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21/05/2019 1 Prof. Dr. Alexandre Leseur dos Santos Métodos de Seleção Métodos de Seleção – Introdução O melhoramento genético NÃO acontece em somente uma característica; Sempre existirá a relação entre uma ou mais características melhoradas; Em que valor desses animais consistirá do seu desempenho em muitas características, exemplo sumários de touros; Não copiar Método Tandem 1) Método de Tandem ou de seleção consecutiva; Consiste em selecionar 1 caracter por uma ou mais gerações (anos) até chegar aos níveis desejados; Passando-se em seguida a selecionar para outro carácter; Logo que se chega a um resultado satisfatório, se muda para um terceiro carácter (que pode ser o primeiro) e assim sucessivamente; Padrões da raça; Índice de fertilidade. Método Tandem – Limitações 21/05/2019 2 Precocidade; Tamanho. Método Tandem – Limitações Produção de Leite; % Gordura no Leite. Método Tandem – Limitações Método Tandem – Limitações Mudança no objetivo do programa de melhoramento ao longo do tempo; Método Tandem Peso ao nascer; Ganho em confinamento; Peso a desmama. Peso abate; 21/05/2019 3 Método de Níveis Independentes 2 ou + características. Determinar um nível mínimo. Método de Níveis Independentes Permite eliminar indivíduos no ato da medição da característica. Método de Níveis Independentes Eliminar cedo demais. 10 15 20 25 30 35 0 50 100 150 200 250 300 350 Método de Níveis Independentes Eliminar cedo demais. 10 15 20 25 30 35 0 50 100 150 200 250 300 350 21/05/2019 4 Método de Níveis Independentes Tem a vantagem no entanto, de uniformizar os animais, com mínimos para cada característica; Pode incorrer em uma seleção por baixo. Índice de Seleção De tal forma que o uso do índice apresente um valor que será a estimativa do mérito genotípico do indivíduo; Nos índices de seleção busca-se estabelecer as relações entre as características mais importantes produtivamente; Índice de Seleção NUNCA é inferior aos métodos Tandem e dos Níveis Independentes de Eliminação. Essa superioridade aumenta à medida que o número de características no índice aumenta. Índice de Seleção Variável “P” são obtidas diretamente dos registros de produção; Enquanto que os coeficientes de regressão “b” devem ser estimados. nn PbPbPbI 2211 21/05/2019 5 Índice de Seleção A solução deste sistema proporciona a estimativa dos valores de b. b1 VP1 + . . . + bn CovP1n = a1 VA1 + . . . + an CovA1n b1 CovP1n + . . . + bn VPn = a1CovA1n + . . . + anVAn “A ideia central é a Maximização da correlação entre o índice de seleção e os valores genéticos aditivos que leva a um sistema de equações”. Índice de Seleção – Exemplo Supondo-se que a característica escolhida para compor um índice seja o peso vivo de leitões a desmama e número de leitões desmamados. 