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Adicionando informações estruturadas ao Bulário Eletrônico da ANVISA Autores: João Vitor F. da Silva, Carlos N. Silla Jr. e André Y. Kashiwabara. Programa de Pós-Graduação em Informática – UTFPR - Cornélio Procópio – PR – Brasil Motivação 1. Facilitar a busca de medicamentos considerando o problema da utilização concomitante entre eles. 2. Muitos idosos precisam tomar medicamentos que causam muitos efeitos adversos (Wallae; Paauw, 2015) 1. Os efeitos adversos aumentam a medida que mais medicamentos são tomados concomitantemente. 3. Dados da OMS: (i) mais de 50% de todos os medicamentos receitados são dispensáveis ou são vendidos de forma inadequada (ii) 50% dos pacientes tomam medicamentos de forma incorreta. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 2 Nome Site Característica Diferencial Desvantagem Multifarmas http://multifarmas.com.br Busca por preços e farmácias. Não tem interações medicamentosas, doenças. Drugs.com http://drugs.com Mais completo de todos: (i) busca por medicamentos; (ii) reações adversas; (iii) interações medicamentosas; (iv) preços. Não atende o público brasileiro. Bulário Eletrônico da ANVISA http://anvisa.gov.br/fila_bula/ Medicamentos de referências utilizados no Brasil e Bulas em formato PDF. Interface com pouca usabilidade, falta de filtros mais específicos. CVS Pharmacy https://www.cvs.com/drug/int eraction-checker Pesquisa entre medicamentos e drogas, apresenta resultado de interações entre drogas, estilo de vida e interação entre alimentos. Não apresenta pesquisa para o público brasileiro. WebMD http://www.webmd.com/inter action-checker/ Pesquisa em medicamentos, classifica as interações encontradas. Medicamentos geralmente comercializados para o Brasil não foram encontrados. SIDER 2 Side Effect Resource http://sideeffects.embl.de/ Banco de dados sobre reações adversas. Não existe a possibilidade de pesquisa por medicamento. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 3 O que já existe? ANVISA ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 4 E outros órgãos relacionados elaboraram... Bulário Eletrônico – ANVISA – Interface pouco interativa ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 5 A nossa abordagem ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 6 A nossa abordagem para o problema www.facilbula.com.br 1. Extrair informações dos textos das bulas disponibilizadas pela ANVISA; 2. Segmentar os textos utilizando técnicas de mineração de textos; 3. Utilizar as interações droga-droga já conhecidas pela literatura biomédica (Drugbank); 4. Mapear as ontologias biomédicas nas bulas (i) SNOMED-CT; (ii) Disease Ontology; (iii) CID-10; 5. Armazenar essas informações utilizando um banco de dados não-relacional baseado em grafos (Neo4J); 6. Criar um sistema web de fácil usabilidade (www.facilbula.com.br em desenvolvimento). ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 7 ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 8 Fontes de informações utilizadas Vantagens do SNOMED-CT e DrugBank: 1. São públicos 2. São estruturados 3. Possuem informações curadas (verificadas manualmente por especialistas) ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 9 DrugBank (Wishart; David S.; et al., 2008) Banco de dados de drogas. Interações entre outras drogas. Muito detalhado. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 10 SNOMED-CT (College of American Pathologists; et al., 1993) Ontologia: vocabulário comum organizado em um grafo dirigido acíclico. Banco de dados de termos médicos. Doenças e as respectivas hierarquias entre elas. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 11 Dificuldades Bulas com apenas imagem do arquivo. ◦ Extração da imagem; ◦ Orientação e alinhamento do texto; ◦ Tratamento de qualidade, texto mais nítido. Erros ortográficos. Sinônimos. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 12 Roteiro para segmentação dos tópicos ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 13 Mapeamento com outras fontes de informações ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 14 Doenças Interações medicamentosas Rede complexa: Doenças-Medicamentos-Fármacos Exemplos ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 15 Exemplo 1: Visão geral das interações ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 16 Exemplo 2: Busca de remédios utilizando doenças Quais são os medicamentos indicados para a doença de Alzheimer? MATCH (med:Bula)-[related]-(:Doenca {NameDisease: "Alzheimer's disease"}) WHERE Type(related) = "INDICAÇÕES" RETURN med, Type(related), related LIMIT 20 ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 17 Exemplo 3: Hierarquia das doenças Hierarquias entre o termo Alzheimer's disease (C26929004) que pertence aos termos médicos tauopathy (C111479008) e dementia (C52448006). MATCH p=(Doenca { NameDisease:"Alzheimer's disease" })-[r]->(b) RETURN * ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 18 Exemplo 4: Busca de Remédios por meio da composição Medicamentos que utilizam aspirina em sua composição (Acetylsalicylic acid - DB00945). MATCH (med:Bula)-[relatedTo:COMPOSIÇÃO]- (:Droga {DrugBankId: "DB00945"}) RETURN med, Type(relatedTo), relatedTo ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 19 Exemplo 5: Inferindo as contra- indicações por doenças Imagina-se que um determinado paciente que possui insuficiência renal (kidney failure - C192789001) necessita tomar um medicamento com aspirina em sua composição. MATCH (dr:Droga {DrugBankId: "DB00945"})<- [:COMPOSIÇÃO]-(m:Bula)- [:CONTRAINDICAÇÕES]-> (do:Doenca {ConceptID: "C192789001"}) RETURN m, dr, do ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 20 Exemplo 6: Uso concomitante de remédios A pesquisa apresenta medicamentos que não podem ser prescritos juntamente com o medicamento Paracetamol, justificado pela presença do Acetaminophen (DB00316). MATCH (med:Medicamento)- [relatedTo:COMPOSIÇÃO]->(m)<- [:`CONTRAINDICAÇÕES`]-(contraMeds) WHERE med.NomeBula = "PARACETAMOL" RETURN med, Type(relatedTo), relatedTo, contraMeds LIMIT 5 ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 21 Conclusão e trabalhos futuros Grafo doença-remédio-fármaco: ◦ Drogas do DrugBank; ◦ Termos médicos do SNOMED-CT; ◦ Bulário Eletrônico da ANVISA; Integração com outras fontes de informação: ◦ CID-10; ◦ Disease Ontology; Análise por especialistas, médicos e outros profissionais da área de saúde; Site: www.facilbula.com.br ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 22 Fácil Bula Site: www.facilbula.com.br ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 23 ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 24 Referências R. A. Côté, C. of American Pathologists, A. V. M. Association, et al. The systematized nomenclature of human and veterinary medicine: SNOMED international. College of American Pathologists; Schaumburg, IL: American Veterinary Medical Association, 1993. J. Wallace and D. S. Paauw. Appropriate prescribing and important drug interactions in older adults. Medical Clinics of North America, 99(2):295–310, 2015. D. S. Wishart, C. Knox, A. C. Guo, D. Cheng, S. Shrivastava, D. Tzur, B. Gautam,and M. Hassanali. Drugbank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets. Nucleic acids research, 36(suppl 1):D901–D906, 2008. ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 25 Contatos João Vitor Ferrari da Silva - poferrari@gmail.com Carlos Nascimento Silla Jr. - carlosjunior@utfpr.edu.br André Yoshiaki Kashiwabara - kashiwabara@utfpr.edu.br Programa de Pós-Graduação em Informática Universidade Tecnológica Federal do Paraná CEP 86300-000 – Cornélio Procópio – PR – Brasil Obrigado! ADICIONANDO INFORMAÇÕES ESTRUTURADAS AO BULÁRIO ELETRÔNICO DA ANVISA 26
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