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Universidade Federal do Amazonas-Ufam Instituto de Ciências Exatas e Tecnologia-ICET Farmácia Bioquímica ENZIMAS Itacoatiara-AM Setembro 2018 Profª. Ketlen Oliveira Bastos Enzimas São proteínas que atuam como catalisadores de reações bioquímicas e, como tal apresentam inúmeros substratos que entram nas reações do metabolismo. Exceção de alguns RNAs. Alguns tipos de RNA podem atuar como enzimas (ribozimas), geralmente catalizando a quebra e a síntese de ligações fosfo-diéster. Enzimas As proteínas são os catalisadores mais eficientes conhecidos. Podem aumentar a velocidade de uma reação por um fator de até 1020 mais do que as reações nãoum fator de até 10 mais do que as reações não catalisadas. Catalisadores não-enzimáticos, normalmente aumentam a velocidade da reação de 102 a 104. Enzimas As enzimas são altamente específicas, a ponto de poderem distinguir esterioisômeros de um determinado composto.composto. Algumas enzimas catalisam uma família de reações similares. Aspectos Cinéticos e Termodinâmicos Praticamente todas as reações químicas têm uma barreira denominada “energia livre de ativação”, separando reagentes dos produtos. Energia de ativação: É a diferença entre a energia dos reagentes e a dos produtos de uma reação o qual fornece Energia de ativação: É a diferença entre a energia dos reagentes e a dos produtos de uma reação o qual fornece a variação de energia (variação de energia livre padrão - Go). A velocidade das reações dependem da energia livre de ativação (Go ), energia necessária para iniciar a reação.++ Aspectos Cinéticos e Termodinâmicos Uma reação é favorável ou não dependendo de sua variação de energia livre (Go). A Go é a diferença de energia entre reagentes e a dos produtos. A Go revela se a reação é favorável. A Go revela se a reação é favorável. Go negativa reação exergônica liberação de energia. Go positiva reação endergônica consome energia. Uma reação favorável (S P) não quer dizer que ela ocorre em velocidade mensurável. Aspectos Cinéticos e Termodinâmicos As enzimas participam da reação, mas não são consumidos nas reações. S + E P + E As enzimas aceleram a velocidade das reações. As enzimas aceleram a velocidade das reações. As enzimas fornecem uma rota de reação alternativa, energeticamente favorável, diferente da reação não catalisada. Não podem alterar a constante de equilíbrio (K) ou a variação de energia livre (Go). + + Aspectos Cinéticos e Termodinâmicos Diferença entre a energia livre de S e P Energia de ativação com enzima Energia de ativação sem enzima SS PP TT de S e P Caminho da Reação Estado de Transição A energia de ativação é a diferença de energia livre entre o reagente e o intermediário rico em energia (T). Expressão da Velocidade da Reações A velocidade das reações pode ser expressa em termos da variação na concentração de um reagente (desaparecimento) ou produto (aparecimento) em um determinado intervalo de tempo. A + B P A + B P Expressão da velocidade das reações Velocidade = - [A] - [B] [P] t t t = = Velocidade = [A]f [B]g Determinado experimentalmente Constante de velocidade Como os Substratos se Ligam as Enzimas A ligação do complexo leva a formação das espécies do estado de transição. E + S ES EP E + P do estado de transição. O substrato liga-se, normalmente por interações não covalentes, a uma pequena porção da enzima chamada sítio ativo. Como os Substratos se Ligam as Enzimas A enzima liga-se ao substrato e forma um complexo. E + S ES EP E + P O sítio ativo liga o substrato, formando um complexo (ES). O complexo ES é convertido em enzima – produto (EP), que posteriormente se dissocia em enzima (E), produto (P). Como os Substratos se Ligam as Enzimas Modelo chave-fechadura: supõem um alto grau de semelhança entre o formato do substrato e a geometria do sítio de ligação na enzima. Não considera a flexibilidade conformacional das proteínas Como os Substratos se Ligam as Enzimas Modelo ajuste induzido: leva em conta a flexibilidade tridimensional da enzima. A ligação ao substrato induz a uma mudança conformacional na enzima resultando em encaixe complementar. Como os Substratos se Ligam as Enzimas Depois que o substrato é ligado e o estado de transição é subsequente formado, a catálise pode acontecer. O substrato se liga a enzima e suas ligações são reorganizadas, formando o estado de transição,reorganizadas, formando o estado de transição, catalizando apenas um tipo de ligação. Cada enzima tem seu próprio e único mecanismo de catálise (especificidade). Propriedades das Enzimas A atividade de uma enzima depende de sua integridade de sua conformação protéica nativa. Se uma enzima é desnaturada ela pode perder sua atividade catalítica.sua atividade catalítica. As enzimas possuem peso molecular que variam de 12.000 a até mais de 1 milhão. Algumas enzimas não requerem nenhum outro grupo químico além de seus resíduos de aminoácidos. Propriedades das Enzimas Algumas enzimas precisam de outras moléculas além da proteína, para sua atividade enzimática. Haloenzimas: Se refere a enzimas ativas com seu componente não protéico. Apoenzimas: se refere a enzimas inativas sem seu Apoenzimas: se refere a enzimas inativas sem seu componente não protéico. Co fator: Se o componente não protéico for um íon metálico (ex. Zn2+ ou