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RegulaRegulaçção da Expressão Gênica ão da Expressão Gênica A Regulação Gênica Todas as células de um organismo contêm todos os genes de seu genoma Então, por que as células são tão diferentes ??? RegulaRegulaçção da transcrião da transcriççãoão principal nível de controle da regulação Como a célula controla a síntese de suas proteínas? Cada tipo de célula é programada para expressar apenas algumas de suas proteínas � As células precisam ser capazes de ligar ou desligar a transcrição de cada gene específico ou grupo de genes � As células devem ser capazes de reconhecer as condições ambientais nas quais devem ativar ou reprimir a transcrição de genes relevantes Circuitos de controle Genes Constitutivos – são expressos o tempo todo Genes Induzíveis – sua expressão depende da presença ou ausência da substância indutora Genes Repressíveis – são normalmente ativos, mas sua atividade pode ser inibida pela presença de uma substância repressora Regulação Gênica em Procariontes ���� promotor e RNA-polimerase � determina início transcrição cada gene um promotor ���� operadores e proteínas ativadoras e repressoras Genes: ligação proteína ativadora ao sítio alvo � transcrição começa REGULAÇÃO POSITIVA Genes: impedir ligação proteína repressora � transcrição começa REGULAÇÃO NEGATIVA Regulação Gênica em Procariontes As conseqüências diferentes da ligação do ativador e do repressor ao operador no DNA Regulação Gênica em Procariontes • Ocorrem dois tipos de controle transcricional: • Controle positivo: uma proteína regulatória atua como um ativador, estimulando a transcrição; • Controle negativo: uma proteína regulatória atua como um repressor, inibindo a transcrição. Regulação Gênica em Procariontes COMO OS ATIVADORES E REPRESSORES (PROTEÍNAS REGULADORAS) REGULAM TRANSCRIÇÃO? Proteína ativadora � ajuda fisicamente orientar RNA pol. ao promotor Proteína repressora �interfere fisicamente na ligação RNA pol. ao seu promotor �impede o movimento da RNA pol. ao longo da cadeia de DNA início da transcrição – controle positivo bloqueio início transcrição – controle negativo Regulação Gênica em Procariontes O modelo operon: grupos genes que são transcritos juntos como uma única molécula de mRNA policistrônica A Regulação da Expressão Gênica em Procariontes e suas novidades … Operon: unidade genética de expressão coordenada OPERONS � Grupos de genes arranjados de forma consecutiva (lado a lado) no genoma e sujeitos ao controle de uma única região reguladora (promotor único e operador) – formam unidade de expressão gênica � Genes do operon estão envolvidos em uma mesma rota metabólica – p. ex., degradação de açúcares: lactose, galactose, glicose, xilose→ regulados em conjunto. � Surgiram para criar situação ótima para eficiência energética da célula, além de garantir presença do RNA de todos os constituintes de uma mesma via. Regulação Gênica em Procariontes Estrutura de um Operon - Formado por 3 elementos � promotor – ligação da RNA polimerase � operador – ligação de proteínas regulatórias (ativadoras ou repressoras) ou seja, fatores de transcrição � genes estruturais – vão gerar as proteínas e cujas expressões são controladas - Genes do operon em um único transcrito - RNA policistrônico - tradução de cada seção do RNA policistrônico pode ocorrer de forma independente Gene 1 Gene 2 Gene 3 OperadorPromotor Estrutura de um Operon Tipos de Operon Operon Induzível negativo Tipos de Operon Operon Repressível negativo Os conceitos básicos de regulação metabólica de procariotos foram descobertos em E. coli Idéia chave: Proteínas não são sintetizadas quando não necessárias!!! O operon Lac de E. coli E. coli conserva suas energias não produzindo as proteínas Lac quando não é necessário metabolizar lactose, p. ex., quando há outra fonte de açúcar disponível, como glicose glicose lactose 1. Indução catabólica - O substrato (lactose) induz a expressão gênica 2. Repressão catabólica – quando a glucose é a fonte primária de carbono Jacob e Monod, 1961 Regulação da expressão das enzimas necessárias para o metabolismo de lactose E. coli O operon Lac de E. coli como um Sistema Induzível Metabolismo da lactose em bactéria Operon Lac � lactose deve estar presente (controle negativo) � glucose não esteja presente (controle positivo) Expressão enzimas metabólicas glucose - duas condições tem que ser satisfeitas: Operon Lac � síntese β-galactosidade não será induzida até toda glucose usada � célula usa qq glicose existente antes de metabolizar mais lactose � Glucose � supressão da indução operon lac Indução da síntese de ββββ-galactosidase Operon Lac Modelo simplificado do operon lac Operon Lac Genes: Lac Z → β-galactosidase: cliva a lactose em glicose + galactose Lac Y → permease: facilita a entrada de lactose na célula Lac A → transacetilase: acetila lactose não hidrolisada para ser eliminada da célula Operon Lac Transcritos em única molécula multigênica de RNA policistrônico Operon Lac Operon Lac A proteína repressora (decodificada pelo gene I) regula o operon lac Proteína Repressora Operon Lac – controle negativo DNA Repressão Operon Lac – controle negativo Sítio de ligação à Lactose vazio: O Repressor se liga ao operator – a transcrição é inibida Proteína Repressora Operon