Resumo de Bioquímica estrutural

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Resumo de Bioquímica estrutural
Metabolismo é um conjunto de sínteses de degradação
Anabolismo é o conjunto de sínteses de macromoléculas
Catabolismo é o conjunto de vias de degradação que geram energia
Escala de Ph, tampões, ácidos, bases. 
Ácidos vão doar prótons e bases vão receber os prótons liberando o OH-
Bases fortes se dissociam em valores altos de Ph
Bases fracas se dissociam em valores baixos de Ph 
Acidose e Alcalose 
Quando aumenta o próton no sangue, ele fica mais ácido e o Ph desce. 
Na acidose o Ph diminui e na alcalose ele aumenta
Acidose respiratória > PCO² alto | Alcalose respiratória > PCO² baixo Acidose metabólica >HCO³ baixo| Alcalose metabólica >HCO³ alto
Os principais tampões do sangue são: hemoglobina, proteínas plasmáticas, bicarbonatos e fosfatos.
A acidose ocorre quando aumenta a produção ou diminuição da excreção de ácidos, ou, aumento da excreção de bases. 
A alcalose ocorre pela perda de cálcios por vômitos, desidratação, hiperventilação.
Proteínas 
São constituídas de 20 aminoácidos 
Faz a ligação peptídica do grupo amino de um Aa com o grupo carboxila de outro aa 
A proteína tem funções de: catalisadores, elementos estruturais, sistemas contrateis, armazenamento, hormônio, veiculo de transporte, proteção, nutrição.
Estrutura primária: aminoácidos se ligam em cadeia 
Estrutura secundária: são organizadas em duas estruturas -hélice e Folha- ·, que são mantidas pela ponte de H+;
-hélice > segmentos de aa, onde os Radicais ficam para o lado de fora da hélice; Folha- > é uma cadeia organizada em ‘’zigue- zague’’, flexível e mantida por pontes de H+.
Estrutura terciaria: os aminoácidos estão distantes entre si, ocorre em proteínas globulares. Mantém-se estável pelas pontes de H+, -hélice, Folha- e interações complementares.
Estrutura quaternária: surge nas proteínas oligoméricas, é a união de duas ou mais estruturas terciárias. 
Desnaturação é a perda dos níveis estruturais da proteína, ocorre por interações de ureia, Ph, etanol, calor, sulfato de amônio, etc.
Enzimas
Catalisadores são substancias inorgânicas que serão absorvidas em uma reação
Enzimas são moléculas orgânicas e não vão ser consumidas durante a reação química, nem alterar a natureza das reações.
Uma reação química precisa de um reagente, energia e produto.
O nível de energia do produto deve ser menor que o nível de energia dos reagentes 
Enzimas são catalisadores eficientes e seletivos, catalisam uma única reação que é especifica.
Enzimas oxirredutases catalisam a reação de transferência de elétrons
Enzimas transferase catalisam a reação de transferência de grupamentos funcionais
Enzima hidrolase catalisam reações de hidrólise de ligação covalente
 A enzima e o substrato devem fazer a ligação chave-fechadura, onde o substrato se encaixa no sitio catalítico da enzima formando o complexo enzima – substrato e assim formar o produto
O substrato pode formar de 1 a 3 produtos, onde cada um terá uma reação química, pois cada enzima é diferente.
A reação química deve se dar por complexo enzima substrato: E+S ESEPE+P .
Centro ativo é uma região específica da proteína onde ocorre a reação química, é caracterizada por: fenda tridimensional sitio ativo, microambientes inigualáveis, interações fracas entre substrato e a enzima.
Para diminuir a velocidade de uma reação deve-se retirar o substrato, alterar a estrutura da enzima e diminuir a atividade enzimática. 
O inibidor é uma molécula que se liga no sitio ativo da enzima e impede a entrada do substrato, assim impedindo o produto final.
Inibidor irreversível é seletivo e se ligam às enzimas deixando-as inativas, agindo como um grupo funcional no sitio ativo bloqueando a entrada do substrato (impede a ligação chave – fechadura).
Inibidor reversível se diferencia no mecanismo que diminui a atividade da enzima 
Inibidor competitivo vai se ligar ao sitio ativo competindo o espaço na entrada do substrato, isto alterará a reação e modificará o km, porém sem alterar a velocidade máxima.
