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Universidade Federal do Rio de Janeiro – Instituto de Bioquímica Médica Disciplina: Bioquímica I – Farmácia I – BQM 101 – Bloco I Lista de Exercício I DNA, Replicação e Tecnologias de análise do DNA 01. (UFSM-RS) Numere a segunda coluna de acordo com a primeira: Coluna 1 Coluna 2 1 – DNA ( ) Dupla hélice ( ) Ribose 2 – RNA ( ) Fita única ou simples ( ) Desoxirribose ( ) Bases nitrogenadas: adenina, guanina, citosina, timina ( ) Bases nitrogenadas: adenina, guanina, citosina, uracila A sequência correta é: a) 1 – 2 – 1 – 2 – 2 – 1 b) 2 – 1 – 1 – 2 – 2 – 2 c) 2 – 1 – 2 – 1 – 1 – 2 d) 1 – 2 – 2 – 1 – 1 – 2 e) 1 – 1 – 2 – 2 – 2 – 1 02. (IFC-SC-2013) A "Science", uma das mais importantes revistas da área científica, ao escolher os destaques científicos do atual período, externa que as áreas da biotecnologia e da genética dominam a lista, ambas baseadas no conhecimento da natureza do DNA. A respeito do DNA, é correto afirmar que. Justifique todas as alternativas. I. Duas cadeias de DNA são complementares quando houver uma base A em uma delas e T na outra, e, onde houver um C em uma cadeia, haverá um G na outra. II. A molécula de DNA é formada por cinco anéis aromáticos, encontrada no meio intracelular, e sua importância reside no fato de que é formada pela cromatina. III. Cada um dos filamentos de DNA é composto por milhares ou milhões de unidades chamadas nucleotídeos, encadeados em sequência. IV. O DNA se reproduz por duplicação semiconservativa, quando as duas cadeias que o constituem se separam e orientam a produção da cadeia complementar. a) Somente as afirmativas I e IV estão corretas. b) Somente as afirmativas I e III estão corretas. c) Somente as afirmativas I, III e IV estão corretas. d) Somente as afirmativas I, II e IV estão corretas. e) Somente as afirmativas II e III estão corretas. 03. (Uerj) “Testes genéticos: a ciência se antecipa à doença. Com o avanço no mapeamento de 100 mil genes dos 23 pares de cromossomos do núcleo da célula (Projeto Genoma, iniciado em 1990, nos EUA), já é possível detectar por meio de exames de DNA (ácido desoxirribonucleico) a probabilidade de uma pessoa desenvolver doenças [...].” (O Globo, 10/08/1997). Sabe-se que o citado mapeamento é feito a partir do conhecimento da sequência de bases do DNA. O esquema abaixo que representa o pareamento típico de bases encontradas na molécula de DNA é: Justifique sua resposta. 04. Sobre replicação do DNA, todas as sentenças abaixo apresentam ao menos um erro. Indique-o(s), explique porque está errado e re-escreva a sentença correta: a) A replicação do DNA em humanos começa numa extremidade 5' do cromossomo, segue numa direção e termina na extremidade 3'. b) Num ciclo de divisão celular, a célula replica o seu DNA várias vezes, sempre que for necessário para ela. c) O local de início da replicação do DNA é definido pela DNA polimerase. d) Num único cromossomo humano, a síntese da fita nova do DNA é feita na direção 3'-5' e ocorre toda de forma contínua; e a da outra fita do DNA é feita na direção 5'-3' e ocorre toda em fragmentos, de forma descontínua. e) A enzima DNA ligase faz as ligações de hidrogênio que ligam as duas fitas novas de DNA após a sua replicação. f) A DNA polimerase usa como molde um RNA 5'-3' produzido pela RNA primase. 05. Sobre a composição e a estrutura do DNA, coloque certo (C) ou errado (E) para as perguntas abaixo e justifique todas as alternativas. a. Cada um dos filamentos de DNA é composto por milhares ou milhões de unidades chamadas nucleotídeos, encadeados em sequência. ( ) b. Em sua composição é possível encontrar quatro bases nitrogenadas diferentes: a adenina, a citosina, o aminoácido e a proteína. ( ) c. É formado por duas fileiras de nucleotídeos torcidas juntas em forma de hélice. ( ) d. Duas cadeias de DNA são complementares quando houver uma base A em uma delas e U na outra, e, onde houver um C em uma cadeia haverá um G na outra. ( ) 06. Sobre as funções e propriedades do DNA, coloque certo (C) ou errado (E) para as perguntas abaixo e justifique todas as alternativas. a. Nos organismos procariontes, ele fica armazenado dentro do núcleo das células. ( ) b. Nele está contida a informação genética necessária para a formação de um organismo. ( ) c. A mensagem nele contida pode ser transcrita para uma outra molécula denominada RNA. ( ) d. O nucleossomo é formado pelo empacotamento de RNA com proteínas histonas. ( ) 7) Considere os seguintes eventos e marque a sequência correta: I. Adição de nucleotídeos pela DNA Polimerase III II. Relaxamento das fitas de DNA superhelicoidizadas pela DNA Toiposomerase . III. Ligação das proteínas DBP para estabilizar as fitas simples e mantê-las aberta. IV. Atividade corretora da DNA Polimerase I V. Abertura das fitas pelo rompimento das ligaçãoes de hidrogênios realizado pela Helicase VI. Adição de primer pela RNA Primase. VII. Catálise das ligações fosfodiéster restantes pela DNA ligase a) V, III, II, VI, I, VII, IV. b) II, V, III, VI, I, IV, VII c) V, II, III, VI, I, VII, IV. d) V, II, III, VI, I, IV, VII. e) II, V, III, VI, I, VII, IV. f) II, III, V, VI, I, IV, VII 8) Descreva as funções das seguintes enzimas envolvidas na replicação do DNA: a. Topoisomerase: b. DBP: c. Complexo Pré-RC: d. DNA Polimerase: e. Helicase: f. DNA Ligase: 9. A técnica de PCR tem provocado grande impacto nas principais áreas da biotecnologia: mapeamento gênico, clonagem e sequenciamento de DNA, e detecção da expressão gênica. Atualmente, a PCR é utilizada para o diagnóstico de doenças genéticas, bem como na detecção de organismos geneticamente modificados em produtos alimentícios. Sobre o método pelo qual a PCR funciona é correto afirmar que: Justifique sua escolha identificando e explicando os erros. a) Ocorre a ligação dos primers (fragmentos com cerca de 20 pares de bases) complementares a cada uma das extremidades do fragmento de DNA de interesse, permitindo que a polimerase tenha uma extremidade 3’ OH livre para iniciar a síntese. b) A mistura submetida à PCR é resfriada até 55°C ou 65°C após um aquecimento a 95°C para permitir a desnaturação do DNA por DNases específicas. c) Uma enzima especial resistente ao calor chamada Taq DNA polimerase promove a separação da dupla fita de DNA a 95°C. d) Ocorre uma variação cíclica da temperatura durante todo o processo, sendo que, a cada ciclo, a quantidade de DNA aumenta em progressão aritmética e o número de ciclos não pode ultrapassar um período de 24 horas.