1) Peso dos leitões à desmama; 2) Número leitões desmamados; VP1= 25,0 VA1= 7,0 CovP12= 6,0 VP2= 30,0 VA2= 5,0 CovA12= 3,0 Os Valores econômicos (unidades de moeda); a1 = 2,0 a2= 10,0 Índice de Seleção – Exemplo b1 VP1 + . . . + bn CovP1n = a1VA1 + . . . + an CovA1n b1 CovP1n + . . . + bn VPn = a1CovA1n + . . . + anVAn Substituindo-se os valores nas equações, obtém-se: (equação 1) b1(50,00) + b2 (5,00) = 20,00 (20,00) + 4,00 (3,00) (equação 2) b1( 5,00 ) + b2 (44,00) = 20,00(3,00) + 4,00 (14,00) Índice de Seleção – Exemplo (equação 1) b1(50,00) + b2 (5,00) = 20,00 (20,00) + 4,00 (3,00) (equação 2) b1( 5,00 ) + b2 (44,00) = 20,00(3,00) + 4,00 (14,00) Multiplicando a (equação 2) por -10 b1 (50,00) + b2 (5,00) = 412,00 -b1 (50,00) - b2 (440,00) = -1160,00 ------------------------------------------------ -b2 (435,00) = -748,00 21/05/2019 6 Índice de Seleção – Exemplo Encontrar b2 -b2 (435,00) = -748,00 b2 = (-748,00)/ (-435) = 1,72 Logo b1 é dado por... Índice de Seleção – Exemplo Logo b1 é dado por: Substituindo-se este valor na equação 1 ou 2, encontra-se b1: b1 (50,00) + 1,72 ( 5,00) = 412,00 b1 (50,00) + 8,60 = 412,00 b1 (50,00) = 412,00 - 8,60 b1 (50,00) = 403,40 b1 = (403,4 / 50) = 8,07 Índice de Seleção – Exemplo Aplicando-se os valores b1 e b2, o índice seletivo será: I = 8,07 P1 + 1,72 P2 Índice de Seleção – Exemplo Supondo-se que o índice determinado anteriormente (I = 8,07 P1 + 1,72 P2) fosse real, ordenar com fins seletivos os suínos A, B, e C..., cujas informações relativas ao peso aos 180 dias (P1) e leitões desmamados (P2) serão apresentadas a seguir: Suíno A: Peso Leitões desm. = 8,0 kg, leitões desmamados = 14; Suíno B: Peso Leitões desm. = 9,3 kg, leitões desmamados = 8; Suíno C: Peso Leitões desm. = 11,2 kg, leitões desmamados = 11; Suíno D: Peso Leitões desm. = 9,0 kg, leitões desmamados = 12; Suíno E: Peso Leitões desm. = 7,1 kg, leitões desmamados = 14; 21/05/2019 7 Índice de Seleção – Exemplo Calcule um índice com base nas duas características e classifique os suínos com base neste índice. VP1= 10000 VA1= 4000 CovP12= -60 VP2= 4 VA2= 2 CovA12= -44.59 Os Valores econômicos (unidades de moeda); a1 = 0,047 a2= -0,67 Ganho de peso diário Espessura de toucinho 880 15 1000 16 950 12 700 23 1000 15 900 17 1200 16 800 22 1050 14 600 24 Índice de Seleção – Exemplo Calcular com base nos ganhos desejados. Difícil estimar o valor econômico; Utiliza-se o que se espera que o animal ganhe com a seleção (Ganho Genético Desejado); Caract. 1 (ganho de peso); 100 g (espera-se um animal 100 g mais pesado); Caract. 2 (espessura de toucinho); -2 mm espera-se um animal com 2 milímetros a menos de toucinho) Característica X1 100 g 4000 g -- X2 -2 mm 2 mm -- X1 x X2 -- -- - 44,59 h 2 a 21xaa Ganho de peso diário Espessura de toucinho 880 15 1000 16 950 12 700 23 1000 15 900 17 1200 16 800 22 1050 14 600 24 Índice de Seleção – Exemplo Como se estima os ponderadores (b1; b2;... ...bn)? Em que: hn = ganho genético desejado; G = Matriz de Variância e covariância genética aditiva; bn = coeficientes de regressão. Logo... ~~ bGh Índice de Seleção – Exemplo Para encontrar o vetor b, tem-se G h b ~ ~ ~ 1 ~ hGb ~~ bGh 21/05/2019 8 Índice de Seleção – Exemplo Como encontrar os b´s: Encontrando G-1; ~ 1 ~ hGb 259,44 59,444000 G 665365,0007417,0 007417,0000332,0 1G Índice de Seleção – Exemplo Obtenção dos b´s Assim: ~ 1 ~ hGb 589,0 018,0 2 100 665365,0007417,0 007417,0000332,0 ~ 1 hG 21 589,0018,0 XXI MÉTODO BLUP MÉTODO BLUP – MELHOR PREDIÇÃO LINEAR NÃO-VIESADA Possibilita: