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Microbiologia dos diferentes sítios anatômicos
Maior colonização:
Trato gastrointestinal 
Boca 
Pouca quantidade:
Olho saprófitas
Microbiota normal: 
Termo microbiota não foi instituído há muito tempo
Antes era flora ou microflora: bactérias eram consideradas vegetais primitivos
Normalmente residem na superfície ou no interior do corpo humano e de outros animais 
Não causam doenças em condições normais 
Linhas de defesa
Primeira: pele, membrana mucosa, secreção da pele e mucosas, lágrima, favorece a destruição de bactérias
-Barreiras físicas, químicas, microbiota normal
-fluxo urinário
-pH do estômago 
-lisozima
-Peroxidase
Segunda: células que fazem fagocitose, proteínas antimicrobianas, resposta Inflamatória: neutrófilos, macrófagos
Terceira: linfócitos e anticorpos 
Quebra da barreira
Porta de entrada: pode atravessar a membrana mucosa do trato respiratório, conjuntiva, gastrointestinal, lesão, via parenteral, geniturinário. 
Número de microrganismos: quantidade pequena fagocita,
 Aderência: cápsula (ex: klebisiella, não deixa os epítopos expostos), as que produzem biofilme, fímbria, componente da parede celular
Dano na célula hospedeira: efeito direto e indireto, endotoxina, exotoxina
Porta de saída
Adaptação da microbiota ao hospedeiro
Provavelmente por interações bioquímicas entre a superfície de componentes da bactéria e o hospedeiro, tendo funções de aderência. 
Razões para localizações em particular:
Tropismo tecidual: aquilo que tem na superfície da bactéria vai encontrar receptor em célula específica 
Componentes da superfície: cápsulas, fímbrias, componentes da parede celular, etc funcionam como ligantes a receptores específicos localizados no sítio de colonização 
Exemplo
Glycocálix: cápsula
Streptococcus pyogenes: ácido lipotecoico: todo gram positivo
Fímbria de ligação: Neisseria gonorrhoeae
Relações microbianas
Parasitimo: benefício unilateral, só se favorece por estar no hospedeiro
Comensalismo: habitat
Mutualismo
Simbiose 
Sinergismo microbiano: O efeito de 2 micro-organismos é maior que um agindo sozinho
Ex: Estreptococcus se liga no esmalte dentário, ela tem um receptor de ligação para outra bactéria (mitis, salivaris) doença periodontal
Antagonismo microbiano: competição, uma cresce para inibir a outra
Vagina: pH de 3,5 a 4,5
Lactobacilos inibem o super crescimento de Candida albicans
Trato respiratório superior 
Estreptococcus A- Hemolíticos inibem os estreptococcus B-Hemolíticos 
Intestino Grosso
E.coli bacteriocinas Inibe patógenos intestinais como Salmonalla spp e Shigella Spp
Simbiose
Comensalismo: m.o é beneficiado e o homem não é afetado
Ex:Corinebactérias no olho e micobactérias saprófitas no ouvido e genitais externos 
Mutualismo: ambos são beneficiados 
EX:E.coli recebe nutrientes do organismo humano e sintetiza vitamina K e B
Parasitismo: m.o é beneficiado e o homem é prejudicado
EX:Microrganismos patogênicos 
Oportunismo: fazem parte da microbiota normal, mas causam doença quando:
 O sistema imune está suprimido por doenças ou terapias
Ex: Pneumocytis carinii em pacientes HIV positivos
Se atingem sítios estéreis por meio de rupturas na pele e mucosas ou uso de métodos invasivo
-Cateter
Ex: Escherichia coli na bexiga (cistite) 
Sítios estéreis
Tecidos, órgãos e fluidos do corpo normalmente isentos de micróbios 
 Ouvidos médio e interno, interior do olho, medula óssea
Microbiota da cavidade oral
Complexa: Cerca de 500 grupos bacterianos 
Diversidade de grupos bacterianos
Fatores relacionados:
-Alta umidade
-Temperatura constante ótima para o organismo
-pH próximo da neutralidade 
-Disponibilidade de nutrientes
Varia com:
Idade
Hábitos alimentares
Hormônios
Fluxo Salivar
Condições imunológicas
Higienização
Alcoolismo
Distribuição:
Dente: Streptococcus mutans (S.mutans. S.sobrinus, S.cricetus, S.rattus) e Streptococcus sanguis
Língua: S.salivarius,S.mitis e e Veillonella spp. Porphyromonas spp e Prevotella spp ( em pequenos números)
Membranas mucosas: S.oralis e S.sanguis 
Cárie: fator anatômico, hipomineralização
Microbiota conjuntival
Praticamente estéril
Proteção: lágrima, que produz imunoglobulina, lactoferrina e lisozima
Desequilíbrio entre microbiota residente e transitória doença 
Microbiota do trato respiratório
Narinas: S. epidermidis, S aureus, corinebactérias
TRS (nasofaringe): Estreptococcus alfa ou não hemolíticos, Neisseria spp e algumas vezes patógenos como Streptococcus pneumoniae, Haemophilis influenzae e Neisseria meningitidis
Impedir que beta hemolíticos causem infecção 
Algumas causam infecção quando atingem a o trato inferior
TRI (traqueia, brônquios e tecidos pulmonares): Virtualmente livres de m.o
Microbiota da pele
Regiões úmidas (axilas, virilhas, espaços entre os dedos dos pés, genitália e períneo): predominam organismos gram - positivos como Corynebacterium sp. Staphylococcus epidermidis e Micrococcus sp.