Lac – controle negativo Sítio de ligação à Lactose ocupado: O Repressor não se liga ao operator - ocorre a transcrição DNA Proteína Repressora Operon Lac – controle negativo Resposta a presença de Lactose (indutor) Operon Lac – controle negativo O Operon Lac regula o Metabolismo de Lactose Operon Lac – controle negativo Numa visão mais detalhada da estrutura funcional do Operon Lac … Operon Lac O Operador se sobrepõe ao Promotor na extremidade 5’ do primeiro gene estrutural do operon Operon Lac Relembrando: promotores de E. coli… Operon Lac Operon Lac Operon Lac Operon Lac Operon Lac Operon Lac OBS: cada gene no transcrito policistrônico tem seus códons de início e término a serem utilizados na tradução Operon Lac Se ambas estão presentes, quem é mais eficiente metabolicamente?? Se a glicose esta presente o operon lac é reprimido mesmo na presença de lactose Lactose X Glicose Operon Lac – controle positivo Por que a glicose tem que estar ausente para transcrição dos genes do operon lac? Se tem glicose por que metabolizar lactose gastando energia a toa? Operon Lac – controle positivo A região promotora lac tem dois sítios de ligação: 1) RNA polymerase binding site 2) CAP-binding site (for catabolite activator protein), como um exemplo de controle positivo da regulação da expressão gênica Operon Lac – controle positivo cAMP-CAP: Facilita ligação da RNA Polimerase ao promotor lac Quando a glucose está ausente, os níveis de cAMP são altos e o complexo cAMP-CAP se liga a região promotora, aumentando a eficiência da ligação da RNA polimerase e da transcrição. Operon Lac – controle positivo Quando a glucose (catabólito) está presente, os níveis de cAMP são baixos e CAP não pode se ligar ao promotor; consequentemente a ligação da RNA polimerase e da transcrição diminuem Repressão Catabólita do Operon Lac Operon Lac – controle positivo Operon Lac – controle positivo Repressão Catabólita do Operon Lac Controle catabólico do Operon lac. Sistema de repressão catabólica contribui para a ativação seletiva do operonlac Controle negativo e positivo do operon Lac pelo repressor Lac e a proteína ativadora do catabolismo (CAP), respectivamente ↑↑↑↑ Glicose ↓↓↓↓ Lactose ↑↑↑↑ Glicose ↑↑↑↑ Lactose Expressão Basal Sem Expressão ↓↓↓↓ Glicose ↑↑↑↑ Lactose Expressão aumentada ↓↓↓↓ Glicose ↓↓↓↓ Lactose Expressão cAMP Operon Lac TODOS OS NÍVEIS DE MODULAÇÃO DA TRANSCRIÇÃO ↑↑↑↑ Glicose ↑↑↑↑ Lactose Expressão Basal CAP RNA Pol cAMP ↓↓↓↓ Glicose ↑↑↑↑ Lactose ↑↑↑↑↑ Expressão ↑↑↑↑ Glicose ↓↓↓↓ Lactose Expressão O mecanismo da ativação transcricional cAMP-CAP Operon Lac – controle positivo Comparação do controle positivo e negativo Controle negativo: indutor-repressor operon lac - expressão bloqueada Controle positivo: sistema CAP-cAMP - expressão operon lac requer presença sinal ativador Proteínas regulatórias � proteína ativadora – CAP � proteína repressora – repressor Lac (LacI) � molécula efetora indutora – lactose � molécula efetora co-repressora – não tem � molécula co-ativadora – cAMP Operon Lac – funcionamento O Triptofano é um amino ácido sintetizado pelas enzimas do operon trp. Se o triptofano está presente no meio, ele atua como um co-repressor, bloqueando a transcrição dos genes envolvidos na via metabólica da formação desse aminoácido. O Operon trp (triptofano) O Operon trp (triptofano) Caracterizem esse operon: Positivo ou negativo? Induzível ou repressível? O Operon trp (triptofano) Atenuador: causa terminação prematura da transcrição dependentemente das concentrações de triptofano no meio O Operon trp (triptofano) Mapa da região ara Operon de enzimas (codificadas pelos genes araB, araA e araD) envolvidas no metabolismo açúcar arabinose Região iniciadora (ara I) : contêm sítio operador e promotor onde se inicia a transcrição Ara C: ausência de arabinose - repressora presença de arabinose – ativadora O Operon Ara (arabinose) Controle duplo do operon ara: Controle positivo e negativo O Operon Ara (arabinose) transcrição reprimida araC age como repressora transcrição ativada araC age como ativadora Sem arabinose, araC se liga a araO e araI– bloqueia promotor e impede ligação da RNA Pol Proteína ativadora (araC) está ligada a arabinose e ara I – ativa RNA Pol O Operon Ara (arabinose) Operon lac, ara e trp Operon lac – sistema indutível. Está SEMPRE desligado a não ser que um indutor (lactose) esteja disponível no ambiente para induzir a expressão dos genes do seu metabolismo. LacI (proteína regulatória) é desligada do operador na presença de lactose – estimula transcrição pelo promotor ara. Operon ara – sistema reprimível e indutível. Dependendo de onde a proteína reguladora (AraC) está ligada e se o indutor (arabinose) está presente ou não no meio: a expressão pelo promotor ara pode estar inibida (AraC ligada a araO e araI na ausência de arabinose) ou estimulada (AraC ligada a araI na presença de arabinose). Operon trp – sistema reprimível. Está SEMPRE ligado a não ser que um indutor (triptofano) esteja em excesso no ambiente e não seja mais necessária a biossíntese desse aminoácido. Proteína R (proteína regulatória) liga-se ao operador na presença de excesso de triptofano – reprime transcrição pelo promotor trp. Possible target in control of gene expression
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