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A StuDocu não é patrocinada ou endossada por alguma faculdade ou universidade Quimica Biorganica - Resumos da cadeira com algumas notas extra Química Biorgânica (Universidade de Aveiro) A StuDocu não é patrocinada ou endossada por alguma faculdade ou universidade Quimica Biorganica - Resumos da cadeira com algumas notas extra Química Biorgânica (Universidade de Aveiro) Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra https://www.studocu.com/pt/document/universidade-de-aveiro/quimica-biorganica/apontamentos/quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra/2077865/view?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra https://www.studocu.com/pt/course/universidade-de-aveiro/quimica-biorganica/2835064?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra https://www.studocu.com/pt/document/universidade-de-aveiro/quimica-biorganica/apontamentos/quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra/2077865/view?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra https://www.studocu.com/pt/course/universidade-de-aveiro/quimica-biorganica/2835064?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Quimica Biorganica [Parte Historica] Porque a designação de composto orgânico? -Os compostos eram classificados como: Organicos Inorganicos Os vitalistas acreditavam que os sistemas vivos (orgânicos) possuíam uma “força vital” inexistente nos sistemas não-vivos (minerais). Julgavam que os compostos inorgânicos podiam ser sintetizados em laboratório, mas que os compostos orgânicos não, pelo menos a partir de compostos inorgânicos. -Em 1828, Wohler publicou a descoberta acidental de uma forma de sintetizar a ureia; Conclusão: Os compostos orgânicos regem-se pelas mesmas leis da química que os compostos inorgânicos. Fontes de compostos de carbono Taxol Paclitaxel (nome comercial TAXOL) é um medicamento utilizado para o tratamento de vários tipos de cancro; É obtido da casca do teixo, onde a extracção varia entre 40 a 165 mg/Kg; para se obter 1 Kg de TAXOL são necessárias, em média, 3 mil árvores. Isómeros: Compostos com a mesma fórmula molecular mas diferentes estruturas moleculares. Grupo funcional é um átomo ou grupo de átomos que caracteriza a estrutura de determinada família de compostos orgânicos e, ao mesmo tempo, determina as respetivas propriedades. Qual a justificação para o carbono poder formar tão elevado número de compostos? -A justificação para esta diversidade de estruturas está no facto de as orbitais atómicas s e p do carbono se poderem associar para darem origem a orbitais híbridas “sp”. -Podem-se formar orbitais sp3 , sp2 e sp. Escrita de estruturas de Lewis -Cada átomo de carbono tem sempre quatro pares de electrões ligantes: Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Representação em “bond-line”: -Omite-se a representação dos átomos de C e de todos os H ligados a átomos de carbono. Outros elementos (O, N, Cl, Br, etc.) e átomos de H a eles ligados não podem ser omitidos!!! -Os vértices e as extremidades da cadeia correspondem a átomos de C. -O número de átomos de H ligados a cada átomo de carbono é determinado de modo a completar 4 ligações nesse carbono. -Nas representações em “bond-line” omitem-se frequentemente os pares de electrões não ligantes (exceto quando tal é importante). Hidrocarbonetos Hidrocarbonetos são compostos orgânicos constituídos exclusivamente por átomos de carbono e de hidrogénio. -Uma série de compostos em que cada um deles difere do anterior de uma quantidade constante, denomina-se série homóloga; os membros da série dizem-se homólogos. Nome = Prefixo + Sufixo Prefixo: indica o nº de carbonos Sufixo: indica a família Um composto pode ter vários nomes, mas um nome deve ser específico de um só composto!!! Nomenclatura dos compostos orgânicos Alcanos com cadeias ramificadas 1- 1. Identificação da cadeia mais longa e identificação dos substituintes; 2- 2. Numerar a cadeia a partir do extremo que conferir numeração mais baixa ao substituinte: s Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 Grupos substituintes alquilo -são obtidos a partir dos alcanos por remoção de um átomo de hidrogénio; 3- 3. Indicar os substituintes da cadeia, por ordem alfabética: Utilize os prefixos di, tri, tetra, etc… para indicar o nº de vezes que um substituinte surge. Estes prefixos não contam para a ordem alfabética!!! 