes são ovais ou quase esfericos• Relatos de visualização direta do parasita Exame parasitologico de fezes Hemograma (Eosinofilia aumentada) Diagnostico• Ascaris Lumbricoide- Machos: Presença de bolsa copuladora• Os vermes vivem na luz do instestino delgado fixados à mucosa através da mucosa bucal• Ovos de casca fina• A capsula bucal modificação da capsula inferior• Ancilostomiase ou Amarelão- É a parte do corpo do macho que aloja a fêmea no momento do acasalamento. Macho maior e possui canal ginecoforo• Caracteristicas• Trematoide (Esquisotomose)- Biologia Geral dos Helmintos segunda-feira, 22 de abril de 2013 00:13 Resumo Page 9 Acelomados As espécies parasitas apresentam uma cutícula de proteção e, em alguns casos, ventosas para fixação. Alguns apresentam cílios na região ventral, para fins de locomoção. Podem possuir células mucosas, que produzem lubrificação para facilitar a locomoção. Não possuem sistema respiratório, e as trocas gasosas são feitas pela epiderme, por difusão. Este tipo de respiração recebe o nome de tegumentar ou cutânea e ocorre nas espécies de vida livre, pois as parasitas fazem respiração anaeróbia. Presença de tegumento (Projeções citoplasmaticas de celulas localizadas abaixo da camada muscular) Caracteristicas• OBS: A criação de bancos de dados como o HelmDB, possibilita o uso de Systems Biology ou Biologia Sistemica na criação e aprimoramento de meios contra os helmintos. Resumo Page 10 Estrutura do virus 2 tipos basicos: O Virus Icosaedrico ou Helicoidal (forma mais comum dos que causam doenças)• Capsidio+genoma=Necleocapsidio ''Casca''=Capsidio○ É possível que o virus nesse processo adquira proteinas celulares, disfarçando-o○ Aquisição do Envelope plasmatico• Graças à computação foi possivel a visualização da estrutura atômica e, com esta, foi possivel a criação de melhores farmacos anti-virais ○ Estrutura e como a computação ajudou (Cristalografia)• A qtde de virus marinhos supera em 2-3 em grau de magnitude a qtde de algas○ Controle da quantidade de algas• Ciclo Replicativo do virus• RNA de fita simples + ou -○ RNA de fita dupla + ou -○ DNA de fita simples○ DNA de fita dupla○ Tipos de genoma viral• Virus entra>Injeta DNA parental no nucleo>este se fecha>RNA polII>Alfa RNA par ao citoplasta> Alfa proteinas>volta ao nucleo>repete-se 3x>replica-se e depois é enviado para for a da celula ○ Ciclo do virus de DNA• Virus tem polaridade igual ao RNAm○ Ciclro do virus de RNA+• Ciclo do virsu de RNA-• Ciclro do Retro Virus• Gera variabilidade com a mutação, quasis-especie, adaptando-se a difernte situações○ Mutação• Adaptação• Virus não quer causar doença, é melhor mante ro hospedeiro vivo○ Equilibrio do virus com o hospedeiro• Os pontos em * são pontos importantes da matéria, os em bola vazia são descrições destes. Biologia Geral dos Vírus segunda-feira, 22 de abril de 2013 01:15 Resumo Page 11 Avanço em virologia decorrentes da bioinformatica segunda-feira, 22 de abril de 2013 02:20 Resumo Page 12
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