aula-7-definicao-e-interpretacao-da-dep

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INTERAÇÃO GENÓTIPO x AMBIENTE 
EFEITO DO AMBIENTE 
EFEITO DO AMBIENTE 
 
“Mudança do fenótipo de um mesmo genótipo, devido à 
influência do ambiente” 
 
“Indivíduos com o mesmo genótipo apresentam fenótipos 
diferentes em ambientes diferentes” 
 
F  G + E 
 
“O fenótipo observado é o resultado de um conjunto de 
potencialidades (genótipo) que está sob ação do 
ambiente” 
 
Onde o ambiente atua? 
Penetrância 
 
•Porcentagem de indivíduos que expressam o fenótipo 
correspondente entre os indivíduos com um mesmo genótipo. 
 
Expressividade 
 
• Variação no grau de expressão do fenótipo (mais forte em 
uns e mais fraco em outros). 
 
 
Efeitos internos 
 
• Idade, sexo; 
 
• Cor da pelagem em gado Ayreshire; 
 
• Produção de leite; 
 
• Produção de ovos. 
Efeitos externos 
• Temperatura, nutrição, luz, umidade. 
Rainha em abelhas, formigas e cupins 
Gordura amarela em carneiros 
• Y_ - Gordura branca com qualquer alimentação; 
 
• yy - Gordura amarela se alimentado à pasto (não 
 consegue degradar a xantofila da forragem verde); 
 
- Gordura branca se alimentado com ração e feno. 
 
 
 
Interação genótipo x ambiente 
“Comportamento diferencial dos genótipos em diversos 
ambientes” 
 
“Diferença do efeito do ambiente em cada genótipo” 
 
F  G + E + GE 
 
 
 
 
Animais 
 
Confinamento 
Pastagem 
degradada 
Efeito 
do 
ambiente 
Vaca 1 (Genótipo 1) 23,2 15,5 7,7 
Vaca 2 (Genótipo 2) 13,3 5,6 7,7 
Vaca 3 (Genótipo 3) 17,0 9,3 7,7 
 
Genótipos 
 
Ambiente 1 
(Confinamento) 
Ambiente 2 
(Pastagem 
degradada) 
 
Efeito do 
ambiente 
Cabra 1 (Genótipo 1) 12,1 5,8 6,3 
Cabra 2 (Genótipo 2) 7,3 2,6 4,7 
Cabra 3 (Genótipo 3) 10,2 7,5 2,7 
ca
rá
te
r 
ca
rá
te
r 
ca
rá
te
r 
ca
rá
te
r 
ca
rá
te
r 
Nas melhores condições ambientais? 
Principalmente alimentação? 
Em condições limitadas de ambiente? 
Restrições alimentares? 
Avaliação das progênies 
Estimativas mais seguras dos valores 
genéticos; 
Válida especialmente para caracteres de alta 
herdabilidade. 
Seleção mais eficiente e compatível com o 
ambiente de exploração; 
Indicado para caracteres de baixa 
herdabilidade. 
1 – A herdabilidade de um caráter é a mesma nos 
diversos ambientes? 
3 – Para produção de leite o Brasil importa 
reprodutores ou sêmen de países de clima 
temperado (EUA e outros). O que é julgado 
superior lá também será aqui? 
Questões: 
2 – A classificação dos animais com base nos seus 
valores genéticos é a mesma em todos os 
ambientes? 
G1 
G2 
G3 
G4 
G5 
G6 
G1 
G3 
G5 
G6 
G2 
G4 
G1 
G6 
G2 
G4 
G3 
G5 
Caráter 
Caráter 
Caráter 
Correlação genética entre ambientes, no caso de 
estarem evolvidos dois ambientes. 
r  1  Grupos gênicos diferentes atuam em cada 
um dos ambientes. 
Análise da interação 
r = 1  Os mesmos grupos gênicos influenciam o 
caráter, da mesma maneira, nos dois ambientes. 
 