4- 4. Escolher a série de localizadores mais baixa; 5- Atribuir o menor número ao primeiro substituinte, de acordo com a ordem alfabética; 6- Escolher a cadeia que apresente maior número de substituintes; Cicloalcanos Haletos de alquilo Alcenos -Mesmas regras dos alcanos; Alceno como grupo substituinte: Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Alcinos -Mesmas regras Alcino como grupo substituinte Hidrocarbonetos aromáticos - Álcoois 1- Identificar a cadeia carbonada mais longa que contém o grupo hidroxilo e substituir, no nome do alcano correspondente, o “o” final pelo sufixo “ol” . 2- Numerar a cadeia de modo a atribuir o localizador mais baixo possível ao grupo característico (grupo funcional ). Éteres O nome dos éteres pode ser formado por dois métodos distintos: a) substitutivo: nome do tipo alcoxialcano; b) nome de classe funcional: nome do tipo éter dialquílico ou éter alquilalquílico (grupos por ordem alfabética); Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 Aminas Alquilaminas primárias (RNH2 ) Podem ser designadas como alquilaminas ou como alcanaminas O nome destes compostos forma-se adicionando o sufixo amina: a) ao nome do grupo substituinte R, com eliminação da vogal final; b) ao nome do hidrocarboneto RH, com eliminação da vogal final, e indicando a posição do grupo –NH2; Aminas secundárias (R1R2NH) e terciárias (R1R2R3N) Substituintes iguais: dialquilaminas e trialquilaminas Substituintes diferentes: identifica-se a cadeia principal; identificam-se os grupos substituintes; os substituintes ligados ao azoto são precedidos pela letra N- Aldeídos e Cetonas -Caracterizam-se por terem um grupo carbonilo (C=O) Aldeídos: grupo carbonilo está na extremidade da cadeia Cetonas: grupo carbonilo não está na extremidade da cadeia O nome dos aldeídos: a) 1. Numerar a cadeia principal a partir do grupo característico (grupo funcional); b) 2. Substituir no nome do alcano correspondente o “o” final pelo sufixo “al”. O nome das cetonas: atribuir o localizador mais baixo possível ao grupo carbonilo substituir no nome do alcano correspondente o “ o” final pelo sufixo “ ona” indicar a posição do grupo carbonilo Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extraÁcidos carboxílicos -nome do alcano correspondente, substituindo o “ o” final pelo sufixo “óico”, precedido pela palavra ácido. -quando o grupo carboxílico está ligado a um anel usa-se o sufixo “carboxílico”. Sais de ácidos carboxílicos -Substituir o sufixo “óico” por “oato” , seguido do nome do catião (e eliminar a palavra “ácido”) Ésteres -Identificar o ácido que deu origem ao éster e substituir a terminação “óico” por “oato” -Eliminar a palavra “ácido” -Indicar o grupo alquilo ligado ao átomo de oxigénio Haletos de Acilo Identificar o ácido que deu origem ao grupo acilo e substituir a terminação “óico” por “oílo” (nome correspondente ao grupo acilo). Adicionar o nome correspondente ao anião do halogénio Anidridos Simetricos Substituir a palavra “ácido” por “anidrido” Mistos Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 usa-se a palavra “anidrido” seguida do nome dos dois ácidos que lhe deram origem, por ordem alfabética: Amidas -Dois tipos de designação, dependendo do nome do ácido correspondente: ácido .....óico -> ....amida ácido ....carboxílico ->....carboxamida Designação dos compostos polifuncionais -1- Determina-se qual o grupo característico de maior prioridade para ser citado como grupo principal dá o "nome de família" (o sufixo) ao composto. 2- Determina-se qual a cadeia principal (a que contém o grupo principal o maior nº de vezes). 3-Numera-se a cadeia principal. O grupo prioritário deve ficar com o localizador mais baixo possível. 4-Forma-se o nome do composto indicando todos os substituintes, por ordem alfabética, seguidos do nome da cadeia principal e do sufixo correspondente ao grupo principal. Estereoquímica Estereoisómeros: (átomos ligados pela mesma ordem mas diferem na orientação espacial); Conformações - diferentes arranjos dos átomos na molécula, que se podem converter uns nos outros sem rutura de ligações. Configurações - diferentes arranjos dos átomos na molécula, que só se podem converter uns nos outros por rutura de ligações. Os estereoisómeros podem ser: - Diastereómeros: estereoisómeros que não são imagem um do outro num espelho plano ( Ex: Isómeros geométricos - cis, trans, Z, E) - Enantiómeros: estereoisómeros que são imagem um do outro num espelho plano; ATENÇÃO: quando temos dois átomos (ou grupos) iguais ligados ao mesmo átomo de carbono envolvido na ligação dupla, não há estereoisómeros!!! Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Estereoisomerismo nos alcenos -O sistema de designação cis/trans é muito limitado pois só se pode aplicar aos compostos que têm dois átomos (ou grupos) iguais ligados aos átomos de carbono envolvidos na ligação dupla. Sistema de designação E/Z -Este sistema baseia-se na atribuição de precedências (ou prioridades) aos 4 átomos (ou grupos) ligados directamente aos 2 átomos de carbono envolvidos na ligação dupla, recorrendo às Regras de prioridade de Cahn-Ingold-Prelog. Regras de prioridade de Cahn-Ingold-Prelog 1- Os elementos de maior nº atómico têm precedência sobre os de nº atómico inferior. Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 2- Quando temos dois átomos idênticos ligados directamente a um átomo de carbono envolvido na ligação dupla, comparam-se os nºs atómicos dos átomos seguintes. As precedências são determinadas no 1º ponto de diferença 3- A avaliação da prioridade de um grupo substituinte deve ser feita de “dentro para fora” e avaliando a prioridade dos átomos um a um e nunca como um grupo. Por exemplo, como o nº atómico do oxigénio é superior ao do carbono, então -CH2OH tem prioridade sobre -C(CH3 )3. 3.1- Um só número atómico mais alto tem prioridade sobre dois ou três menos altos… 4- Um átomo que esteja ligado a outro por uma ligação dupla ou tripla é considerado em duplicado ou triplicado, respectivamente. Quando temos compostos com duas ou mais ligações duplas é necessário indicar a configuração de cada dupla (exceto das ligações duplas que não têm estereoquímica associada!) ESTEREOQUÍMICA O arranjo espacial dos átomos -Diastereoisómeros: estereoisómeros que não são imagem um do outro num espelho plano; -Enantiómeros: estereoisómeros que são imagem um do outro num espelho plano, mas não sobreponíveis moléculas que não são sobreponíveis às respectivas imagens num espelho plano dizem-se quirais. a origem mais corrente de quiralidade está na presença de um carbono quiral. carbono quiral: um átomo de carbono ao qual estão ligados quatro átomos (ou grupos) diferentes. -As moléculas que diferem apenas no arranjo espacial em torno de um átomo de carbono quiral têm uma propriedade que as distingue: a atividade ótica. Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Medição da actividade óptica -A luz é um fenómeno eletromagnético; um feixe de luz é constituído por um campo elétrico e um campo magnético. -Tanto as oscilações do campo elétrico como do campo magnético ocorrem em todos os planos perpendiculares possíveis relativamente à direção de propagação da luz (luz não polarizada) Uma substância que roda o plano da luz polarizada diz-se que é uma substância opticamente activa. - A rotação é observada através de um polarímetro e é medida em graus. -À rotação no sentido dos ponteiros do relógio atribui-se o sinal (+) -e, no sentido inverso, o sinal (-) O valor da rotação depende do número de moléculas interpostas no trajecto da luz ao longo do tubo. Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 Assim, para se exprimirem os resultados de modo a ser possível fazer comparações, é necessário ter em consideração o comprimento da célula usada e a concentração da solução: Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra A propriedade física que caracteriza os dois enantiómeros é a rotação específica: Resumindo: Substância opticamente activa: é aquela que, quando atravessada por luz polarizada, consegue rodar o plano de vibração dessa luz. Substância dextrógira (+): é aquela que provoca a rotação do plano da luz polarizada para a direita (no sentido dos ponteiros do relógio) (Lat. dexter = direita) Substância levógira (-): é aquela que provoca a rotação do plano da luz polarizada para a esquerda (Lat. laevus = esquerda) -Mistura racémica: Mistura de quantidades iguais de um par de enantiómeros. Uma mistura racémica é opticamente inactiva (a sua rotação específica é zero!) Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 CONFIGURAÇÃO ABSOLUTA DOS CENTROS QUIRAIS (Sistema R / S) 1º - Identificar os diferentes substituintes ligados ao centro quiral e ordená-los por ordem decrescente de precedência (seguir as regras de Cahn-Ingold-Prelog usadas para a identificação das configurações E/Z nos alcenos). 