Lista de Exercicios de Genética 2

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L I S T A D E E X E R C I C I O S D E G E N É T I C A
 AULA DE ESTRUTURA DO DNA
1.	A porcentagem de Citosina em uma molécula bifilamentar de DNA é 40%. Qual a porcentagem de Timina?
40% citosina 40% guanina 10% timina 10% adenina
2.	Qual das seguintes relações será verdadeira para a porcentagem de bases do DNA bifilamentar?
a)C+T=A+G b) C/A=T/G
3.	Qual as três características gerais que o material genético deve possuir?
Estrutura primaria, estrutura secundaria e estrutura terciaria
4.	Desenhe e denomine as três partes de um nucleotídeo de DNA.
Um açúcar, um fosfato e uma base contendo Nitrogênio
5.	Como um nucleotídeo de RNA difere de um nucleotídeo de DNA?
No DNA tem: Adenina, Guanina, Citosina e Timina.
No RNA tem Adenina, Guanina, Citosina e Uracila.
6.	Que purinas e pirimidinas são encontradas no DNA e RNA?
PURINAS: Adenina e Guanina
PIRIMIDINAS: Citosina, Timina e Uracila.
7.	Que bases são capazes de formar pontes de hidrogênio uma com a outra?
A ADENINA pareia com a TIMINA por meio de 2 pontes de Hidrogênio.
A CITOSINA pareia com a GUANINA por meio de 3 pontes de Hidrogênio.
8.	Se uma molécula bifilamentar de DNA tem 15% de TIMINA, quais as porcentagens de todas as outras bases?
15% timina, 15% adenina, 35% citosina e 35% guanina
AULA DE ESTRUTURA DOS CROMOSSOMOS
1- Que função tem a superelicoidização para a célula?
A superelicoidização é baseada nas TOPOISOMERASES, que são enzimas que adicionam ou removem rotações na hélice do DNA, quebrando temporariamente os filamentos nucleotídeos, girando as pontas uma ao redor da outra e então reunindo as pontas quebradas.
2- Descreva a composição e a estrutura do nucleossomo. Como os nucleossomo diferem dos cromatossomo?
Nucleossomo: consiste em DNA enrolado cerca de duas vezes ao redor de um octâmero de histonas (H2A, H2B, H3 e H4).
Cromatossomo: nucleossomo + H1. A H1 ajuda a fixar o DNA no lugar, agindo como um grampo ao redor do octâmero do nucleossomo.
3- Em quantas partes se divide a cromatina? Qual a diferença entre elas?
O DNA eucariótico está intimamente associado á proteínas, criando a CROMATINA, que se divide em:
EUCROMATINA: sofre o processo de condensação e descondensação no ciclo celular. Constitui a maioria do material cromossômico.
HETEROCROMATINA: permanece em estado de alta condensação durante ciclo celular. É encontrada nos Centrômeros e nos Telômeros.
4- Onde se encontram as Histonas? Quais os tipos que existem? Qual a função delas?
As proteínas mais abundantes na cromatina são as HISTONAS.
 São relativamente pequenas, de carga positiva e de 5 tipos: H1, H2A, H2B, H3 e H4
Têm alta % de arginina, lisina e aa de carga positiva, e estas atraem as cargas negativas dos fosfatos do DNA, o que matem o DNA em contato com as HISTONAS.
5- O que é um Nucleossomo? 
Nucleossomo: consiste em DNA enrolado cerca de duas vezes ao redor de um octâmero de histonas (H2A, H2B, H3 e H4).
6- O que é um cromatossomo?
Cromatossomo: nucleossomo + H1. 
7- Qual a função da Histona H1?
A H1 ajuda a fixar o DNA no lugar, agindo como um grampo ao redor do octâmero do nucleossomo.
8- Qual a função do centrômero no ciclo celular?
