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Evolução: modificações que acontecem que vão sendo transmitidas para as gerações seguintes • Variabilidade Como os organismos evoluem?? • A aplicação dos princípios da genética de populações proporciona uma teoria genética da evolução • Seleção natural Evolução molecular • Mudanças evolutivas em nível de DNA Inclui o estudo das taxas de substituição nucleotídicas, a importância das mudanças adaptativas e neutras e as mudanças na estrutura do genoma Evolução de famílias gênicas Descendentes de um mesmo gene ancestral que se modificaram Homólogos: genes relacionados a partir da sequencia de DNA ancestral • Ortólogos: Consequência da especiação. Genes que apresentam a mesma função em organismos diferentes • Parálagos: homólogos originados por duplicação gênica. Genes com funções diferentes • Xenólogos: homólogos resultantes de transferência horizontal de genes entre dois organismos Porque precisamos entender a origem da família gênica? A filogenia nos ajuda a compreender genes funcionais (predição) Como estudar famílias gênicas? Através das suas perdas e duplicações Perdas: processo que remove uma cópia do gene de um genoma existente ou ancestral Duplicação: processo que copia um gene para uma nova localização no genoma Análise filogenética Análises de seleção • Diferencia evolução neutra e seleção natural Testes baseados em códons: • Dentro de populações e entre espécies • Proteínas • Necessário considerar taxas mutacionais desiguais no genoma Razão entre régios sinônimas e não sinônimas: Se for igual a 1 = seleção neutra >1 = seleção positiva <1 = seleção negativa Aplicações: desenho de fármacos, identificação de genes de patogenicidade, candidatos a terapia, classificação funcional de genes desconhecidos, etc. Estratégia de estudos 1. Bancos de dados (referência) 2. BLAST e/ou HMMER para recuperar as sequências homólogas Análises Filogenéticas Análises de seleção
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