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3 - Lista 3 NI segunda-feira, 25 de maio de 2020 13:52 Página 1 de Listas Página 2 de Listas Página 3 de Listas Página 4 de Listas Página 5 de Listas Página 6 de Listas 3.1 — Cont. lista 3 domingo, 31 de maio de 2020 11:00 Página 7 de Listas Página 8 de Listas Página 9 de Listas Página 10 de Listas Página 11 de Listas Página 12 de Listas Lista – 3 Natureza da Informação Semiótica e a Sociedade da Informação 1) Segundo o professor Dean Snow, algumas das mãos impressas nas cavernas são femininas (http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-1197680). Indique qual tipo de signo (símbolo, índice ou ícone) seria a silhueta da mão. Identifique também os três elementos da tríade semiótica do Peirce (objeto, representamen e interpretante) no desenho acima. Placa da sonda espacial Pioneer X: O desenho 1 representa a inversão do spin do elétron do hidrogênio que produz uma radiação de 21 cm de comprimento de onda Desenho2: Cada linha representa a distância da terra a cada um dos pulsares mais próximos dela. A frequência dos pulsares está codificada em binário acima de cada linha Desenho 3. A silhueta da própria sonda espacial Desenho 4. O ser humano em atitude de acolhida Desenho 5. O sistema solar com a rota da sonda Pioneer X 2) Discuta o potencial desta placa para transmitir informações de maneira semelhante à às pinturas das mãos nas cavernas. (Máximo 6 linhas). 3) Quais seriam os três elementos do triângulo semiótico neste caso? 4) Os elementos da placa seriam ícones, índices ou símbolos? 5) Qual tipo de signo seria a seta que indica a direção da sonda Pioneer X? 6) Você acha que um ser inteligente de outro planeta (caso exista) poderia decodificar a placa da mesma forma? (Máximo 6 linhas). DNA e Informação 7) Explique com suas próprias palavras se os seres vivos são “veículos” para assegurar a sobrevivência da informação neles contida. (Máximo 6 linhas). 8) Explique com suas próprias palavras a diferença entre as fases de transcrição e tradução do DNA. (Máximo 6 linhas). 9) Explique com suas próprias palavras por que o par GC contribui mais para a densidade do DNA do que o par AT. (Máximo 6 linhas). 10) Explique com suas próprias palavras de que forma se manifesta a redundância das três letras de um aminoácido se para as células eucarióticas estão envolvidos apenas 20 aminoácidos. (Máximo 6 linhas). 11) Explique com suas próprias palavras qual a relação entre os cromossomos e os genes. (Máximo 6 linhas). 12) Explique com suas próprias palavras como alguns genes são importantes para o metabolismo e a manutenção da célula. (Máximo 6 linhas). 13) Explique com suas próprias palavras o que é expressão gênica. (Máximo 6 linhas). 14) No código genético de certa bactéria constatou-se a presença de %GC=39%. Calcule a entropia H(S) e a porcentagem de redundância envolvida. 15) O código genético de um determinado alienígena possui 3 tipos de bases nitrogenadas: A, B e C. Além disso, seus códons são sequências (palavras-código) de 3 bases, onde um ou mais códons podem codificar para um mesmo aminoácido, assim como ocorre no código genético dos terrestres. No código genético do alienígena existem 8 tipos de aminoácidos: D, E, F, G, H, I, J, K. As probabilidades de cada um desses aminoácidos são: P(D) = P(E) = 1/4; P(F) = P(G) = P(H) = 1/8; P(I) = 1/16; P(J) = P(K) = 1/32. a) Com base nessas probabilidades, proponha uma codificação com redundância apropriada para esses aminoácidos considerando todos os códons possíveis (de 3 bases), onde cada um dos códons deve mapear para um determinado aminoácido (assim como acontece com o código genético dos terrestres). b) Quantos bits de redundância existem no código genético do alienígena em questão? Qual código genético é mais eficiente: o dos seres terrestres ou o do alienígena em questão? Justifique. (entropia dos aminoácidos dos terrestres é de 4,21 bits) c) Qual é a eficiência do código de Huffman aplicado ao código genético dos alienígenas? d) Discuta porque a evolução dos seres vivos acabou não resultando numa convergência da eficiência do código genético para a otimalidade. 16) Uma sequência de DNA tem 8 bases do tipo A, C, G ou T. a) Sem qualquer informação adicional sobre as probabilidades de cada uma das bases (ou seja, deve-se assumir que são equiprováveis), determine a incerteza inicial sobre como é essa sequência. b) Dado que existem 4 C’s nessa sequência, determine o ganho dessa informação em relação a incerteza inicial do item a. c) Dado que esses 4 C’s estão localizados na primeira, terceira, quinta e sétima posições, determine o ganho dessa informação em relação a incerteza inicial do item a. d) Dado que existem 4 C’s, 2 G’s, 1 T e 1 A, e que os 4 C’s estão localizados nas mesmas posições definidas no item c, calcule o ganho dessa informação em relação a incerteza inicial do item a. e) Determine a eficiência entrópica do código obtido pelo melhor método conhecido para comprimir a mensagem com as probabilidades das bases determinadas no item d. 17) A sequência binária a seguir representa um trecho de código genético. Sabe-se que a existência da sequência de bits 011100 representa o início de uma transcrição de RNA e o código 100110 o fim desta transcrição. ... 1011100010110011011000111101110001110010100110001... *... 1001110001011001101100011110111000111001010011001010... Fernando Miranda Destacar Fernando Miranda Destacar Fernando Miranda Destacar Fernando Miranda Destacar a) Analise o trecho acima fazendo comentários a respeito do número de genes transcritos dependendo do sentido (fita negativa ou positiva) e mostre quais seriam os códigos desses genes (incluindo os códigos de início e fim da transcrição). b) Sendo o código 00->A, 01->T ou U, 10->C e 11->G, determine as cadeias binárias para o RNA resultante de cada gene. *b) Sendo o código 0=>G, 10=>C, 110=>A e 111=>T ou U, determine as cadeias binárias para o RNA resultante de cada gene c) A partir da frequência de aparecimento das bases, calcule a entropia para a expressão de cada gene encontrado (incluindo os códigos de início e fim da transcrição). Codificação e Comunicação Neuronal 18) Explique com suas próprias palavras os principais tipos de neurônios. (Máximo 6 linhas). 19) Explique com suas próprias palavras o que se entende por Potencial de Ação. (Máximo 6 linhas). 20) Explique com suas próprias palavras os principais tipos de codificação neuronal. (Máximo 6 linhas). 21) Explique com suas próprias palavras como a imprevisibilidade da resposta de um neurônio pode ser associada à Entropia de Shannon. (Máximo 6 linhas). 22) Explique com suas próprias palavras a validade ética, ou não, de se fazer experimentos com animais para benefício dos humanos. (Máximo 6 linhas).