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Valeska Portela Lima Conceitos Básicos O Dogma Central da Biologia Molecular foi descrito em 1958 por Francis Crick na tentativa de relacionar o DNA, o RNA e as proteínas, salientando o fluxo unidirecional da informação: do DNA à proteína. Tecnologia do DNA recombinante Até o início da década de 70 o material genético dos organismos era o componente químico mais difícil de ser analisado; Surgimento das primeiras técnicas de isolamento e purificação de genes específicos, através do processo de clonagem gênica; Técnicas provenientes da Microbiologia, Bioquímica, Imunologia e Genética Microbiana permitiram que a molécula de DNA ganhasse um novo enfoque; DNA mais fácil de ser analisado, possibilitando o isolamento de regiões específicas da molécula, obtê-las em grandes quantidades e determinar a sua seqüência numa velocidade de milhares de nucleotídeos por dia. Tecnologia do DNA recombinante Tecnologia do DNA Recombinante, também chamada Engenharia Genética ou Biotecnologia, é um conjunto de técnicas para localizar, isolar, alterar e estudar segmentos de DNA; O termo recombinante é devido freqüentemente tais técnicas serem usadas para combinar o material genético de fontes distintas, tornando-o bem sugestivo. Tecnologia do DNA recombinante Objetivos da manipulação de DNA: Estudos genômicos e de expressão de mRNAs; Métodos de diagnóstico: Engenharia Genética; Expressão heteróloga de proteínas; Vacinas de DNA; Produção de organismo transgênicos; Terapia Gênica; Estudos de interação DNA-proteína ou Proteína- proteína; Estudos de mutação sítio-dirigida de proteínas. Tecnologia do DNA recombinante Baseia-se em propriedades do DNA: 1 O DNA pode ser cortado em posições específicas: Endonucleases de restrição 2 Seleção de pequenas moléculas de DNA capazes de auto-replicação: Vetores 3 Diferentes moléculas de DNA podem ser ligadas covalentemente: DNA-Ligase e DNA recombinante 4 Moléculas específicas de DNA podem ser amplificadas: Reação em cadeia da polimerase - PCR 5 Moléculas de DNA sintéticas podem ser inseridas em células vivas: Transformação de células 6 Células contendo o DNA recombinante pode ser selecionada: Seleção do clone Endonucleases ou enzimas de Restrição Designação: abreviação de 3 letras mais numeral romano: ○ Hind III - Haemophilus influenza (linhagem Rd); ○ EcoRI - Escherichia coli - primeira endonuclease retirada da linhagem RY13. Enzimas especializadas em degradar DNA exógeno em bactérias; Endonucleases ou enzimas de Restrição Mecanismo de defesa contra infecção viral; Reconhecem seqüências palindrômicas de DNA: lidas da mesma forma em ambos os sentidos Clivagem em extremidades coesivas ou cegas Endonucleases ou enzimas de Restrição Clivagem em extremidades coesivas ou cegas Endonucleases ou enzimas de Restrição Endonucleases ou enzimas de Restrição Reconhecem seqüências específicas, sítios de restrição. Endonucleases ou enzimas de Restrição: uso Em vetores de clonagem; Pesquisa de polimorfismos; Genotipagem de microorganismos. Vetores de clonagem Plasmídios e bacteriófagos; Moléculas de DNA capazes de auto-replicação; Tamanho: 1 a 200 kbp; Carregam vantagens para o hospedeiro; Marcas de seleção Permitem a propagação de moléculas de DNA de interesse; Possuem sítios múltiplos de clonagem; Vetores de clonagem Vetores de clonagem Vetores de expressão Permite a expressão controlada da proteína; Fragmento de DNA deve ser inserido em fase de leitura; Indução da expressão; Proteína pode ser purificada. DNA ligase DNA ligase: liga moléculas de DNA; DNA recombinante Técnica de biologia molecular empregada para obter-se amplificação exponencial de fragmentos de DNA alvo in vitro, empregando elementos do processo natural de replicação do DNA; O conceito de amplificação do DNA não é novo e sempre foi utilizado, entretanto, a amplificação era feita in vivo e não in vitro como na PCR. PCR: DEFINIÇÃO BREVE HISTÓRICO Técnica “inventada” em 1985 por Kary B. Mullis; A técnica já existia, entretanto, a DNA polimerase utilizada (E. coli) era destruída durante os ciclos de aquecimento e era necessário adição consecutiva a cada novo ciclo; Foi o primeiro a sugerir a utilização de uma DNA Polimerase “termoestável”. Kary Mullis X Cetus Corporation Prêmio Nobel de US$ 300 milhões Química em 1993 Roche Molecular Systems 1969 – T. Brock e H. Freeze relataram a descoberta de uma nova espécie de bactéria – Thermus aquaticus – sobrevive na água a temperatura média de 75ºC; DNA POLIMERASE TERMOESTÁVEL Yellowstone National Park Várias enzimas isoladas desse microorganismo incluindo a primeira DNA polimerase termoestável – Taq DNA polimerase (1976) PCR Componentes PCR A reação DESNATURAÇÃO → ANELAMENTO EXTENSÃO PCR A reação: 1º ciclo PCR A reação: após sucessivos ciclos PCR Detecção de mutações/polimorfismos em genes específicos (diagnóstico precoce em estudos de câncer e doenças genéticas; Estudos diagnósticos de doenças infecciosas, detecção de bactérias, vírus e protozoários; Elucidar relações evolutivas entre espécies; Fingerprinting – paternidade; Grande potencial na Medicina Forense. APLICAÇÕES ELETROFORESE É a migração de partículas em um determinado gel (gelatina) de acordo com seu tamanho e sua carga elétrica; O gel é formado por conjuntos de moléculas e polímeros que formam uma rede; A eletroforese normalmente é utilizada para separar proteínas ou moléculas de DNA ou RNA. ELETROFORESE ELETROFORESE ELETROFORESE ELETROFORESE 506 pb 491 pb ELETROFORESE EM GEL DE AGAROSE POLIMORFISMO DE MICROSSATÉLITES Questão 01 Uma cientista forense foi chamada para analisar evidências de uma cena de assassinato. Ela colheu amostras de sangue da vítima, de uma mancha de sangue na roupa da vítima, provavelmente do assassino, e de dois outros suspeitos. Ela isolou DNA e determinou o padrão usando uma sonda. Examinando o resultado do gel abaixo, o que a cientista pode conclui? Vítima Vítima Suspeitos Mancha de sangue Questão 02 De uma cena de assassinato, amostras foram coletadas da vítima, de dois suspeitos e de pele embaixo da unha da vítima. Analisando os resultados abaixo, quais as conclusões que é possível obter? Vítima Vítima Suspeito 1 Suspeito 2 Amostra de pele Questão 03 Baseado nos resultados abaixo, que criança poderia ser excluída como filha do casal? Criança 1 MÃE Criança 2 Criança 3 PAI Criança 4 Clonagem molecular Transformação de células: ○ permite a introdução de DNA exógeno em células adequadas; ○ etapa crucial para a criação de um clone: Pode ser feita por: ○ Eletroporação ; Choque térmico ; Cálcio Seleção de clones transformantes: usa-se meio seletivo no qual somente as células que contêm os plasmídios com a marca de seleção sobreviverão Ex: AntibióticoClonagem molecular Sequenciamento Método de dideóxi-ribonucleotídeos Fluorescência – Necessita de um fluoróforo ligado à molécula Fluoriceínas ligadas aos diferentes ddNTP Sequenciamento Obrigada!!!!!
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