É uma região de constrição no cromossomo onde as fibras do fuso se ligam, e é essencial para o movimento adequado do cromossomo na mitose e na meiose. O centrômero também ajuda a controlar o ciclo celular inibindo a ANÀFASE até que os cromossomos estejam ligados às fibras do fuso de ambos os polos.
9- O que é um Telômero e para que serve?
São as pontas naturais de um cromossomo. Servem como um revestimento que estabiliza o cromossomo
AULA DE REPLICAÇÃO
1- Quais os três componentes básicos para que ocorra o processo de replicação?
Um molde consistindo o DNA uni filamentar;
As matérias primas (substratos) para serem montadas em um novo filamento de nucleotídeos;
Enzimas e outras proteínas que leiam o molde e mantém os substratos em uma molécula de DNA.
2- Qual o sentido da replicação?
5’ 3’
3- Qual o nome dos 2 filamentos de DNA na hora da replicação?
FILAMENTO MOLDE (que é transcrito), e o outro é chamado de FILAMENTO NÃO-MOLDE (que não é transcrito)
4- Qual a diferença entre o filamento LEADING e o filamento LAGGING?
No filamento LEADING – é necessário apenas um primer. 
No filamento LAGGING – é necessário um novo primer no começo de cada FRAGMENTO de OKASAKI 
5- Qual o problema que temos no filamento LAGGING, e como isto é superado?
Filamento lagging: a cadeia cresce no sentido oposto ao deslocamento da forquilha de replicação e a síntese ocorre descontinuamente.
6- Porque no filamento LAGGING são necessários vários primers?
O filamento de lagging é formado por vários fragmentos de Okazaki e este deve ser ligado para constituição do filamento de DNA
7- O que são fragmentos de Okazaki?
FRAGMENTOS DE OKAZAKI – são os curtos trechos de DNA produzidos por replicação descontínua, depois são unidos e formam uma molécula contínua. 
8- Cite os 4 estágios do mecanismo de replicação.
Há 4 estágios: INICIAÇÃO, DESELICOIDIZAÇÃO, ALONGAMENTO e TÉRMINO.
9- Escreva sobre como ocorre o processo de iniciação da replicação em bactérias.
Processo de Iniciação: O cromossomo circular da E. coli tem uma única origem de replicação, que têm uma sequência mínima de 245pb. As proteínas iniciadoras ligam-se a origem e fazem com que um trecho de DNA se desenrole, e isto vai permitir que a Helicase e outras proteínas de ligação uni filamentar se liguem ao filamento polinucleotídico.
10- Escreva sobre como ocorre o processo de deselicoidização.
HELICASES – quebram as pontes de H que existem entre nucleotídicos.
PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR - Para estabilizar o DNA uni filamentar (para não reelicoidizar).
DNA-GIRASE é uma enzima que controla a superelicoidização do DNA. Reduz a força torcional que se acumula diante da forquilha de replicação.
PRIMERS – São trechos curtos de nucleotídeos sintetizados por uma enzima chamada PRIMASE.
11- Cite as proteínas necessárias no processo de deselicoidização.
PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR
12- Qual a função da HELICASES?
HELICASES – quebram as pontes de hidrogênio que existem entre nucleotídicos.
13- Qual a função das PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR?
PROTEÍNAS DE LIGAÇÃO UNIFILAMENTAR - Estabilizar o DNA uni filamentar (para não reelicoidizar).
14- Qual a função da DNA-GIRASE?
DNA-GIRASE - é uma enzima que controla a superelicoidização do DNA. Reduz a força torcional que se acumula diante da forquilha de replicação.
15- O que são primers?
PRIMERS – São trechos curtos de nucleotídeos sintetizados por uma enzima chamada PRIMASE.
16- Qual a função da PRIMASE? 
A PRIMASE sintetiza primers para que a replicação seja iniciada. É um trecho curto de nucleotídeos de RNA (com cerca de 10-12 nucleotídeos de tamanho), que fornece um grupo 3’-OH ao qual a DNA polimerase pode prender os nucleotídeos de DNA.
