Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
INTRODUÇÃO À BIOLOGIA MOLECULAR Prof. Dr. Anderson Garcia Roteiro da aula 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos 2. Eventos marcantes para o surgimento da Biologia molecular 3. Definição de Biologia molecular 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria. 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos • Apresentou seu trabalho à Sociedade de História Natural de Brünn, no qual enunciava as suas leis de hereditariedade, deduzidas das experiências com as ervilhas. 8 de março de 1865 - Gregor Mendel Início das investigações genéticas Um fator hereditário chamado gene é necessário para produzir a cor das ervilhas Cada planta tem um par deste tipo de gene O gene existe em duas formas chamados alelos Johann Friedrich Miescher (1844- 1895) 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos 1869 - Johann Friedrich Miescher (Bioquímico) Analisou os glóbulos brancos presentes • No núcleo havia um material de natureza ácida; • Rico em fósforo e nitrogênio • Desprovido de enxofre • Resistente à ação da pepsina (enzima proteolítica) Chamou este material de nucleína 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos 1889 - Richard Altmann Nucleína contém bases nitrogenadas 1880 - Albrecht Kossel (Bioquímico Alemão) Extraíu a nucleína com alto grau de pureza, comprovou sua natureza ácida e lhe deu o nome de ácido nucleico Richard Altmann (12 March 1852 – 8 December 1900) Ludwig Karl Martin Leonhard Albrecht Kossel 16 de setembro de 1853 - 5 de julho de 1927 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos Qual a função dos ácidos nucleicos? A informação genética está nos ácidos nucleicos ou proteínas? 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos 1928 – o experimento de Fred Griffith (médico sanitarista) Bactérias não virulentas Bactérias virulentas mortas Ratos desenvolviam pneumonia e morriam Conclusão: Há alguma coisa no meio que está fazendo com que as bactérias não virulentas se tornem virulentas Mas o que ? • Em 1940 - Oswald T. Avery, Colin MacLeod e Maclyn McCarty 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos O material genético é o DNA Bactérias podem incorporar fragmentos de DNA exógeno em um meio Transformação Bactérias não virulentas incorporavam o DNA da virulenta, tornando-se assim virulentas 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos George W. Beadle e Edward L. Tatum, trabalhando com o fungo Neurospora crassa, observaram que após irradiação com raios-X, ocasionalmente eles isolavam esporos que em cultura não cresciam tão bem quanto os demais. Nesses casos, para que o fungo mutante crescesse, bastava enriquecer o meio de cultura com uma vitamina ou um aminoácido. Com esses resultados, Beadle e Tatum concluíram que os esporos mutantes deveriam possuir enzimas deficientes que não conseguiam sintetizar a vitamina ou o aminoácido essencial para seu crescimento, e puderam então estabelecer a importante relação: um gene: uma enzima, isto é, para cada enzima responsável pelo metabolismo dos fungos havia necessidade de um gene. Sabendo-se que as enzimas são proteínas, essa relação passou a ser generalizada como um gene: uma proteína (por razões que serão discutidas mais adiante, atualmente essa afirmação precisou ser adaptada para um gene: um polipeptídio). Na década de 1940, 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos • Em 1952, experimentos de Alfred D. Hershey e Martha Chase, que estudaram a infecção de células bacterianas por um vírus (bacteriófago), com DNA ou proteína marcados radioativamente, acabaram qualquer dúvida remanescente de que o DNA, e não a proteína, portava a informação genética. 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos A estrutura e composição dos ácidos nucleicos • Erwin Chargaff e seus colegas no final dos anos de 1940 descobriram que as quatro bases nucleotídicas do DNA eram encontradas em proporções diferentes nos DNAs de organismos diferentes e que as quantidades de certas bases estavam relacionadas. Estas descobertas os levaram a concluir que: 1.A composição de bases do DNA, em geral, varia de uma espécie para a outra. 2. Amostras de DNA isoladas de diferentes tecidos da mesma espécie têm a mesma composição de bases. 