Inibidor não competitivo ocorre quando a molécula se liga em qualquer ponto da enzima que não seja o sitio ativo, ela não vai impedir a entrada do substrato, porém vai modificar a forma da enzima dificultando a catálise. 
Quando aumenta a velocidade máxima da reação, aumenta o substrato em uma velocidade constante ate a formação de produto.
Modulação alostérica ocorre em enzimas com sitio de modulação ,se liga a forma não –covalente que pode ser positivo ou negativo ; a ligação do modulador modifica a estrutura espacial da enzima c/os substratos . O modelo mais comum é o de inibição feed-back .
Isoenzimas se diferem na sequencia de aminoácidos ,mas catalisam a mesma reação . Tem diferentes valores de km e regulação diferentes.
NP2 
Carboidratos 
São compostos que tem a formula (CH²0)n ,são chamados de Hidrato de Carbono
A classificação que (maybe) será pedida na prova :
- Tamanho : monossacarídeos ,oligossacarídeos e polissacarídeos 
- Pode ser : trioses,tetroses, pentoses, hexoses e heptoses
- grupo funcional : aldeídos ou cetonas
Tem função de : fonte de ATP , armazenamento de ATP , estruturação de ácidos nucleicos e são encontrados na parede celular ,participam de interações célula-célula.
O papel deles no organismo é de preservar proteínas ,preservar massa muscular e combustível para o SNC .
As plantas são os principais fornecedores de carboidrato
Podem ser aldeídos ou cetonas (grupo funcional organico)
Carboidratos comum da alimentação humana são : sacarose, glicose e frutose ; são chamados de acúcares .
O carboidrato mais simples é o monossacarídeo (aldoses ou cetoses )
Podem ser trioses ,tetroses ,pentoses ,hexoses ou heptoses ( tem que contar quantos carbonos possuem para classificar ).
Fornece energia na forma de ATP 
O carbono assimétrico pe aquele que faz ligação com 4 átomos diferentes ( sem terem a mesma molécula),isto torna os carboidratos ativos.
Para o carboidrato ser armazenado tem que estar na forma de monossacarídeo ,por exemplo não há enzima que digere celulose ,então não armazenará ,porque não vai virar monossacarídeo
Simbiose é quando 2 organismos vivos tem co-existência e um aproveita o outro.
A vaca tem microorganismos que fazem simbiose e quebram a celulose fazendo com que a vaca consiga quebrar a molécula em monossacarídeos ,conseguindo armazenar a ATP.
Identificar os carboidratos contando os carbonos
- frutose é cetona ;
- glicose / galactose são aldeídos ;
- todas são hexoses ,possuem 6 carbonos
- todas tem isomeria D , a formula delas é idêntica e o que muda são as hidroxilas (OH) 
D ou L 
- para saber deve-se observar o carbono mais distante da função 
- L ,a hidroxila fica do lado esquerdo 
- D , a hidroxila fica do lado direito .
Amido 
Amilase salivar quebra a molécula de amido em pedaços menores 
Amilase pancreática faz a digestão que não foi terminada e quebra em monossacarídeos que serão armazenados em forma de ATP 
O excesso de ATP é guardado em forma de glicogênio ,só que quando passa o limite é guardado em tecido adiposo 
Quando a amilase salivar cai na cadeia de aminoácido ela desnatura ,dificilmente voltando a forma normal .
Monossacarídeos 
São solúveis em h20
Possuem de 3 a 8 carbonos
São classificados em trioses ,tetroses,pentoses ,hexoses e heptoses.
A glicose vai coexistir em cadeia aberta , e 
Na , a OH fica para baixo do plano do anel e a fica para cima do plano do anel .
Glicose forma glicogênio ,fornece ATP para o metabolismo celular ,é transformada em lipídio 
Frutose vira glicose no fígado ; Galactose é transformada em glicose no fígado e no musculo esquelético ; Lactose não é encontrado em plantas.
A lactose vai quebrar a ligação glicosidia ,que tem que ter uma molécula de H20 para deixar as OH livres .
Quando a Lactose não é quebrada completamento ,ela fica na luz intestinal ; A intolerância a lactose não é alergia ,ela é um problema que acontece na lactase que não quebra completamente o carboidratodo leite ; O problema de ingerir lactose e ela ficar na luz intestinal é que tem bactérias que vão fazer a quebra de lactose fazendo com que a pessoa sinta dor ,tesão ,flatulência ,etc .
