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Aplicações da Microbiologia Abordagens: – Estrutura – Metabolismo – Classificação – Interação microrganismo x ambiente – Genética de microrganismos Aplicações Saúde Ambiente Indústria Objetivo Como os MI impactam a nossa vida Como os MI podem melhorar a qualidade de vida Correlacionar a informação com a aplicação Médico Ambiental Industrial Aplicações Saúde Ambiente Indústria Introdução Aplicações na saúde MI produtores de antibióticos MI produtores de proteínas terapêuticas Modelos biológicos para estudo de patogênese Aplicações ambientais Micorrizas MI biorremediadores Decompositores de biomassa Aplicações industriais: Secretores de proteínas e substâncias de alto valor agregado Exercícios Aplicações Saúde Ambiente Indústria Introdução: – Importância dos MI A maioria dos MI é benéfica e tem aplicação industrial e ambiental? A vasta utilização dos MI é decorrente da sua natureza versátil ... – Consumir matéria orgânica como fonte de carbono e energia – Secretar proteínas e substâncias para o meio extracelular Aplicações Saúde Ambiente Indústria Microrganismos Controle Biológico de Pragas (entomop.) Biomassa Alimento (leveduras) Produção de Enzimas e Antibióticos Biotransfor. Fermentação (leveduras) Simbiose (Micorrizas) Despoluição Biorremediação (substratos complexos Decomposição Ciclagem (saprófitas) Benefícios Aplicações Saúde Ambiente Indústria Microrganismos Infecção de Tecidos vivos (hospedeiro) Depreciação Produtos Agrícolas (fitopatógenos) Micotoxinas (Aflotoxina) Degradação Indesejada (alimentos) Alergias (esporos) Prejuízos Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI aplicação na área da saúde Aplicações Saúde Ambiente Indústria Aplicações Saúde Ambiente Indústria Antibióticos e o metabolismo secundário Aplicações Saúde Ambiente Indústria Penicillium 2U/mL X 70.000 U/mL (Genética molecular e de microrganismos) Melhoramento clássico seleção de linhagens e indução de mutação Aplicações Saúde Ambiente Indústria Clonagem dos genes que codificam as proteínas que participam da via de biossíntese dos antibióticos Estudo dos sistema de regulação do “cluster gênico“ que codifica as proteínas envolvidas na biossíntese do antibiótico Aplicações Saúde Ambiente Indústria 12.000 novos antibióticos descobertos desde 1920 Streptomyces bactéria Gram positiva solo Aplicações Saúde Ambiente Indústria Antibióticos mais comuns produzidos por fungos: – Cefalosporina Cephalosporium spp. – Griseofulvina Penicillium griseofulvum – Penicilina Penicillium notatum Demais antibióticos naturais são produzidos por actinomicetos (bactérias filamentosas) e bacilos Gram + Classes mais vendidas: Cefalosporina (27%), macrolídeos (20%), quinolonas (17%), penicilinas (17%) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Síntese novos antibióticos e antibióticos com novas propriedades – Co-expressão de duas vias de biossíntese semelhantes no mesmo microrganismo – Antibióticos semi-sintéticos fermentação + modificação química Pesquisa de antibióticos derivados de outras fontes plantas: óleos essenciais Aplicações Saúde Ambiente Indústria Microrganismos produtores de substâncias terapêuticas: Biofármacos – Insulina – Hormônio de crescimento – IFN-alfa – IFN-beta – G-CSF – Eritropoietina – mAb human growth hormone 33% erythropoietin 17% G-CSF 17% GM-CSF 8% insulin 8% interferon alfa 17% Aplicações Saúde Ambiente Indústria 285 milhões (2010) Produção de insulina humana recombinante em bactéria (E. coli) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Aplicações Saúde Ambiente Indústria Plataformas de expressão de proteínas recombinantes em microrganismos: – E. coli – S. cerevisiae – Pichia pastoris – Pseudomonas putida – Agaricus bisporus Aplicações Saúde Ambiente Indústria Microrganismos produtores de suplementos nutricionais: Amino ácidos – Antioxidante – Soluções de infusão (tratamento) – Mercado 2,5 Mi de toneladas (US$ 9 Bi) no ano de 2008 • Ácido glutâmico (50%) – Produção Corynebacterium e Brevibacterium spp. – Melhoramento de linhagem clássico e molecular Aplicações Saúde Ambiente Indústria Modelos biológicos para estudo de patogênese e virulência – C. albicans – C. neoformans – A. fumigatus Porque? – Possuem no seu ciclo de vida células haplóide uninucleares ou fase unicelular – Possuem sistemas genéticos bem conhecidos – Genomas sequenciados – Ferramentas de biologia molecular que possibilitam estudar a fundo as vias de transmissão de sinal que controlam os fatores de virulência Sistema de transformação genética estável Modelo animal de infecção – Identificação