3. A composição de bases de DNA em uma dada espécie não muda com a idade do organismo, seu estado nutricional ou a mudança de ambiente. 4. Em todos os DNAs celulares, independentemente da espécie, o número de resíduos da adenosina é igual ao número de resíduos da timidina (isto é, A = T) e o número de resíduos de guanosina é igual ao número de resíduos de citidina (G = C). Dessas correlações, conclui-se que a soma dos resíduos de purina é igual à soma dos resíduos de pirimidina; isto é, A + G = T + C. • Rosalind Franklin e Maurice Wilkins usaram o método eficaz da difração por raios X para analisar fibras de DNA. Eles demonstraram, no início dos anos de 1950, que o DNA produz um padrão de difração por raios X característico A partir desse padrão, deduziu-se que as moléculas de DNA são helicoidais com duas periodicidades ao longo de seu eixo mais longo, a primária de 3,4 Å e a secundária de 34 Å. PROBLEMA: construir um modelo compatível com os dados da difração e de acordo com as regras de Chargaff A estrutura em dupla dupla hélice da molécula de DNA foi resolvida em 1953 por: 1. Eventos históricos sobre a descoberta dos ácidos nucleicos Foi então que Watson e Crick, reunindo todas estas ideias determinaram a estrutura tridimensional da molécula de DNA, onde: • Duas cadeias de DNA helicoidais estão enroladas em torno do mesmo eixo para formar uma dupla-hélice de orientação à direita • Os esqueletos hidrofílicos de grupos fosfato e desoxirribose alternados estão no lado de fora da dupla-hélice, orientados para a água circundante. • O anel furanosídico de cada desoxirribose está na conformação C-29 endo. • As bases pirimídicas e púricas das duas fitas estão empilhadas dentro da dupla-hélice, com suas estruturas hidrofóbicas em forma de anel e quase planares muito perto uma da outra e perpendiculares ao eixo longitudinal. • O pareamento perfeito das duas fitas cria um sulco maior e um sulco menor na superfície do duplex • As duas cadeias polinucleotídicas antiparalelas da dupla hélice de DNA não são idênticas nem na sua sequência de bases e nem na sua composição. • Elas são complementares entre si. • A dupla-hélice de DNA, ou duplex, é mantida por duas forças, como descrito anteriormente: ligações de hidrogênio entre os pares de bases complementares e interações de empilhamento de bases. • A complementaridade entre as cadeias de DNA é atribuída à ligação de hidrogênio entre os pares de bases. • As interações de empilhamento de bases, as quais são muito inespecíficas no que diz respeito à identidade das bases empilhadas, determinam a maior contribuição para a estabilidade da dupla-hélice. • O modelo sugere imediatamente um mecanismo para a transmissão da informação genética. Francis Crick 1958 Dogma central da biologia molecular 2. Eventos marcantes para o surgimento da Biologia molecular Crick e colaboradores 1961 Cada aminoácido é codificado por uma trinca de nucleotídeos, porém o código genético é degenerado, sendo cada aminoácido podendo ser codificado por mais de uma trinca Transcirptase Reversa (1970) Howard Temin e Satoshi Mizutani David Baltimore Dogma central da biologia molecular Sequenciamento da molécula de DNA 1977 –O desenvolvimento de duas novas técnicas, uma por Alan Maxam e Walter Gilbert e a outra por Frederick Sanger, tornou possível o sequenciamento de moléculas grandes de DNA. A criação da PCR (Reação em cadeia da polimerase) Técnica desenvolvida por Kary Mullis em 1983 Em 1993 ele ganhou o prêmio Nobelde Química pelo desenvolvimento da técnica. Ele utilizava sucessivos banhos-maria para atingir a temperatura desejada, e a cada etapa do processo, adicionava novamente a DNA polimerase (uma enzima responsável em amplificar as sequencias desejadas). Evolução da técnica de PCR (Reação em cadeia da polimerase) 3. Definição de Biologia molecular BIOLOGIA MOLECULAR A Biologia Molecular tem como campo de estudo as interações bioquímicas celulares envolvidas na duplicação do material genético e na síntese proteica. É uma área intimamente ligada à genética e à bioquímica. A Biologia Molecular consiste principalmente em estudar as interações entre os vários sistemas da célula, partindo da relação entre o DNA, o RNA e a síntese de proteínas, e o modo como essas interações são reguladas. 