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REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA EM EUCARIOTOS Regulação da expressão gênica Procariotos x Eucariotos �Transcrição e tradução acopladas � Genoma pequeno � Pouca especialização � Maior parte do DNA codifica proteínas � Cromossomos: DNA + poucas proteínas com organização simples � não há processamento � Possuem núcleo e Genoma grande � Especialização celular � Maior parte do DNA não codifica proteínas � Cromossomos: DNA + muitas proteínas com organização complexa � Vários tipos de processamento de mRNA � mRNA de vida longa (horas a meses) � Estado basal dos genes = OFF � Operons são raros Ambos alteram a expressão gênica em resposta ao ambiente PROCARIONTES � Em geral, o estado básico de um gene é “ligado” � RNA pol começa transcrição a menos que uma proteína repressora a bloqueie. Regulação da expressão gênica EUCARIONTES � Em geral, o estado básico de um gene é “desligado” � Compactação do DNA com nucleossomos impede a transcrição a menos que outras proteínas reguladoras estejam presentes � Estrutura da cromatina deve ser mudada para ativar a transcrição. As proteínas reguladoras expõem as sequências promotoras alterando a densidade dos nucleossomos ou sua posição recrutando assim a RNA polimerase II Regulação da expressão gênica: Procariotos x Eucariotos Possíveis pontos de controle da expressão gênica � Iniciação da transcrição � Processamento de RNA � Transporte de mRNA para o citoplasma � Estabilidade do mRNA � Iniciação da tradução � Estabilidade e modificação pós-traducional de proteínas Regulação Transcricional Organização dos cromossomos no núcleo ���� Os cromossomos não estão todos “misturados” no núcleo durante a intérfase � Territórios Cromossomais Cada cromossomo tem seu próprio domínio discreto no núcleo � Compartimenos Intercromossomais Canais sem DNA entre os territórios cromossomais Territórios Cromossomais Cromossomos 7 na metáfase e interfáse Como “ligar” um gene eucariótico? � Cromossomos eucarióticos são embalados em cromatina (nucleossomo) � Grande parte do DNA eucariótico não está prontamente acessível a proteínas reguladoras e ao aparato de transcrição � Genes eucarióticos inacessíveis e desligados REMODELAGEM DA CROMATINA Mudança de posição dos nucleossomos � Torna o DNA mais acessível aos fatores de transcrição � Recrutamento de fatores de transcrição ao complexo de iniciação Remodelagem da cromatina � Durante a mitose (cromatina mais condensada) os genes são menos acessíveis � O DNA interfásico é ainda bem condensado e associado a histonas (nucleossomos) � A inacessibilidade das proteínas pode ser demonstrada por ensaios de sensibilidade da cromatina a nuclease Genes inativos são resistentes a DNAse Genes ativos são mais sensíveis ao tratamento com DNAse Remodelagem da cromatina Nucleossomos e Transcrição Iniciação da Transcrição Iniciação da Transcrição � Provavelmente, o mais comum nível de regulação � Iniciação pode envolver a ação de mais de 100 proteínas diferentes � A maioria dos fatores atuam para ativar a expressão � São poucos os repressores da iniciação da transcrição Iniciação da Transcrição RNA polimerase II � sintetiza todos os mRNAs taxa máxima transcrição cooperação de múltiplos elementos regulatórios ação cis alvos para a ligação de diferentes proteínas de ação trans que se ligam ao DNA Elementos regulatórios cis Promotor (core): TATA Elementos proximais ao promotor (Upstream Promoter Elements): - CAAT ou CCAAT box - GC box (consenso GGGCGG) Promotor (core): Elementos regulatórios cis � região de início de transcrição � região de ligação da RNA pol II e fatores gerais de transcrição � inclui TATA box � incapaz mediar transcrição eficiente sozinho � ligam-se a proteínas � ajudam ligação RNA pol II e fatores gerais de transcrição ao seu promotor � CCAAT box � segmento rico em GC Elementos proximais ao promotor: Conseqüências das mutações de ponto no promotor e elementos proximais do promotor para o gene de ββββ-globina quanto a seus efeitos nas taxas de transcrição Elementos regulatórios cis Elementos independentes de distância: Elementos regulatórios cis Silenciadores (Silencers) : ligadas a repressores: inibem os ativadores e reduzem a transcrição Exercem seus efeitos a distâncias consideráveis do promotor capazes de agir a distância: 50kb ou mais operam estando anterior ou posterior ao promotor que controlam Acentuadores (Enhancers) : aumentam taxa de transcrição dos promotores na mesma molécula de DNA: ativam a transcrição Elementos regulatórios cis Acentuadores (Enhancers) � Sequência de DNA atuando em cis onde se ligam vários fatores de transcrição para aumentar a taxa de iniciação da transcrição � São os alvos de fatores de transcrição mais específicos que controlam a regulação de subgrupos menores de genes � Atuam em apenas em