A galactosemia é a falta de enzima epimerase ,é uma doença genética recessiva . A galactose é convertida em glicose pela epimerase ,ela fica circulante no sangue causando danos ao SNC .
Dissacarídeos 
São carboidratos da união de 2-10 moleculas de monossacarídeos 
São solúveis em h20 
Precisam ser quebrados na digestão para serem aproveitados
São unidos por ligação glicosidia 
Polissacarídeos 
Açucares múltiplos ,insolúveis em H20 e não tem sabor doce ,serve como forma de armazenamento.
ligadas entre si por ligações Glicosídicas na forma a ou b, em longas cadeias lineares ou ramificadas
O polímero do amido e do glicogênio são iguais, o que diferencia são suas reservas de ATP 
A ponto do amido que tem OH redutora livre é onde pode ser adicionada outra molécula de glicose pela ligação glicosidia 
A molécula de glicogênio é muito mais ramificada que a de amido 
Quitina é um polímero formado por acetil-glicosamina .
Lipídeos 
Não são miscíveis em H20 
Estão presentes na membrana celular 
É um grupo grande de óleos ,gorduras ,ceras 
São solúveis em álcool ,acetona ,éter 
São apolares 
Os lipídios em solução aquosa tendem a agregar-se pela cauda apolar deixando a cabeça polar em contato com o meio aquoso
São de origem vegetal ou animal 
Componente de membranas celulares junto com as proteínas 
Fornecem energia e funcionam como reserva energética ,membrana celular, transporte metabólico, supressor da fome,percurssor de hormônios e vitaminas e proteção térmica 
Fazem supressão da fome 
Participam na síntese de hormônio 
Apolipoproteinas ajudam a solubilizar lipídeos insolúveis 
Lipideos simples [ triglicerídeos , ácidos graxos saturados e insaturados]
Lipídeos compostos [ fosfolipideos , lecitina e glicolipideos ]
Os lipídios são sintetizados nos vegetais e animais a partir da acetil-CoA, o produto principal do metabolismo aeróbico da glicose,sendo utilizados como fonte de energia quando há escassez de carboidratos.
Neoglicogenese é a síntese de intermediários metabólicos da glicose .
Ácidos graxos 
 Acidos monocarboxilicos derivados do acido carboxílico 
São anfipáticos (tem afinidade com lipídeo e água)
Tem carboxila hidrogenada 
A cauda hidrocarbonada é composta de H+ e C
Tem numero par de carbonos 
Composto de 16 à 18 carbonos 
Pode ser saturado ou insaturado 
Quanto maior o numero de carbonos ,maior é o ponto de fusão.
A lipase acida quebra o ac.graxo pequeno e está no estomago
A lipase básica quebra o ac.graxo grande e está no intestino.
Glicerídios: os produtos da hidrólise podem ser um, dois ou três ácidos graxos e molécula de trialcool denominada glicerol ou glicerina. Um exemplo de grande importância são os triglicerídeos.
Cerídios: álcool com maior número de carbonos e uma ou mais moléculas de ácidos graxos
Fosfolípideos: são ésteres do glicerofosfato (glicerol + fosfato) +ácidos graxos
Esfingolipídios: formados por uma molécula de um aminoálcool de cadeia longa , a esfingosina e ácidos graxos.
Classificação de ácidos graxos
Insaturados 
- tem dupla ligação ou mais de duas duplas ligações
- pode ser monoinsaturado e polinsaturado (+2 ligações)
- a maioria tem ligação CIS 
-possui arranjo menos instável 
- são líquidos à temperatura ambiente 
Saturados 
- não tem dupla ligação 
- são sólidos à temperatura ambiente 
Esteárico é saturado | oleico é insaturado 
- ácido oleico [ 18:1(▲9)] 
* 18 – indica a quantidade de átomos de carbono que possui ;
 1 – indica a quantidade de insaturações ;
 ▲- indica em qual carbono está a dupla ligação 
- está é a regra para nomemclatura de ácidos .
Para identificar OMEGA nos ácidos ,se conta do final para o inicio 
- fazem parte os sistemas / ,que indicam átomos de C e ligações duplas .