2º- Orientar a molécula de forma a que o grupo de menor precedência aponte “para lá” do plano do papel. 3º- Determinar o sentido de rotação para unir, por ordem decrescente, os três substituintes de maior precedência. Se a rotação for igual à do sentido dos ponteiros do relógio a configuração é R (latim, rectus = direito). Se a rotação for contrária à do sentido dos ponteiros do relógio a configuração é S (latim, sinister = esquerdo). PROJECÇÕES DE FISCHER -Linhas horizontais- representam ligações dirigidas para o observador a partir do plano do papel. -Linhas verticais - representam ligações que se afastam do observador para trás do plano do papel. Faz-se a leitura da configuração, normalmente, sabendo que o átomo (ou o grupo) de menor prioridade está dirigido para o observador. A seguir, basta inverter a leitura da configuração observada: se leio S, será R… se leio R, será S.... Esta abordagem é possível, pois sabemos que uma troca inverte a configuração!!!! MOLÉCULAS AQUIRAIS COM CENTROS QUIRAIS Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra -Composto mesógiro: é aquele cuja molécula, não obstante possuir centros quirais, se pode sobrepor à respectiva imagem num espelho plano (sendo opticamente inactivo). Alcanos: Propriedades físicas -ponto de fusão e ponto de ebulição: São determinados pelo tipo de ligações intermoleculares que ocorrem nos alcanos -Os alcanos são compostos apolares: As suas interacções intermoleculares são do tipo dipolo induzido-dipolo induzido (designadas por forças de van der Waals) -São ligações intermoleculares “fracas” -A intensidade da interacção depende do tamanho e da forma da molécula: o ponto de ebulição aumenta linearmente com o nº de átomos de carbono… -O ponto de ebulição diminui com o aumento de ramificações: a molécula tende a aproximar- se da forma esférica; isto produz um decréscimo da área superficial relativa e, consequentemente, da intensidade das interacções intermoleculares. Propriedades químicas Alcanos muito pouco reactivos Halogenação de alcanos Reactividade dos halogénios F2 > Cl2 > Br2 > I2 -F2 + alcanos: reacção extremamente exotérmica e difícil de controlar. “A maior parte dos compostos orgânicos ardem ou explodem quando colocados em contacto com F2 ” -I 2 + alcanos: é a única reacção de halogenação que é endotérmica. Não é usada para preparar iodetos de alquilo. -Cl2 ou Br2 + alcanos: usada para preparar, respectivamente, cloretos e brometos de alquilo. Mecanismos de reacção Um mecanismo diz-se bem estabelecido quando não está em desacordo com mecanismos de reacções análogas, permite explicar os factos observados e fazer previsões que na realidade se verificam. Cisão de uma ligação química -Cisão homolítica: ruptura de uma ligação química em que cada fragmento fica com um electrão dessa ligação: Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 -Cisão heterolítica: rutura de uma ligação química em que um dos fragmentos conserva os dois electrões da ligação: Halogenação de alcanos - Mecanismo - Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra Estabilidade dos radicais -A estabilidade dos radicais pode ser medida a partir da energia de dissociação da ligação (energia necessária para que ocorra a cisão homolítica da ligação): quanto mais baixa for essa Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 energia, mais estável é o radical correspondente. -Quanto mais baixa for a energia de dissociação da ligação, mais estável é o radical correspondente!!! Regiosselectividade -A quantidade relativa dos produtos formados na halogenação tem em conta o “factor de probabilidade” (o nº de hidrogénios que podem ser removidos para darem origem a um determinado produto) e o “factor de reactividade” (a facilidade relativa com que um determinado hidrogénio é removido). O cloro promove a halogenação de todas as posições possíveis num determinado alcano: a sua regiosselectividade é baixa. O bromo é altamente regiosselectivo na substituição de hidrogénios terciários. Descarregado por Ariana Fernandes (arianasfernandes@ua.pt) lOMoARcPSD|4803318 https://www.studocu.com/pt?utm_campaign=shared-document&utm_source=studocu-document&utm_medium=social_sharing&utm_content=quimica-biorganica-resumos-da-cadeira-com-algumas-notas-extra
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