Predição dos valores genéticos; Ajustando-se os dados, para os efeitos fixos e número desigual de subclasses; MMM – Metodologia de Modelos Mistos Permite a avaliação simultânea de reprodutores, fêmeas e progênies. Faz estimação simultânea dos efeitos de meio e genéticos. Utiliza TODAS as INFORMAÇÕES DISPONÍVEIS!!! Permitindo a “Inclusão da informação completa da família”, por meio daMATRIZ DE PARENTESCO. Modelo Animal MÉTODO BLUP Não copiar 21/05/2019 9 Equações de Modelos Mistos MME (Mixed Model Equations) Henderson (1963) propos (MME) Possibilita modelar (EF) e (EA) MÉTODO BLUPNão copiar Fenótipo P = G + E • G = a + d + i P = valor fenotípico; G= valor genotípico; a=valor genético aditivo; i = efeito da epistasia; d= efeito da dominância; E= efeito ambiental. MÉTODO BLUP O DADO COLETADO yij = fi + gij + εij AMBIENTE INDENTIFICÁVEL EFEITO GENÉTICO AMBIENTE NÃO INDENTIFICÁVEL Modelos Estatísticos MÉTODO BLUPNão copiar yij = fi + aij + dij + εij VALOR GENÉTICO EFEITO GENÉTICO NÃO ADITIVO eij Modelos Estatísticos MÉTODO BLUP Não copiar gij 21/05/201910 Modelo Animal →Y = Xβ⁰ + Zâ + e As soluções de β⁰_ e â_ são obtidas pela resolução das equações de modelos mistos. • Y_ é o vetor de observações; • X_é a matriz de incidência dos efeitos fixos; • ⁰_ é o vetor dos efeitos fixos conhecido; • Z_ é a matriz de incidência de valores genéticos (conhecida);. • â_ é o vetor de valores genéticos (aleatórios) (BLUP); • e_ é o vetor de erros aleatórios. MÉTODO BLUP Modelo Animal →Y = Xβ⁰ + Zâ + e n y y y 2 1 100 00 010 001 n 2 1 100 00 010 001 n e e e 2 1 n a a a 2 1 e Zâ X Y = . + . + MÉTODO BLUP Modelo Animal – (soluções MME) YVX 1-1-1 '.X)V(X' (BLUE) dos (EF) ).(' 1 XYVGZâ (BLUP) dos (EA) MÉTODO BLUP ]')'(''[ ]')'(''[ ~ 11111 ~ 1 1111111 yRZGZRZZRXyRX XRZGZRZZRXXRXo )ˆ(')'( ~ 1111 OXyRZGZRZâ MÉTODO BLUP Y=XB+Za+e; Arquivo de texto (.txt); Animal EA 2074 -84.73 2148 -99.83 2294 19.05 2297 104.58 2340 138.38 10117 -96.73 10210 92.60 10294 -102.29 11087 61.36 11138 29.96 11142 117.38 11359 -20.72 11363 -72.03 11512 -83.11 Não copiar Média de peso aos 70 dias de idade 2.120,08g e D.P. = 51,2g Animal EA 2340 138.38 11142 117.38 2297 104.58 10210 92.60 11087 61.36 11138 29.96 2294 19.05 11359 -20.72 11363 -72.03 11512 -83.11 2074 -84.73 10117 -96.73 2148 -99.83 10294 -102.29 Animal EA DEP 2340 138.38 69.19 11142 117.38 58.69 2297 104.58 52.29 10210 92.60 46.30 11087 61.36 30.68 11138 29.96 14.98 2294 19.05 9.52 11359 -20.72 -10.36 11363 -72.03 -36.02 11512 -83.11 -41.56 2074 -84.73 -42.36 10117 -96.73 -48.37 2148 -99.83 -49.92 10294 -102.29 -51.15 21/05/2019 11 MÉTODO BLUP Fonte: CRV Lagoa MÉTODO BLUP Dados Produção Dados Conformação Classificação TIPO MÉTODO BLUP Curva Normal Padronizada; Não copiar Média de peso aos 70 dias de idade 2.120,08g e SD = 51,2g MÉTODO BLUP Curva Normal Padronizada; Não copiar Média de peso aos 70 dias de idade 2.120,08g e D.P. = 51,2g 21/05/2019 12 MÉTODO BLUP Obter as matrizes Y=XB+Za+e e A; Animal Pai Sexo Ganho de peso 1 K 1 900 2 K 2 950 3 K 1 1000 4 W 2 950 5 W 2 930 6 W 1 850 7 H 1 950 8 H 1 850 9 H 2 700 10 H 2 900 11 I 1 900 12 J 2 850
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