Para analisar o ácido mais gorduroso 
- Ex: a banha do porco será solida e o óleo liquido,porque quanto mais saturado ,maior é o ponto de fusão ;
- ex²: a manteiga aviação está no mercado em uma temperatura de 25ºc ,quando você abre a embalagem ela está liquida ,quando coloca na geladeira diminui para 4ºC onde ela passa a ficar sólida .
Triaceglicerol 
São 3 moleculas de ac.glicerol 
São 90% dos lipídeos da dieta 
Gordura abdominal é triaceglicerol 
Colesterol 
Membrana plasmática 
Só é encontrado em alimentos de origem animal 
É um esterol encontrado nas membranas celulares
manutenção da estrutura e da função da membrana da célula
Tem função de : Percussor de vitamina D ,hormônios adrenais e sexuais ,manutenção de membranas celulares ,regulação da fluidez das membranas.
Alimentos vegetais não tem colesterol 
O organismo produz uma quantidade de colesterol e a outra é adquirida na dieta
Aumentar o consumo de fibras, principalmente as solúveis ajudam a diminuir os níveis de colesterol no sangue, uma vez que diminuem a absorção de lipídeos no intestino
Mesmo reduzindo o colesterol no alimento ,vai continuar tendo colesterol porque o corpo vai produzir ,e é produzido no fígado.
Esterificação é quando a molécula de glicerol se liga à 3 moleculas de ac.graxo ,com +3 moleculas de H20 
O colesterol é sintetizado a partir do AcetilcoA no fígado principalmente
O triaceglicerol passa pelo intestino e sofre ação de lipase que vai degradar em glicerol . O ácido graxo quebrado pela lipase vai ser armazenado no enterocito que pode fazer estefificação ; o quilomicon pega os lipídeos da dieta e transporta para o tecido como acido graxo.
A maior parte do colesterol é transformada na forma de LDL 
Uma parte deles é metabolizado no fígado e outra vai fazer síntese de membranas 
O hdl retira o ldl que está em excesso 
Os tipos de colesterol são LDL ,VlDL e HDL , sendo o HDL o mais alto e o LDL mais baixo
A aterosclerose leva à um endurecimento das paredes dos vasos causado pela deposição de gordura, diminuindo espaço para a passagem do sangue nos vasos. É a formação de placas de gordura ,cálcio e outros elementos na parede das artérias.
O colesterol é absorvido pelo intestino delgado e é carreado pelo sangue e penetra no fígado > no fígado forma o vldl > o vldl e o ldl saem do fígado para serem levados a periferia > O ldl leva o colesterol até a parede das artérias > a placa é formada pela deposição da ldl na parede interna da artéria >o hdl remove o excesso de colesterol > o hdl libera o colesterol para os carreadores das lipoproteínas a fim de ser levado de volta ao fígado para a síntese de bile
Esteróides
Tem de 27 a 29 atomos de carbono ,formados em uma cadeia lateral de 8 atomos de carbono no carbono 17 e um grupo OH no carbono 3.
Os esteróides são amplamente distribuídos nos organismos vivos e incluem os hormônios sexuais, a vitamina D e os esteróis, tais como o colesterol.
Lipoproteinas
A digestão de lipoproteínas na forma de lipídeos e ac.graxos 
Na membrana celular principalmente ,tem os fosfolipideos e a partir deles vai ter formação de derivados de lipídeos que é o ácido araquidonico. 
Prostaglandina atua no processo inflamatório 
Tromboxano induz a agregação plaquetária 
Leucotrienos estão presentes nas células brancas do sangue .
O quilomicron é uma proteína ,sintetizada no intestino após uma refeição ,é o principal carreador dos triglicerídos da dieta .
VLDL ,sintetizada no fígado , é a principal carreadora dos triglicerídeos da forma endógena 
LDL , gerada pela VLDL ,é a principal carreadora do colesterol 
HDL ,é a menor mas a mais abundante ,tem função protetora , transporta o colesterol dos tecidos extra-hepaticos para o fígado a fim de que seja excretado .
Acidos nucleicos 
Dna e Rna são moléculas de informação onde são sintetizadas todas as proteínas do organismo 
Tem as bases nitrogenadas purinas e pirimidinas 
Dna
DNA é onde se guarda a informação e se transmite 
Auxilia na herança genética e é transferida por dna 
Gene : é o seguimento de DNA ,que conteminformação necessária para fazer a síntese de proteína .