17- Escreva sobre como ocorre o alongamento na fase da replicação.
Apó A DNA POLIMERASE III – Permite adicionar novos nucleotídeos no sentido 5’ 3’ Sua atividade de exonuclease lhe permite remover nucleotídeos no sentido 3’ 5’, capacitando-a a corrigir erros. s adição dos primers, as DNA polimerases alongam o filamento.
18- Qual a função da POLIMERASE III?
A DNA POLIMERASE III – Permite adicionar novos nucleotídeos no sentido 5’ 3’ 
Sua atividade de exonuclease lhe permite remover nucleotídeos no sentido 3’ 5’, capacitando-a a corrigir erros.
19- Qual a função da DNA-LIGASE? 
DNA LIGASE – Após a polimerase ter substituído o último nucleotídeo do primer de RNA por um DNA, permanece um corte na sequência do novo filamento. Este corte é selado pela enzima DNA-LIGASE, que catalisa a formação de uma ligação fosfodiéster sem adicionar outro nucleotídeo ao filamento.
20- Como ocorre o término da replicação?
Em algumas moléculas de DNA, a replicação termina sempre que se encontram 2 forquilhas de replicação. Em outras, sequências específicas de término bloqueiam uma replicação posterior. Uma proteína de término em E.coli (Tus) bloqueia o movimento da HELICASE, parando a forquilha de replicação.
21-Para que serve o processo de REVISÃO? Qual a enzima que está presente nesta fase?
O posicionamento de um nucleotídeo errado, para a reação de polimerização, e a atividade DNA-POLIMERASE remove o nucleotídeo incorretamente parado, e depois insere o nucleotídeo correto (erro de 1 em 10 milhões de nucleotídeos).
22- Como funciona o processo DE REPARO DE PAREAMENTO ERRADO?
Um outro processo chamado de REPARO DE PAREAMENTO ERRADO, corrige erros após a replicação completa. Qualquer nucleotídeo incorretamente pareado produz uma deformidade na estrutura secundária do DNA. Esta deformidade é reconhecida por enzimas que removem um nucleotídeo incorreto e o substitui. Este reparo requer habilidade da enzima de reconhecer a fita nova da velha
AULA DE TRANCRIÇÃO
1- O que é transcrição?
A Transcrição produz um RNA complementar a uma fita de DNA
2- Desenhe o Dogma Central da Biologia. Cite onde ocorre cada evento.
3- Comente sobre a estrutura do RNA e DNA.
O RNA contém o açúcar Ribose, o qual difere da Desoxirribose usado no DNA, pela presença de um grupo -OH adicional.
O RNA contém a base URACILA, que difere da TIMINA, a base equivalente no DNA, pela ausência do grupo -CH3.
4- Cite e comenta sobre as três classes do RNA
5- Cite o nome dos dois filamentos do DNA. Qual filamento será transcrito?
FILAMENTO MOLDE (que é transcrito), e o outro é chamado de FILAMENTO NÃO-MOLDE (que não é transcrito)
6- Qual o sentido da Transcrição?
5’ 3’
7- Quais são os três componentes principais da transcrição?
Um molde de DNA;
As matérias-primas (substratos) necessárias para construir uma nova molécula de RNA;
O aparelho de transcrição, que consiste em proteínas necessárias para catalisar a síntese do RNA.
8- Qual o nome da enzima responsável pela transcrição?
A transcrição em bactérias é feita pela RNA-polimerase, que deve se ligar ao fator sigma para iniciar a transcrição.
9- Comente as três fases da transcrição bacteriana.
1) INICIAÇÃO: A iniciação da transcrição requer que o aparelho de transcrição reconheça e se ligue ao promotor
2) ALONGAMENTO: Nas bactérias a 37ºC, cerca de 40 nucleotídeos são adicionados por segundo. Para a síntese de DNA são mais de 1500 nucleotídeos por segundo.