Fe2+) Coenzima: Se o componente for uma molécula orgânica pequena (derivadas de vitaminas). Propriedades das Enzimas Estrutura Estrutura EnzimáticaEnzimática Holoenzima Não-proteínaProteína Pode ser: Enzimas ativas com componente não protéico. Se covalente Apoenzima ou Apoproteína Grupo Prostético Co-substrato: ligação transitória com a enzima. Grupo prostético: ligação permanente. Pode ser: • íon inorgânico – co-fator • molécula orgânica - coenzima Propriedades das Enzimas Especificidade: As enzimas são altamente específicas, interagindo com um ou alguns grupos de substratos e catalisando apenas um tipo de reação. O grupo de enzimas produzidas em uma determinada célula O grupo de enzimas produzidas em uma determinada célula define quais as vias metabólicas que vão ocorrer na célula. Localização: Muitas enzimas estão localizadas em organelas específicas dentro das células. A compartimentalização isola o substrato ou o produto da reação de outras reações competitivas. Nomenclatura e Classificação Adição do sufixo “ASE” ao nome do substrato: Ex: - gorduras (lipo - grego) – LIPASE - amido (amylon - grego) – AMILASE Nomes arbitrários: Ex: - Tripsina e pepsina – proteases Nomenclatura e Classificação Comissão de Enzimas (EC) da União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUBMB) nomeia e classifica (número classificatório e nome sistemático). Número classificatório código com 4 dígitos que Número classificatório código com 4 dígitos que caracteriza o tipo de reação catalisada: 1° dígito - classe 2° dígito - subclasse 3° dígito - sub-subclasse 4° dígito - indica o substrato Nomenclatura e Classificação 1. oxirredutases: catalisam reações de oxirredução. Nomenclatura e Classificação 2. Transferases: catalisam transferência de grupos contendo C, N ou P. Piruvato Alanina α-cetoácidoAminoácido Aminotransferase 3. Hidrolases: catalisam a quebra de ligações por adição de água. Piruvato AlaninaAminotransferase Nomenclatura e Classificação 4. Liases: Catalisam a quebra de ligações C-C, C-S ou C-N. 5. Isomerases: catalizam racemização de isômeros ópticos ou geométricos. Nomenclatura e Classificação 6. ligases: catalisam a formação de ligações entre o C e o O, S ou N, acoplados a hidrólise de ATP. Piruvato carboxilase Nomenclatura e Classificação Influencias sob a Atividade Enzimática pH: Devido a variação do estado de ionização do sistema. Temperatura: Pode promover o aumento da taxa de reação ou levar a perda da estabilidade da enzima. Concentração dos substratos: Concentração dos substratos: O aumento da concentração do substrato aumenta a velocidade da reação até uma velocidade máxima. Concentração das enzimas: A velocidade de transformação do substrato em produto varia com a quantidade de enzimas. Presença de inibidores: Reduzem a atividade da reação. Inibidores enzimáticos Inibidor é qualquer substância que reduz a velocidade da reação devido interferência na enzima. INIBIDORES REVERSÍVEIS IRREVERSÍVEIS COMPETITIVOS NÃO COMPETITIVOS Inibidores enzimáticos Inibidores reversíveis: Inibidor competitivo: o inibidor é semelhante a estrutura do substrato e se liga ao sítio ativo. Inibidor não competitivo: o inibidor se liga a enzima em um sítio diferente ao sítio ativoem um sítio diferente ao sítio ativo Regulação da Atividade Enzimática A regulação da velocidade das reações enzimáticas é essencial para o organismo coordenar seus inúmeros processos metabólicos. A maioria das enzimas respondem às mudanças nas concentrações do substrato.nas concentrações do substrato. Algumas respondem a efetores alostéricos, modificações covalentes, ou ainda apresentam sua velocidade de síntese ou degradação alterada. Regulação da Atividade Enzimática Sítios alostéricos de ligação: As enzimas alostéricas são reguladas por moléculas chamadas de efetores ou modificadores ou moduladores. O efetor se liga a um sítio que não um sítio catalítico. A presença de um efetor alostérico pode alterar a afinidade da enzima por seu substrato ou modificar a capacidade catalíticaenzima por seu substrato ou modificar a capacidade catalítica máxima da enzima. Efetores positivos: aumentam a atividade enzimática. Efetores negativos: diminuem a atividade enzimática. Efetores homotrópicos: quando o substrato atua como efetor. Efetor heterotrópico: quando o efetor é diferente do substrato. Efetor heterotrópico: quando o efetor é diferente do substrato. Regulação da Atividade Enzimática Regulação da Atividade Enzimática Modificação covalente: As enzimas podem ser reguladas pela adição ou remoção de grupos fosfatos de resíduos específicos de serina, treonina ou tirosina. Dependendo da enzima a forma fosforilada pode ser mais Dependendo da enzima a forma fosforilada pode ser mais ou menos ativa que a não fosforilada. Indução ou repressão da síntese de enzimas: As células podem regular a quantidade de enzimas presentes, em geral, alterando a velocidade da síntese de enzima. Alterações dos níveis enzimáticos, resultantes da alteração da síntese protéica podem levar horas a dias. ATIVIDADE: Fazer um resumo do capitulo 5 seção I, II (nome sistemático: fazer todas as 6 reações datodas as 6 reações da figura 5.1 escrita no trabalho) ,III, IV, V,VII e VIII entregar DIA 20/09/18. Valendo uma nota na soma dos relatórios.
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