HOURI NETO (1996) 
332.617 registros de lactação em NY. 
115.547 lactações no Brasil (MG, ES, SP, PR, SC, 
RS). 
Período – 1979-1991. 
r = 0,6. 
24% dos reprodutores apresentaram valores 
negativos nos EUA e positivo no Brasil. 
6% dos reprodutores apresentaram 
comportamento inverso. 
Alteração na classificação. 
Resultados 
BRASIL EUA 
Leite Gordura Leite Gordura 
Brasil 
 Leite 0,25 0,79 0,85 0,55 
 Gordura 0,22 0,67 0,88 
EUA 
 Leite 0,34 0,62 
 Gordura 0,35 
Estimativas de herdabilidade (diagonal), e 
correlações genéticas de produção de leite de 
vacas holandesas no Brasil e EUA (COSTA et all 
(2000)). 
Consequências do efeito do ambiente e da interação 
genótipo x ambiente 
• O mesmo genótipo pode apresentar fenótipos diferentes; 
 
• Genótipos diferentes podem apresentar fenótipos iguais; 
 
• Programas de melhoramento localizados; 
 
• Recomendações específicas de raças novas, antes de estudos 
mais detalhados; 
 
“De nada vale genótipo superior em ambiente inadequado. 
Não adianta melhorar o ambiente se o genótipo não é 
adequado” 
Ramalho et al., (1990) 
 
DEFINIÇÃO E INTERPRETAÇÃO DA DEP - 
DIFERENÇA ESPERADA NA PROGÊNIE 
A Diferença Esperada na Progênie (DEP) é usada para 
comparar o mérito genético de animais para várias 
características e prediz a habilidade de transmissão 
genética de um animal avaliado como progenitor; 
Ela é expressa na unidade da caráter: kg para 
peso, cm para PE e meses para IPP, podendo ter 
sinal positivo ou negativo; 
É a mais acurada avaliação do valor aditivo dos 
animais para muitos caracteres. 
É a predição do mérito genético dos gametas 
produzidos pelo indivíduo; 
Termos equivalentes: 
 
PTA – Predict Transmiting Ability (Habilidade predita 
de transmissão) – Tem o mesmo significado, 
mas é mais utilizado para bovino de leite. 
 
TA – Transmiting Ability (Habilidade de transmissão 
Com o conhecimento da DEP (PTA, TA ou outros 
termos equivalentes) de todos os animais de uma 
população, a seleção se torna extremamente fácil e 
eficiente. 
É a mais acurada avaliação do valor aditivo dos animais 
para muitos caracteres. 
Como estimar o valor genético 
aditivo? (Algumas expressões) 
Usar informações fenotípicas disponíveis: 
 
1 – Do próprio animal; 
2 – Dos ancestrais e colaterais; 
3 – Da progênie do animal; 
4 – Combinação de todas (o que leva ao BLUP). 
BLUP – Best Linear Unbiased Prediction (Melhor 
Predição Linear não Viezada). 
Com uma informação do próprio indivíduo: 
VGA = h2(P - µ) 
h2 – herdabilidade; 
P – fenótipo do indivíduo; 
µ - média do grupo contemporâneo do rebanho. 
Com mais de uma observação do fenótipo: 
VGA = [nh2/(1+(n-1)r)] (Pi - µ)/n 
 
h2 – herdabilidade; 
Pi – fenótipo do indivíduo em cada medição; 
µ - média do grupo contemporâneo do rebanho; 
n – número de observações do fenótipo; 
r – repetibilidade. 
Com informação de parentes: 
VGA = Rh2(P - µ) 
 
R – Parentesco entre o indivíduo informante e o 
indivíduo para o qual se deseja estimar VGA. Pai-
filho = 0,5; Meio irmão = 0,25; Irmão completo = 
0,5; 
h2 – herdabilidade; 
P – fenótipo do indivíduo; 
µ - média do grupo contemporâneo do rebanho. 
Com várias informações em um parente: 
VGA = [Rnh2/(1+(n-1)r)] (Pi - µ)/n 
Com teste de progênie: 
VGA = [2Nh2/(4+(N-1)r)] (Pi - µ)/N 
 
N – número de progênies do indivíduo. 
Existem outras expressões a partir de diferentes 
informações. 
Informação de parentes – permite calcular VGA em 
idade precoce, em caráter com expressão em apenas 
um sexo, etc.... 
Quanto maior o número e diversidade de origem das 
informações, maior confiabilidade terá a estimativa. 
As informações estão disponíveis nas 
escriturações zootécnicas das granjas, fazendas e 
livros de registros genealógicos das associações 
de raças. 
USDA – Avalia geneticamente diversos caracteres 
da raça holandesa (35 milhões de animais). 
Combinar tudo é muito complicado. Só é possível com 
os recursos de informática e métodos estatísticos 
(Método da Máxima Verossimilhança, Equações de 
modelos Mistos, etc...) 
Portanto é possível a obtenção rotineira e simultânea 
da DEP, PTA, etc... 
A DEP para efeito maternal prediz a diferença 
esperada, por exemplo, em peso das progênies das 
filhas do animal avaliado (netas), devido às 
diferenças na habilidade maternal apresentada por 
elas. 
Considere um exemplo com o peso ao sobreano em 
gado de corte. Se a DEP (P450) para o touro A for 
de 10 kg e a DEP para o touro B de -5 kg, a diferença 
entre A e B será de 15 kg. 
 Isso significa que podemos esperar que a progênie do 
touro A produza, em média, 15 kg a mais em peso aos 
450 dias que a do touro B, sob as mesmas condições 
de criação. 
 
