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Enzimas Prof.ª MScª Acidália Carine Vieira Santos O que é preciso para ocorrer a vida? O organismo deve ser capaz de se autorreplicar e deve ser capaz de catalisar reações químicas com eficiência e seletividade. Enzimas • São macromoléculas responsáveis pela catalise ( aumentam a velocidade das reações) • A velocidade é maior do que os catalisadores sintéticos ou inorgânicos. • Alto grau de especificidade para os seus respectivos substratos • Atuam em soluções aquosas sob condições suaves de temperatura e pH. A determinação das atividades de enzimas no plasma sanguíneo, nas hemácias ou em amostras de tecidos é importante no diagnóstico de certas enfermidades, principalmente as hereditárias. Classificação das enzimas • Denominadas a) pelo nome dos seus substratos ou a uma palavra que descreve sua atividade + “ase”. Exemplo: o Uréase: catalisa a hidrólise da ureia o DNA-polimerase: catalisa a polimerização de nucleotídeos para formar DNA b) pelos seus descobridores em razão de uma função ampla: Exemplo: Pepsina: vem do grego pepsis (digestão) c) a partir de sua fonte: Exemplo: o Tripsina: denominada em parte do grego tryein (desgastar), foi obtida esfregando tecido pancreático com glicerina. Classificação das enzimas (Acordo internacional) • Sistema de nomenclatura e classificação de enzimas: Classificação de quatro partes e um nome sistemático, que identifica a reação catalisada ATP: glicose-fosfotransferase o Indicando que ela catalisa a transferência de um grupo fosforribosil do ATP para a glicose. Classes Características das enzimas: • Toda enzima é uma proteína, mas nem toda proteína é uma enzima. Exceto por um pequeno grupo de moléculas de RNA catalíticas • Algumas enzimas não precisam de outros grupamentos químicos, para terem suas atividades normais • No entanto outras precisam de cofatores ou coenzimas ligadas aos sítios catalíticos Cofator : são ions inorgânicos que estão ligado no sitio ativo da enzima Coenzimas: são moléculas orgânicas ou metalorgânicas • Se uma enzima for desnaturada ou dissociada nas suas subunidades, geralmente a atividade catalítica é perdida. Definições • Grupo prostético é uma coenzima ou cofatores que se ligam muito firmemente, ou mesmo covalentemente, a uma enzima. • Holoenzima é uma enzima completa, cataliticamente ativa junto com a sua coenzima e/ou íons metálicos, é denominada. • A parte proteica de uma dessas enzimas é denominada apoenzima ou apoproteína. • Algumas enzimas são modificadas covalentemente por fosforilação, glicosilação e outros processos. Muitas dessas modificações estão envolvidas na regulação da atividade enzimática. Coenzimas • As coenzimas agem como carreadores transitórios de grupos funcionais específicos • A maioria deles é derivada das vitaminas, nutrientes orgânicos cuja presença na dieta é necessária em pequenas Catalise Enzimática • É essencial para os sistemas vivos, pois as reações não catalisadas tendem a ser lentas • A maioria das moléculas biológicas é muito estável nas condições internas das células com pH neutro, temperaturas amenas e ambiente aquoso • Exemplo: Hidrolise quebra de molécula com liberação de água Responsáveis pela formação de molécula transitória (intermediários instáveis) carregados ou a colisão de duas ou mais moléculas exatamente na orientação exata necessária para que as reações ocorram, são desfavoráveis ou improváveis no ambiente celular. Catalise Enzimática • As enzimas proporcionam um ambiente específico e adequado para que uma dada reação possa ocorrer mais rapidamente. • A propriedade característica: As reações ocorre confinada em um bolsão da enzima denominado sítio ativo A molécula que liga no sítio ativo e sobre a qual a enzima age é denominada substrato. O complexo Enzima –Substrato é fundamental para que as reações ocorram. 