um ou alguns tipos de células em um eucarionte multicelular � Podem se localizar upstream ou downstream do promotor e atuam a grandes distâncias � Em leveduras são chamados de UAS (upstream activating sequences) Elementos regulatórios cis Acentuadores (Enhancers) Posição de alguns enhancers: - Cadeia pesada da imunoglobulina: dentro do gene - gene da β-globina: downstream - SV40: upstream e perto do promotor Elementos regulatórios cis Silenciadores (Silencers) Bloqueiam a “passagem” do efeito ativador dos enhancers sobre o complexo basal de transcrição Elementos regulatórios cis Elementos regulatórios cis Enhancers Como os elementos acentuador que distam milhares de pb regulam a transcrição? MODELOS EM ALMODELOS EM ALÇÇA DE DNAA DE DNA traz as proteínas ativadoras ligadas aos elementos acentuadores distantes para as proximidades dos complexos proteicos associados a seqüências de ação cis proximais ao promotor • tecido específica • podem ser controlados por modificação – fosforilação ou nível de expressão • dependente da ligação de outro composto • disponibilidade variável – interação com outras proteínas Elementos regulatórios cis Enhancers Elementos regulatórios cis Enhancers Elementos regulatórios cis Enhancers Elementos regulatórios trans � ação trans � atuam ligando-se a seqüências alvo específicas do DNA: - promotor - elementos proximais do promotor - acentuadores � ajudam RNA pol II a iniciar a transcrição � junto com RNA pol � complexo de iniciação Elementos regulatórios trans Fatores de transcrição: Fatores de Transcrição (FT) se ligam a enhancers e promotores e interagem com o complexo basal Possuem 2 domínios: - “DNA binding domain” para interação com o elemento cis - “Protein binding domain” para interagir com outro FT, com um mediador (co-ativador) ou com a RNA Polimerase Fatores gerais de transcrição: expressos maioria das células Fatores específicos de transcrição: expressos em algumas células Formação do complexo basal de iniciação de transcrição � fatores gerais de transcrição Elementos regulatórios trans � Ligam-se a promotores e elementos proximais ao promotor � fatores gerais de transcrição: interagem com RNA pol II � TFIID � TBP – proteína de ligação a TATA (TBP- TATA Binding Proteins) � TAF – fatores associados a TBP � TFIIB � liga-se a TBP e, as vezes, a sequências anteriores ao TATA box � serve para ancorar a RNA Pol II � TFIIF � liga-se a RNA Pol II e “facilita” sua associação a TFIIB � TFIIE e TFIIH � necessários para a iniciação da transcrição � TFIIH - 2 subunidades: helicase e quinase(desenrola DNA e fosforila CTD – C- Terminal Domain) Elementos regulatórios trans Ativadores � fatores específicos de transcrição que se ligam a acentuadores (cis) � necessários para a transcrição de determinados genes 2 domínios funcionais � ligação ao DNA � ativação da transcrição Elementos regulatórios trans 2 domínios funcionais � ligação ao DNA � repressão da transcrição Elementos regulatórios trans Repressores � fatores específicos de transcrição que se ligam a silenciadores (cis) � impedem a transcrição de determinados genes O aparato molecular que controla a transcrição nas células humanas consiste em quatro tipo de componentes Iniciação da Transcrição Regulação Traducional Regulação Traducional � Iniciação da tradução pode ser bolqueada por proteínas regulatórias que se ligam a UTR e bloqueiam a ligação dos ribossomos ao mRNA Regulação Pós-Traducional Regulação Pós-Traducional � Modificações das cadeias laterais de aminoácidos � Fosforilação: quinases fosfatases Regulação Pós-Traducional � Existem diversas maneiras de regular a atividade de uma proteína � Interação com ligante ou co-fator � Interação com outras proteínas � Direcionamento de proteínas � Estabilidade protéica e degradação Sinal regulatório que ativa fatores de transcrição eucariótico podem vir de fonte distante do corpo. Hormônios do sistema endócrino Sistema endócrino � regulador master para coordenar as mudanças na transcrição em células de muitos tecidos diferentes hormônios e fatores de crescimento - moléculas pequenas que entram e saem das células e se ligam em receptores da superfície esteróides – receptor + hormônio no citoplasma - núcleo e reconhecem sequências regulatórias específicas- ativa a transcrição de genes peptídicos – ligam-se a receptores e desencadeiam cascata de eventos intracelulares – controle da expressão Cascata de fatores reguladores para regular um gene Também respondem a demanda!! Regulação da expressão gênica em eucariotos MAPK Regulação da expressão gênica em eucariotos Fatores de transcrição específicos ativados por vias de transdução de sinais P PI3K AKT FKH PDK MAPK PIP2 IP3 ER DAG Vias de transdução de sinais Fatores de transcrição específicos Regulação da expressão gênica em eucariotos
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