3) TÉRMINO: Há um finalizador antes do ponto de término. A transcrição termina após ser transcrito o finalizador.
10- Cite as quatro etapas da fase de Iniciação da Transcrição.
11- O que são promotores?
PROMOTORES BACTERIANOS – são sequências no DNA que são reconhecidos pelo aparelho de transcrição, e possuem informação essencial: qual o filamento deve ser lido e em que sentido a polimerase vai se mover.
12- O que são sequências de consenso?
Todos os promotores possuem trechos curtos de nucleotídeos em comum, e a mesma localização em relação ao ponto de início dos nucleotídeos – são as SEQÜÊNCIAS DE CONSENSO.
13- Qual a função da enzima TOPOISOMERASE na transcrição?
TOPOISOMERASES, que são enzimas que adicionam ou removem rotações na hélice do DNA, quebrando temporariamente os filamentos nucleotídicos, girando as pontas uma ao redor da outra e então reunindo as pontas quebradas.
14- Cite os passos da fase de finalização da transcrição.
15- Onde ocorre a transcrição nos eucariontes?
16- Como ocorre a formação da SEQUÊNCIA LIDER antes da saída do RNA do núcleo?
17- Como ocorre a formação da POLIADENILAÇÃO DO RNA antes da saída do RNA do núcleo?
18- Qual a diferença entre introns e exons?
As sequências codificantes (exons) e as sequências não-codificantes (introns).
19- Como são removidos os introns?
Os introns são removidos por Splicing e o mRNA resultante é transportado do núcleo para o citoplasma, onde ele é traduzido em proteína.
20- Descreva o mecanismo de SPLICING do mRNA.
O mecanismo de SPLICING do Mrna: É catalisado por um conjunto de snRNPs e outras proteínas.
 A função dos snRNPs é posicionar os dois terminais do intron juntos para que a reação possa ocorrer.
 Após a união, uma Adenina corta a estrutura do açúcar fosfato do RNA. Forma-se uma alça. Os dois exons se ligam. O laço é liberado e degradado.
AULA DE TRADUÇÃO
1- O que significa dizer que o código genético é REDUNDANTE?
Como existem 61 códons e apenas 20 aa, o código contém mais informação do que o necessário para especificar os aa e é chamado de CÓDIGO REDUNDANTE (Degenerate), significando que os aa podem ser especificados por mais de 1 códon.
2- Onde ocorre a tradução?
A tradução ocorre nos ribossomos.
3- Como ocorre a iniciação na Tradução?
São necessários: mRNA, os ribossomos, um conjunto de 3 proteínas chamadas fatores de iniciação, o tRNA iniciador e o trifosfato de guanosina (GTP)
4- Quais os sítios do Ribossomo? Qual o sítio que tRNA iniciador ocupa? E os demais tRNAs?
Um Ribossomo tem três sítios: Sítio A (aminoacil), Sítio P (Peptidil) e Sítio E (Saída)
O tRNA iniciador ocupa imediatamente o sítio P. Todos os outros tRNAs entram primeiro no sítio A.
5- Como ocorre o término da tradução? 
A síntese pára no códon finalizador e os componentes da tradução são liberados do ribossomo.
6- Um filamento molde no DNA bacteriano tem a seguinte sequencia de bases: 5’ – AGGTTTAACGTGCAT – 3’. Que aminoácidos seriam codificados por essa sequencia? 
Fita codificante: TCCAAATTGCACGTA 
Fita molde: AGG TTT AAC GTG CAT 
Fita de mRNA: UCC AAA UUG CAC GUA
Fita de tRNA: AGG UUU AAC GUG CAU
Aminoácidos: arginina – fenilalanina – aspargina – valina - histidina
7- Uma proteína é constituída por 900 nucleotídeos. Quantos aminoácidos apresentam a cadeia do DNA? 
300