1. Cadeias laterais de AAs (fenda ou bolso_3D) 2. Eficiência catalítica 3. Especificidade • Sítio de ligação do substrato; • Sítio catalítico. Sítio Ativo Reação Enzimática • Precisamos considerar: E = enzima S = substrato P = produto • As enzimas alteram a velocidade da reação, não o equilíbrio • Uma reação enzimática simples pode ser escrita como Reação Enzimática • Em uma reação enzimática a enzima se regenera não tem modificação da molécula inicial e a enzima final. • No entanto o substrato é transformado em produto no final da reação • ES e EP são complexos transitórios da enzima com o substrato e com o produto. Coordenação da Reação • Reação não catalisada por enzima Para que a reação de catalise ocorra deve-se fornecer energia para o sistema O equilíbrio entre S e P reflete a diferença entre as energias livres dos seus estados fundamentais. Demora mais para ocorrer a transformação em produto. Coordenação da Reação • Reação catalisada por enzima Para que a reação de catalise ocorra deve-se fornecer energia para o sistema A função do catalisador é aumentar a velocidade da reação depende da variação de energia livre no estado de transição. A catálise não afeta o equilíbrio da reação. O equilíbrio entre S e P reflete a diferença entre as energias livres dos seus estados fundamentais. Mecanismos de Catalise • As enzimas catalisam os substratos em produtos através das interações Covalentes e Não covalentes do sítio ativo com o substrato especifico. • Tipos de catalise enzimática Ácido –Básico Covalente Mediada por íons metálicos. Fatores que alteram a velocidade de reações enzimáticas • pH • Temperatura • Concentração das enzimas • Concentração dos substratos • Presença de inibidores Influência do pH e Temperatura Influência do pH e Temperatura • Atenção A temperatura ou pH aumenta a atividade da enzima até uma temperatura ou pH ótima, porém quando ultrapassa este ponto a proteína começa a desnaturar Sendo que o pH tem uma outro fator de desnaturação que é a redução do pH ( pH ácido) Cinética Enzimática • Cinética Enzimática: É a velocidade em que o substrato é convertido em produto de acordo com o tempo, mediante a catalise de uma enzima • O fator que vai variar a velocidade da cinética da enzima é a concentração de Substrato • No entanto a concentração de substrato pode alterar a reação • Velocidade inicial é calculada quando a concentração de substrato é maior que a concentração da enzima Km= é utilizado para comparar a eficiência de catalise de diferentes enzimas Cinética enzimática • Equação de Michaelis-Menten É baseado nos seguintes pressupostos: o E, S e ES estão em equilíbrio; o a conversão de ES em E + P é uma etapa irreversível e limitante da velocidade. oVelocidade inicial é calculada quando a enzima é misturada ao substrato, sendo nesse momento o produto muito pequeno. reversível Km= K2 + K3/K1 Afinidade da enzima e do seu substrato específico Qual correlação entre Km e Vmáx? Km=Vmáx/2 Km=[S] Experimentalmente (grandes qtdes de substrato) Constante de Michaelis-Menten (Km) • Existem enzimas que tem mais de uma etapa, podendo diferi o Km e Vmax diferindo uma enzima da outra. • A velocidade da reação é diretamente proporcional à concentração da enzima Enzimas catalisam reações com dois ou mais substratos Complexo ternário INIBIÇÃO ENZIMÁTICA 29 • Qualquer substância que reduz a velocidade de uma reação enzimática. INIBIDORES REVERSÍVEIS IRREVERSÍVEIS COMPETITIVOS NÃO COMPETITIVOS INCOMPETITIVOS Inibição Competitiva • Inibidor competitivo: concorre com o substrato pelo mesmo sitio ativo na enzima Inibição Não-competitiva 31 • Inibidor não-competitivo se liga reversivelmente, aleatória e independentemente em um sítio que lhe é próprio na enzima. Inibição Incompetitiva 32 • Inibidor incompetitivo se liga reversivelmente, em um outro sítio na enzima que não é o catalitico. Só ocorre após a formação do complexo ES. Inibição Irreversível • Ise combina com um grupo funcional, na molécula da E, que é essencial para sua atividade. • Podem promover a destruição do grupo funcional • Forma-se uma ligação COVALENTE entre o I e a E. K2 E + PE + S ES K1 EI + I Enzimas Regulatórias • Enzimas alostéricas Funcionam através da ligação não-covalente e reversível de um metabólito regulador chamado modulador; Moduladores podem ser inibidores ou ativadores; São maiores e mais complexas, possuem duas ou mais cadeias polipeptídicas. • Enzimas reguladas pela modificação covalente reversível Grupos químicos são ligados covalentemente e removidos da enzima reguladora por enzimas ≠, podem ser: fosfato, adenosina monofosfato, grupos metil, etc.
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