- Dna se enrola na histona > histona se agrupa nos nucleossomos > compacta o Dna levando a formação da cromatina e do cromossomo.
Dna é o acido desoxirribonucleico ,formado por dupla hélice . Essas cadeias são constituídas pelo açúcar desoxirribose ,um grupo fosfato e as bases nitrogenadas.
DNA’S existentes 
- Dna mitocondrial - herdado da mãe 
- plasmídeos – existentes em bactérias e levam alguns benefícios que não possui .
A nucleina foi descoberta em 1868 ,composto de fosforo ,uma região ácida e básica ,encontrado no núcleo do leucócito .
Dna são bases nitrogenadas unidas a um arcabouço de ose – fosfato 
Bases nitrogenadas se mantém unidas por ponte de H+
No carboidrato das bases nitrogenadas há o grupamento fosfato 
Base nitrogenada é composta de açúcar + fosfato
Quando tem a base nitrogenada + açúcar = glicosídeo ; se for com o fosfato é nucleotídeo .
A base nitrogenada tem ligação com a pentose por ligação -glicosidica ou N-glicosidica .
Os arcabouços do dna são formados por ligação fosfolistica ; acontece no carbono 5 ligado ao carbono 3 de outra pentose . a molécula de dna é constituída por essas ligações . As ligações são glicosidias ,fosfodiester e as bases nitrogenadas.
Nucleotídeo é uma unidade básica de acido nucleico formado por uma molécula de pentose que se liga na base nitrogenada e uma molécula de fosfato ligada em qualquer ponto covalente .
Ligação fosfodiester garantem um esqueleto rígido que fica na molécula de DNA sob a ação de enzima hidrolitica .
Histonas desempenham papel na organização dos cromossomos enovelando a molécula de DNA a sua volta .No processo de mitose os genes devem estar desenrolados ao máximo para facilitar a síntese de RNAm para a iniciar a síntese protéica, o que necessita que os cromossomos estejam na forma desespiralizada.Quando se inicia o processo de divisão celular, após a duplicação da molécula de DNA, é necessário que cada nova molécula migre para as células filhas, o que é permitido graças à compactação máxima dos cromossomos na célula
Fita complementar é quando as fitas estão separadas e tem sentidos opostos de leitura 
5‘ A-T-C-G-A 3’
3’ T-A-G-C-T 5’.
As bases ficam no interior das células ,as hélices são estabilizadas pela ponte de H+
Diferenças entre DNA A ,Z E B .
A- Larga ,condensada e encontrada em meio hipertônico 
B- intermediária ,larga e profunda
Z- estreita ,achatada . está relacionada com a regulação da expressão genica 
Sulco menor tem A-T ; sulco maior tem G-C
A diferença de Dna e Rna está no açúcar e na OSE ; Dna tem H+ e Rna tem OH .
O dna esticado tem 2m ,como fazer para guarda-lo dentro de um pequeno núcleo ?
- empacotando com ajuda das histonas que se ligam ao DNA ,estas histonas se condensam na cromatina ,formando o cromossomo condensado .
Como é formada a proteína ?
- DNA > RNA > PROTEINA 
- a mol de dna foi aberta pela enzima helicase topoisomerase ; 
- outra enzima chamada Rna polimerase aparece e faz a leitura do Dna fazendo uma fita de Rna ;
RNA 
- a fita de Rna vai ser lida pelo ribossomo e à partir desse ribossomo ocorre a síntese de proteína .
- O rnaR e o rnaT são sintetizados a partir de uma ou mais sequencia de nucleotídeos de Dna
O RNA armazena e transmite informação genética ,tem ribose e OH , tem fita simples mas em alguns casos forma fita dupla .
Replicação : Dna da origem à outra molécula de Dna ,na replicação aparece a topoisomerase que separa a fita de Dna , vem a dna polimerase que vai sintetizar fitas filhas iguais à mãe .
RNA’S existentes 
- mensageiro – codificam a sequencia de aminoácidos ,é responsável pelo código genético para a síntese proteica 
- transportador – transporta aminoácido 
- ribossomos – serve para síntese proteica .
O rna é uma molécula formada do açúcar ribose , fosfato e as bases nitrogenadas . Tem a presença de RnaM e RnaT .