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina Identificação de doenças genéticas Diagnostico preciso onde técnicas moleculares vão detectar a presença e quais as mutações no Gene específico responsáveis pela patologia. Ex: Doenças causadas por erros inatos do metabolismo como Mucopolissacaridores e Fenilcetonúria, fibrose cística, síndrome do X frágil, dentre outras. Diagnostico de doenças infecto contagiosas Diagnóstico das infecções virais como HIV, Hepatite C e Hepatite B; doenças parasitárias como leishmaniose e toxoplasmose e infecções bacterianas que possuem um difícil diagnóstico etiológico como cervicites e uretrites após o início da utilização da biologia molecular como meio de diagnóstico. Identificação de doenças genéticas • Reação em cadeia da Polimerase (PCR) • Sequenciamento de DNA • Polimorfismo de conformação de fita simples (SSCP) • Hibridização in situ • Southern blotting • Polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina • Reação em cadeia da Polimerase (PCR) Amplifica (faz múltiplas cópias) o gene de interesse e através da análise por gel de agarose é possível identificar se há mutações no gene. CYNTIA ARIVABENI DE ARAUJO CORREIA - PREVALÊNCIA DE SEIS MUTAÇÕES NO GENE CFTR EM PORTADORES DE FIBROSE CÍSTICA DA REGIÃO DE CAMPINAS - DISSERTAÇÃO DE MESTRADO - CAMPINAS - 2005 PREVALÊNCIA DE SEIS MUTAÇÕES NO GENE CFTR EM PORTADORES DE FIBROSE CÍSTICA DA REGIÃO DE CAMPINAS Para estudar o exon 21, onde está localizada a mutação N1303K, foi utilizada a enzima Bstn I. A presença dessa mutação abole o sítio de reconhecimento desta enzima. Portanto os indivíduos que possuem essa mutação permanecem com o fragmento da PCR (59pb). Já nos indivíduos que não possuem a mutação, a enzima reconhece um sítio específico e cliva o fragmento em fragmentos de 40 e 19pb (Figura.11). Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina • Polimorfismo de conformação de fita simples (SSCP) O SSCP (Single-Strand Conformation Polymorphism) é um método de triagem de mutações que permite detectar alterações na mobilidade eletroforetica de fitas simples de ácidos nucleicos em condições não desnaturantes. Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina • Sequenciamento de DNA Determina a sequencia de nucleotídeos de um gene ou genoma. DETECÇÃO DE CINCO NOVAS MUTAÇÕES EM BRASILEIROS COM GANGLIOSIDOSE GM1 MATEUS BARBOSA VIEIRA - DETECÇÃO DE CINCO NOVAS MUTAÇÕES EM BRASILEIROS COM GANGLIOSIDOSE GM1 – DISSERTAÇÃO DE MESTRADO – UFRGS - 2006 DETECÇÃO DE CINCO NOVAS MUTAÇÕES EM BRASILEIROS COM GANGLIOSIDOSE GM1 MATEUS BARBOSA VIEIRA - DETECÇÃO DE CINCO NOVAS MUTAÇÕES EM BRASILEIROS COM GANGLIOSIDOSE GM1 – DISSERTAÇÃO DE MESTRADO – UFRGS - 2006 O RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphysm) é um método que utiliza enzimas de restrição para detecção de mutações e polimorfismos genéticos. As enzimas de restrição reconhecem sítios específicos na seqüência do DNA que é clivada somente quando o sítio está presente, gerando fragmentos de vários tamanhos que são separados e analisados por eletroforese. Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina • Polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) Usada para detectar mutações ou polimorfismos conhecidos • Southern blotting Técnicas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina O Southern blot é um método que serve para verificar se uma determinada sequência de DNA está ou não presente em uma amostra de DNA analisada. Isso é feito por meio do realce do resultado de uma eletroforese em gel de agarose e posteriormente hibridizada com sonda radioativa ou segmentos de DNA. Melhores métodos para detecção de mutações Diagnóstico de doenças infecto contagiosas Técnicas mais utilizadas utilizadas: 4. Aplicações na área da saúde, alimentos e agroindústria 4.1 Na saúde e medicina – Diagnóstico de doenças infecto-contagiosoas • Hibridização in situ • Reação em cadeia da Polimerase (PCR) Detecção de HPV, Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium leprae, HIV, Hepatite C e Hepatite B; doenças parasitárias como leishmaniose e toxoplasmose e infecções bacterianas que possuem um difícil diagnóstico etiológico como cervicites e uretrites após o início da utilização da biologia molecular como meio de diagnóstico. IDENTIFICAÇÃO GENÉTICA DE ESPÉCIES PRODUÇÃO DE BIOMOLÉCULAS DE INTERESSE INDUSTRIAL, SAÚDE E ALIMENTOS PRODUÇÃO DE OGMS E TRANSGÊNICOS
Compartilhar