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DNA replicação UFRRJ – Dep. de genética Disciplina – Genética Básica Profa Marilene Marilene.ufrrj@gmail.com Descoberta de Watson e Crick • Descoberta mais importante do século XX • Prêmio Nobel para Maurice Wilkins (1962) “Não escapou à nossa percepção que o pareamento específico que postulamos sugere imediatamente um possível mecanismo de cópia para o material genético” (Watson e Crick, 1953) Estrutura do DNA Replicação do DNA • Os modelos hipotéticos da replicação • Semiconservativa ( o modelo de Watson e Crick) - dupla hélice contém um filamento original e um recém-sintetizado • Conservativa – a mólecula parental é conservada e uma única dupla hélice é sintetizada constituindo dois filamentos recém sintetizados • Dispersiva – as moléculas constituem em filamentos cada um contendo segmentos tanto DNA parental tanto do recém-sintetizado Experimento de Meselson-Stahl • O modelo de replicação é semiconservativo, dispersivo ou conservativo??? • Meselson e Stahl (1958) Ideia • Permitir que duas moléculas parentais contendo uma densidade conhecida se repliquem em um meio contendo nucleotídeos de densidade diferentes. • Se o DNA se replica semiconservativamente a molécula terá peso intermediário. Replicação do DNA • Resultado após duas gerações fitas com peso intermediário tanto quanto de baixa densidade foram encontrados – como previsto por Watson e Crick. • Concluiu-se que: o DNA se replica semiconservativamente Replicação do DNA Replicação semiconservativa • DNA é uma dupla hélice • O desenrolar dos dois filamentos irá expor as bases únicas de cada filamento • Pareamento com nucleotídeos livres • A – T e C – G • Cada filamento será um molde • Cada mólecula de DNA possui uma cadeia parental e uma recém sintetizada Replicação do DNA Replicação semiconservativa do DNA Forquiha de replicação • um zíper, ou forquilha, de replicação será encontrado na molécula de DNA durante a replicação. • O que é forquilha? É o local no qual a dupla hélice é desenrolada para produzir os dois filamentos únicos que servem como moldes para a cópia. Replicação do DNA • Como as bases nitrogenadas são levadas para o molde da dupla hélice? • Uma enzima adiciona desoxirribunocleotídeos à ponta 3’ de uma cadeia crescente de DNA. • O substrato para a polimerase são: dATP, dGTP, dCTP e dTTP. Replicação do DNA • Cinco DNA polimerases são conhecidas em E. coli • Três atividades: 1. polimerase – catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5’ para o 3’ 2.exonuclease – 3’ para 5’, que remove os pareamentos errados de bases 3. exonuclease – 5’ para 3’, que degrada a dupla hélice da DNA Pol III é quem catalisa a síntese na forquilha de replicação Replicação do DNA A DNA polimerase pode sintetizar a cadeia, mas não pode iniciar a replicação. Esquema geral da replicação do DNA • DNA polimerase III se move atuando na forquilha de replicação • A dupla hélice está continuamente se desenrolando adiante da enzima para expor outros trechos de DNA. • A DNA polimerase só atua adicionando nucleotídeos na ponta 3’ crescente. Lembre-se que a fita tem polaridade inversa: 3’ – 5’ 5’ – 3’ Como a replicação ocorre para o filamento 5’-3’? Replicação do DNA • A maquinaria da replicação requer que a síntese de ambos os filamentos ocorra na forquilha de replicação. • A síntese que se move se afastando do forquilha não vai durar muito. • Filamento de replicação contínua ou leading – 3’ – 5’ • Filamento de replicação descontínua ou leagging – 5’-3’ Replicação do DNA Replicação do DNA 3’ - 5’ Filamento contínuo Como a replicação ocorre para o filamento 5’-3’? • O crescimento também ocorre na ponta 3’ • Polimerase sintetiza um segmento – e move-se para a ponta 5’ • Trechos curtos de DNA recém-sintetizados (1000 a 2000 nucleotídeos) – fragmentos de recém sintetizados Replicação do DNA Replicação do DNA Lembre-se a DNA polimerase pode ampliar uma cadeia, mas não pode começar uma cadeia! • A síntese é iniciada por um primer • Primer – cadeia curta de oligonucleotídeos • Sintetizada por um grupo de proteínas chamado primossomo - enzima primase (RNA polimerase) • Filamento contínuo só um primer é necessário! • Filamento descontínuo cada fragmento de okazaki precisa de um primer! Replicação do DNA • A DNA pol I remove os primers • A DNA ligase une as pontas catalisando uma ligação fosfodiéster Replicação do DNA Lembre-se que a DNA polimerase também tem função de revisar a fita de DNA em síntese • Menos de um erro por 1010 nucleotídeos inseridos • Motivo da precisão: • A DNA pol I e III são também exonucleases – 3’-5’ Estudando o replissomo - peculiaridades procariontes • E. coli • Genoma tem 5 milhões pb • Cerca de 2000 nucleotídeos/segundo • Duas forquilhas de replicação • Complexos subunitários – holoenzima polimerase III e muitas proteínas acessórias. Ex: Grampo deslizante - circunda o DNA – mantém a DNA pol III ligada a molécula de DNA SSB (proteína de ligação unifilamentar) – estabiliza o desenrolar da fita Helicases - rompem as pontes de hidrogênio Proteínas de ligação unifilamentar – impedem a restruturação da dupla hélice Topoisomerases – liberam a tensão da torção extra causada pela desilicoidização. Ex: girases. • Onde a replicação se inicia? • Origens • Procariontes - E. coli – oriC • Ligação da DNAa – sequência de 13pb • Eucariotos e procariotos – processo de replicação semelhantes: semiconservativo, filamento continuo e descontínuo... • Os componentes do replissomo são bem similares • Porém tem função adicional em eucariontes: Pode desmontar e remontar os complexos proteína-DNA chamado nucleossomos Estudando o replissomo - peculiaridades eucariontes • O replissomo tem que desmontar os nucleossomos e remontá-los • Distribui-se aleatoriamente as Histonas das molécula parental • CAF-1 (fator 1 de montagem da cromatina) – proteína que se liga a novas histonas e as conduz para a forquilha de replicação • Ligada a PCNA antígeno nuclear de proliferação celular • Eucariontes • ORC – complexo de reconhecimento de origem • Leveduras – 3 proteínas para começar a motantar o replissomo • Cdc6 e Cdt1 + ORC recrutam a helicase... • Cdc6 e Cdt1 • São sintetizadas durante a mitose avançada • O replisssomo só poderá ser montado antes da fase S • Na fase S – a Cdc6 e a Cdt1 são degradadas • Leveduras • Bactérias terminam a replicação em 20-40 min • Eucariontes – 1,4h em leveduras a 24h em células animais • Os eucariontes têm muitas origens de replicação • Ex: leveduras – 400 origens em 16 cromossomos Término da replicação • A síntese do filamento contínuo ocorre até a ponta • E quanto ao descontínuo? • Quando o último primer é removido resta uma ponta unifilamentar • Praticamente todos os eucariontes têm • TTGGGG • Humanos • De 10 a 15kb da sequência TTAGGG
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