exercicio sobre aminoacidos_e_proteinas_ 2

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UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO
ICE – DEQUIM
SETOR DE BIOQUÍMICA
DISCIPLINA: BIOQUÍMICA
PROFESSOR EMERSON PONTES
Proteína Intracelular de Ligação de Ácidos Graxos (FABP)
1. Existem muitas proteínas intracelulares de ligação a ácidos graxos (FABP) que são tecidos especificas. Elas provavelmente têm um papel no transporte intracelular de moléculas de ácidos graxos livres e apresentam uma das mais simples topologias conhecidas para barris antiparalelos. No caso das FABPs o barril é composto por dez fitas, o qual cria uma cavidade central onde o ácido graxo (ou outro ligante hidrofóbico) se liga. Existem várias características estruturais interessantes no barril, as quais podem ser destacadas no modelo tridimensional.
Identifique o aminoácido na ponta amino-terminal.
Identifique o aminoácido na ponta carboxi-terminal
Quantos resíduos de aminoácidos existem em cada uma das seqüências acima?
Quantos aminoácidos apolares existem na seqüência de FABP de adipócito?
Quais são os aminoácidos monoamino e monocarboxilico?
Quais são os aminoácidos monoamino e dicarboxilico?
Quais são os aminoácidos diamino e monocarboxilico?
O que são proteínas homologas? 
Alinhe as 3 seqüências e identifique os aminoácidos similares.
Para cada uma das seqüências indique o aminoácido do resíduo 10, 50, 55, 60 e 100.
Quais os níveis superiores de organização protéica que uma proteína pode assumir? Defina cada um deles.
Compare uma estrutura em α-hélice e folha-(.