de alvos moleculares para o desenvolvimento de novas drogas antifúngicas Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI de aplicação agrícola e ambiental Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI de interesse ambiental – Micorrizas – Biorremediadores – Fungos entomopatogênicos – Conversores de biomassa Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: relação mutualística com a planta que data de 400 milhões de anos Micorrizas (fungos de raiz) simbiose translocação de nutrientes aumenta superfície de absorção fonte de carbono fungo Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: 90% das plantas tem associação com micorrizas – Endomicorrizas (Vesicular arbuscular) (Glomeromicetos) – Ectomicorrizas (Zigomiceto, Ascomiceto e Basidiomiceto) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: micorrizas – Endomicorrizas - Glomerolomicota – Não cresce em condições de laboratório na ausência da planta (simbiontes obrigatórios) – Apressório hifa hifa intracelular – Arbúsculo (transloca nutrientes para a plantas) – Vesícula (armazenamento) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: micorrizas – Endomicorrizas – vesicular arbuscular Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental:micorrizas Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI de interesse ambiental: biorremediação – É a utilização de organismos que transformam ou acumulam compostos químicos de alto risco (xenobióticos), eliminando assim os poluentes presentes no ambiente. Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI de interesse ambiental: biorremediação – Estratégias metabólicas Transformação (composto menos tóxico) Mineralização Assimilação (utiliza composto para produzir biomassa, CO2 e água) – Fungos mais utilizados Absidia, Mucor, Rhizopus e Cunninghamella (Zigomicetos) Basidiomicetos decompositores de madeira (lignocelulolíticos) – Bactérias mais utilizadas Pseudomonas sp. (microrganismo de solo) Genes cromossomais e plasmidiais Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: biorremediação – Basidiomicetoslignolíticos madeira em decomposição Phanerochaete crysosporium Complexo lignolítico extracelular Lignina estruturalmente semelhante aos organopoluentes (hidrocarbonetos derivados do petróleo) Remediação é dependente da quebra da estrutura policíclica dos hidrocarbonetos Fungos lignolíticos tem esta capacidade Outros microrganismos fazem a assimilação ou mineralização Hidrocarboneto policíclico aromático Lignina Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: biorremediação – Basidiomicetos lignolíticos madeira em decomposição (P. crysosporium) Fungo decompositor de madeira (white-rot fungi) 14 dia Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: biorremediação Estímulo dos microrganismos já existentes no ambiente. É a introdução de microrganismos no solo ou água (aclimatados ou modificados) uso restrito • Bioaumentação ou Bioadição: • Estimulação: Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: controle biológico de pragas da lavoura Fungos entomopatogênicos Metarrhizium anisopliae (162.000 hectares) Sporothrix insectorum Cigarrinha da cana-de-açúcar Cigarrinha das pastagens Complexo quitinolítico coloniza o exoesqueleto de insetos e crustáceos Fungos entomapatogênicos alta capacidade de esporulação Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos de interesse ambiental: controle biológico de pragas da lavoura Aplicações Saúde Ambiente Indústria MI de interesse ambiental: conversão de biomassa em fertilizante, alimento e energia Bactérias e Fungos celulolíticos – Trichoderma spp. e Phanerochaete crysosporium , Cellulomonas spp. – Integrados em processos de hidrólise da biomassa vegetal (celulose) em açúcares menos complexos para que os organismos possam: • fermentar estes açúcares mais simples em etanol • biomassa celular que possa ser utilizada como suplemento alimentar animal • Conversão de resíduos orgânicos adubo na fertilização de áreas agrícolas compostagem Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos fitopatogênicos – Ciclagem de nutrientes na natureza – Simbiose antagônica e mutualística com diferentes espécies de plantas – Desde os tempos em que se iniciou a agricultura, – Grandes impactos na economia Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos fitopatogênicos: 70% das doenças de plantas são causadas por fungos Pseudo-fungos Pseudo-fungos, micélio celulósico, cenocítico – Phytophthora spp. podridão da sementes Soja, cana-de-açúcar, milho, sorgo – Peronospora spp. Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos verdadeiros Zigomicetos Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos verdadeiros Basidiomicetos Ustilago maydes (Modelo biológico) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Mecanismos de infecção do tecido vegetal – Fungos fitopatogênicos celulolíticos Aplicações Saúde Ambiente Indústria Aplicação industrial Aplicações Saúde Ambiente Indústria Aplicação dos fungos e bactérias na produção de enzimas industriais, ácidos e compostos orgânicos em geral: – Ácido cítrico: conservante (indústria alimentícia) – Aspergillus spp. A. niger – Fitase: disponibiliza P (alimentação animal) – Pichia spp. – Riboflavina (vitamina) – Ashbya gossypii – Etanol: fermentação alcoólica (energia) – Leveduras Saccharomyces cerevisiae – Conversão de biomassa (celulose e lignina) em energia (etanol) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Enzimas Microrganismo Uso Industrial Alfa-amilase Aspergillus spp. Detergentes, xaropes Celulases Trichoderma spp. Alimentícia, energia, papel celulose Invertase S. cerevisiae Alimentícia Lactase S. fragilis Farmacêutica, alimentícia Lipase A. niger Detergentes, couro, produção queijo Oxidases A. niger Braqueamento de papel e tecido Pectinase A. niger Alimentícia Proteases A. oryzae Couro, alimenticia, suplemento digestivo Renina Mucor Produção de queijos Aplicações Saúde Ambiente Indústria Aplicação dos fungos e bactérias na produção de enzimas industriais, ácidos e compostos orgânicos em geral: – Produção de enzimas termotolerantes Uso em processos industriais Robustez Microrganismos termófilos, ou seja que crescem em temperaturas superiores a 70 ºC MI podem ser uma fonte de extremozimas Aplicações Saúde Ambiente Indústria Enzimas podem ser produto do metabolismo primário ou secundário dos microrganismos: – Metabolismo primário: o produto acumula junto com o crescimento celular. Subproduto de crescimento celular – Metabolismo secundário: o produto é sintetizado depois que o microrganismo acumula biomassa, ou seja depois que há um certo grau de crescimento. Usa o metabólito primário como substrato para síntese do metabólito secundário Ex.: antibióticos Aplicações Saúde Ambiente Indústria Indústria alimentícia: – Pão (S. cerevisiae) – Vinho (S. cerevisiae) – Cerveja (S. cerevisiae) – Extrato de levedura Flavorizantes e alimentação animal (S. cerevisiae) Bioenergia – Produção de etanol – Etanol celulósico Capacidade fermentativa Aplicações Saúde Ambiente Indústria S. cerevisiae – Anaeróbio facultativo Pão Vinho Etanol Suplemento Alimentar Flavorizantes Aplicações Saúde Ambiente Indústria BIOMASSA ÁLCOOL Leveduras utilizam a glicose em primeira instância e outros açúcares depois Aplicações Saúde Ambiente Indústria S. cerevisiae: levedura da cerveja Lager Ale Levedura do fundo Baixa temperatura (3-10) Teor alcoólico > 6% Levedura flutuante Fermentação 10-21 Teor alcoólico < 4% Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos como biofábrica para produção de proteínas recombinantes: – Leveduras S. cerevisiae, K. lactis e Pichia pastoris (hospedeiro) Vantagens: ciclo de vida rápido Organismo unicelular fácil manipulação Secreta o produto recombinante para o meio de cultura Parâmetros de fermentação em larga escala já desenvolvidos Muitos promotores induzíveis e constitutivos são conhecidos e utilizados (S. cerevisiae) Promotor induzido por metanol (P. pastoris, levedura metilotrófica) Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos como biofábrica para produção de proteínas recombinantes: O que é necessário para produzir proteína recombinante em fungos: Promotor – gene heterólogo - terminador Aplicações Saúde Ambiente Indústria Fungos como biofábrica para produção de proteínas recombinantes: – Leveduras e fungos filamentosos produção de proteínas recombinantes Fungos tem maquinário secretor muito eficiente quimioheterotróficos Capacidade destes fungos sofrerem transformação genética estável (integração no genoma) – Leveduras mais fácil – Fungos filamentosos mais complicado – Transformação por meio de Agrobacterium Aplicações Saúde Ambiente Indústria Metagenômica Acesso a diversidade microbiológico não cultivável – Escolha de um nicho ecológico – Extração de DNA total da comunidade microbiana – Sequenciamento de alta performance (deep sequencing) – Metagenômica funcional Aplicações Saúde Ambiente Indústria Colonização de tecidos vivos Secretar substâncias de interesse parao homem Contribuir para a manutenção do equilíbrio no meio ambiente Produção de Proteínas recombinantes Aplicações Saúde Ambiente Indústria
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