Regiões secas: Staphylococcus epidermidis e Propionibacterium acnes 
S. aureus: pode ser encontrado nas mão principalmente de indivíduos que são portadores dessas na narina
Maioria reside na superfície do estrato córneo e na parte superior dos folículos pilosos ( microbiota transitória- não reside normalmente, microrganismos que eu entro em contato)
Algumas, entretanto, residem mais profundamente (Microbiota residente).Estas tem a função de recolonizar a pele quando as bactérias mais superficiais são removidas, por exemplo, após uma lavagem cuidadosa
Essa conduta pode diminuir cerca de 90% o número total de microrganismos existentes na pele. Dentro de oito horas, contudo, o número destes é normalizado. 
Uso de sabonete antisséptico?
- Uso Controverso
-Não indicado para todos e nem uso diário
-Retira a microbiota residente 
-Favorece o surgimento de microrganismo resistente 
-Indicado para pessoas que atuam em cirurgias: intenção de reduzir ao máximo de microrganismo, pacientes que tem muito furúnculo 
-Triclosan: estudo da FDA retirada
Microbiota do trato urinário
Bexiga: normalmente estéril???
-Estudo através de sonda e punção extra- púbica: há bactérias 
-Actinobaculum relacionada com casos de infecção urinária 
Uretra: enterobactérias (E.coli), lactobacilos, difteróides, estreptococos, Enterococcus spp, Neisseria spp, não patogênica, ECN, ocasionalmente S. Aureus e anaeróbios. Relatos de Mycoplasma, Ureaplasma, Mycobacterium smegmatis, Gardnerella vaginalis e leveduras 
Trato genital
A variação da microbiota depende da influenccia hormonal nas diferentes idades:
Recém nascido é estéril
Recém nascido após 24 h: organismos saprófitas como difteróides, micrococos e Estreptococcus não hemolíticos 
2 a 3 dias após nascimento: lactobacilos devido ao estrógeno materno. Após esse período, o estrógeno é excretado diminui lactobacilos Aumenta pH microbiota normal mista 
Puberdade até a menopausa: glicogênio reaparece diminui pH microbiota adulta normal (anaeróbios, lactobacilos, difteróides, micrococos,ECN, Enterococcus faecalis, enterobactérias, Gardnerella vaginalis, estreptococos microaerófilos, micoplasmas, ureaplasmas e leveduras 
Gravidez: microbiota mais anaeróbia com aumento do número de lactobacilos
Pós - menopausa: queda do estrógeno diminuição de lactobacilos e predomínio de difteróides ( Bifidobacterium spp.) microbiota semelhante crianças
Desequilíbrio
Hormonal e do pH vaginal, alguns microrganismos da microbiota normal podem vir a ser considerados como patógenos importantes, como Gardnerella vaginalis e leveduras 
Gardnerella: coco bacilo gram variável 
MOBILLUNCOS (marido da gardnerella): bacilo gram negativo curvo, vaginose bacteriana 
Microbiota do trato gastrointestinal
-Varia de acordo com: 
tipo de parto
uso de antibiótico
Genética
Sistema imune
Aleitamento materno ou artificial
Diferença de acordo com a porção 
Esôfago: Praticamente estéril: Bactérias transitórias
Estômago: MO geralmente transitórios 
-HELYCOBACTERPYLORI: habitante de 50% da população mundial (comensal ou patogênica)
Duodeno: é praticamente estéril com uma microbiota esparsa e provavelmente transitória, variando
-As Bactérias que são mais frequentemente encontradas: Streptococcus, Lactobacillus e Bacteroides .Níveis maiores de bactérias no duodeno pode ser o reflexo de anormalidades no sistema digestivo (por exemplo, acloridria)
Escassez de microrganismos no trato gastrointestinal superior 
Barreira Física: peristáltica
Barreira química: presença de bile
-As bactérias do colón sintetizam vitaminas como biotina, ácido fólico, tiamina, B12 e K e fermentam carboidratos indigeríveis (fibras) em ácidos graxos de cadeia curta que constituem fontes de energia para o hospedeiro.

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