 
Esse valor (15 kg) reflete a diferença no valor 
genético médio dos gametas produzidos pelos touros, 
pois o material genético dos pais é transmitido à sua 
descendência por meio dos seus gametas. 
TOUROS VALOR GENÉTICO DAS 
PROGÊNIES (kg) 
Identif. No de 
Progênies 
DEP 
(450 dias) 
 
InferiorMédia 
 
Superior 
A 327 20,1 2,3 22,2 43,8 
B 379 13,9 -7,7 14,6 34,1 
C 609 9,8 -16,9 10,9 48,4 
D 661 6,0 -15,7 6,6 34,2 
E 239 -1,6 -24,3 -1,7 16,2 
F 293 -8,8 -33,3 -8,6 9,4 
A variabilidade nos VG na progênie de um mesmo touro, é 
consequência da amostragem aleatória dos genes do touro 
(gametas) e do material genético herdado de suas mães. 
Peso ao nascer (PN) – Touros com DEP baixas ou (-); 
 
Peso a desmama (PD) – Touros com DEPs + e altas; 
 
Ganho de peso ao sobreano (GPS) – DEPs mais altas 
são as mais indicadas; 
 
Conformação, musculosidade e precocidade (MUSC) – 
DEPs mais elevadas; 
 
Perímetro escrotal (PE)– DEPs elevadas. 
 
PTAT 
 
PTA para tipo, medindo a habilidade do reprodutor em 
transmitir um tipo que reúne dados de proteína, gordura, tipos 
de úbere, compostos de úbere e pernas/pés, na proporção 
3:1:1:0,65:0,35. 
 
MGT – Mérito genético total para machos (PMGRN – USP, 
ABCZ e empresas particulares) 
 
0,15 para habilidade maternal (DEPMP 120); 
0,20 para crescimento pré-desmama (DEPDP 120); 
0,20 para crescimento pós-desmama (DEPDP 450); 
0,125 para fertilidade (DEPPE 365); 
0,125 para fertilidade (DEPPE 450). 
DEPs considerando vários caracteres 
MGT – Mérito genético total para fêmeas (PMGRN – USP, 
ABCZ e empresas particulares) 
 
0,30 para habilidade maternal (DEPMP 120); 
0,20 para crescimento pré-desmama (DEPDP 120); 
0,25 para crescimento pós-desmama (DEPDP 365); 
0,25 para crescimento pós-desmama (DEPDP 450); 
 
Índice CFM Agropecuária (USP) 
 
ICFM = 2PD + 4 GPsobcrceano + 2 MUSC + 2PE 
 
PD – DEP para peso à desmama; 
GPsobcrceano - DEP p/ ganho de peso da desmama ao sobreano; 
MUSC – DEP p/ escore visual de musculosidade ao sobreano; 
PE – DEP para perímetro escrotal. 
ACURÁCIA 
 
Correlação entre o valor estimado e o real; 
Mede a “certeza” ou “segurança” com que cada DEP é 
estimada, variando com o tipo e número de informações 
disponíveis de cada indivíduo; 
 0  Acurácia  1 
Acurácia baixa – Grande possibilidade da DEP se alterar 
com o incremento do número de informações; 
Acurácia alta – O valor da DEP tem pouca probabilidade de 
ser alterado em avaliações futuras. 
 
ACURÁCIA 
 
Para bovinos de corte: 
 
 
Para bovinos de leite: 
 
• PEV – Prediction Error Variance (Variância da predição do 
erro). 
•É o elemento da diagonal do inverso da matriz “Left Hand 
Side” (LHS-1), relativo ao animal para o qual foi calculado o 
DEP; 
• - variância aditiva para o caráter. 
2
1
A
PEV
Acurácia


2
1
A
PEV
Acurácia


2
A
Uso da Acurácia 
 
Para determinar a proporção de descendentes do ndivíduo 
(número de fêmeas para acasalamento por exemplo); 
 
 Portanto um animal de DEP alta e acurácia baixa não deve 
ser descartado totalmente;