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Marianna Lopes – Genética, 4° semestre FTC A L T E R A Ç Õ E S genicas/pontuais MUTAÇÕES CURTAS NO DNA Cada par de dupla hélice do DNA tem a possibilidade de mutar, fazendo pequenas alterações na sequência de bases • Substituição de bases (SNPs) o Transição: Substituição de uma base por outra da mesma categoria química (purina por purina ou pirimidina por pirimidina) o Transversão: Substituição de uma base por outra, porém de outra categoria quimica (purina por pirimidina) • Inserções ou deleções de bases (indels): Altera matriz de leitura, mudando toda a leitura posterior à mutação, além de poder formar uum STOP códon, interrompendo a matriz de leitura CONSEQUÊNCIAS MOLECULARES Depende do local onde a mutação ocorre Regiões codantes (éxons) Mutação em regiões codificantes de proteínas (mais fácil de determinar o efeito) podem formar vários resultados e todos são consequência direta da redundância do código genético e da existência de códons de finalização da tradução Mutações sinônimas (silenciosas) A mutação altera um códon de um aminoácido por outro códon desse mesmo aminoácido devido à redundância do codigo genético • Nunca alteram a sequência de aminoàcidos da cadeia polipeptidica Mutações não-sinônimas (missense) O códon para um aminoácido é trocado por um códon para outro aminoácido, mas, para isso acontecer, os novos aminoácidos formados devem ser carregados positivamente a fim se ligar no DNA (fosfato negativo) • Substituição conservativa: Troca similar (provalvelmente não altera a estrutura e a função proteica) • Substituição não-conservativa: O aminoácido é trocado por outro quimicamente diferente (mudança na estrutura e função da proteína, como ácido glutâmico por valina – anemia falciforme) o Ácido glutâmico e valina são carregados positivamente Mutações sem sentido (nonsense) O códon para um aminoácido é mudado por um STOP códon (UAG, UGA, UGG), levando ao término prematuro da tradução • Quanto mais próximo da região 3’ (fim) do mRNA, menor é o impacto de função da proteína resultante, podendo ter alguma atividade biológica o Muitas dessas mutações produzem proteínas completamente inativas • Evolução: São formadas novas proteínas (outro mecanismo também envolvido na geração de diversidade são os indels e os frameshift) Mutações de matriz de leitura (frameshift) A adição ou deleção de um único par de bases de DNA muda a matriz de leitura no processo de tradução, fazendo com que toda a sequência de aminoácidos após o sítio mutante seja independente, isto é, não tenha relação com a sequência original de aminoácidos e isso leva à perda completa da estrutura e função normal da proteína a depender da altura codificada Regiões não-codantes (íntrons) Regiões sem função, mas que são regulatórias, isto é, têm RNAs funcionais (promotores, enhancers/ estimuladores e silencers – regiões de ligação da RNA polimerase ou de fatores de transcrição), e, por isso, pode-se determinar o efeito da mutação em cada área Marianna Lopes – Genética, 4° semestre FTC • Maior probabilidade de mutação (97% do genoma humano é formado por íntrons) • Consequências: Os impactos são mais dificeis de prever, podendo perturbar (ou criar) um sítio de ligação para fatores de transcrição, o que leva à alterações na quantidade do produto gênico (regulam níveis de expressão da proteína), mas não afetam a estrutura da proteína SURGIMENTO DAS MUTAÇÕES PONTUAIS • Espontâneas: Têm ocorrência natural e surgem na sequência de DNA de qualquer célula aleatoriamente e a qualquer momento • Induzidas: Surgem pela ação de alguns agentes mutagênicos, que aumentam a taxa com a qual as mutações ocorrem naturalmente Mutações espontâneas Surgem a partir de fontes endógenas (compostos estáveis, ROS, superóxido, H2O3 e hidroxilas) ou externas (luz UV, raio X, drogas, etc), atuando no principalmente do processo de replicação do DNA, que, apesar de ser preciso, tem erros cometidos pela DNA polimerase III • Todos os organismos podem reparar seu material genético eficientemente através de uma variedade de mecanismos Erros na replicação do DNA (épsilon) Pareamento errado de nucleotídeos (transição ou transversão) durante a replicação ou adição/deleção de uma ou mais bases (pareamento deslocado ou slliped), que não foram corrigidos pelos sistemas e reparo • Atividade exonucleásica da DNA polimerase III ou I: Reconhece mal pareamento e os remove, reduzindo o nímero de mutações observadas no DNA, mas alguns desses erros ainda escapam da correção • Excisão de bases: Enzimas DNA-glicosidases cortam as ligações base-açúcar, liberando as bases alteradas e gerando sitios apurínicos ou apirimidínicos para que a AP endonuclease corte o filamento danificado e a enzima desoxirribofosfodiesterase remova o trecho, de modo que a DNA polimerase possa preenchê-lo com novos nucleotídeos complementares e enfim a DNA ligase une o arcabouço Lesões espontâneas O DNA pode sofrer danos de ocorrência natural, como a depurinação e a desaminação, ou devido ao estresse oxidativo • Depurinação: Perda de purinas (um mamífero perde cerca de 10 mil purinas em um ciclo celular espontaneamente) o Existe um mecanismo de reparo que remove os sítios apurínicos e os substitui • Desaminação: A enzima uracil-DNA glicosilase remove o grupamento amina, transformando, por exemplo, a citosina em uracila e, assim, a uracila induz o pareamento com a adenina na replicação e, então, sem reparo, resulta no pareamento G-U (DNA não tem uracila) ao ínves de G-C • EROs (superóxido, peróxido de hidrogênio e radicais hidroxila) são resíduos metabólicos da respiração celular que podem causar danos oxidativos ao DNA Mutações induzidas Mutação causadas por fatores indutores presentes no ambiente, como agentes físicos (radiação UV e raios X), químicos (cigarro, peróxido de benzoíla, nitratos, etc) e biológicos (agentes infecciosos – HPV e H. pylori) Incorporação de análogos de base Alguns compostos químicos são suficientemente similares às bases nitrogenadas normais do DNA, fazendo com que ocasionalmente sejam incorporadas ao DNA em lugar das bases normais, mas, apesar da semelhança, esses compostos têm propriedades de pareamente diferentes das bases originais, podendo produzir mutações nas fitas replicadas (existem em uma só fita, que é fixada pelo processo de replicação) • 5-bromouracil (5-BU): Análogo da timida, capaz de mudar para uma isoforma ionizada positivamente, que se pareia com a guanina • 2-amino-purina (2-AP): Análogo da adenina, capaz de se parear mais frequentemente com a timina, mas também faz mal pareamento Marianna Lopes – Genética, 4° semestre FTC com a citosina quando protonado em laboratório (não ha mecanismos de reparo) Mal pareamento específico Agentes alquilantes não são incorporado ao DNA, mas adicionam um grupamento alquil em uma base, fazendo um mal pareamento especifico • Exemplo: Adição de um grupo alquila no carbono 6 da guanina pode criar a molécula O- 6-alcilguanina, que causa um mal pareamento direto com a timina • Reparo: Enzimas alquiltransferases ligam-se à base alquilada para transferir os grupos alquila que foram adicionados para si e então a base restaurada volta à posição normal (por exemplo à posição O-6 da gaunina) Dano irreversível a uma base Um grande número de agentes danificam uma ou mais bases e, assim, impedem o pareamento especifico, visto que a DNA polimerase não encontra seu parceiro complementar por pontes de hidrogênio, causando um bloqueio na replicação • Luz ultravioleta: Induz a formação de vários tipos distintos de alterações no DNA (fotoprodutos), que bloqueia a replicação ao causar, por exemplo, duas lesões diferentes que unem pirimidinas adjacentes no mesmo filamento (pirimidina ciclobutano) o Mecanismode esterelização de equipamentos de laboratórios o Reparo: O dímero de pirimidina ciclobutano (CPD) pode ser reparado por uma enzima chamada de CDP fotoliase, que se liga ao fotodímero e o divide para regenerar as bases (fotorreativação) • Radiação ionizante: Formação de moléculas ionizadas (íons instáveis) e excitadas que podem danificar o DNA e isso induz dano ao DNA visto que muitos EROs são produzidos (natureza aquosa dos sistemas biológicos), além de lesar diretamente o DNA, quebrando ligações entre as bases nitrogenadas e a desoxirribose, levando à formação de sítios apurínicos ou apirimidínicos, e pode causar quebras filamentares (efeito letal da radiação ionizante) Agentes intercalantes (biotecnologia): Moléculas planares (brometo de etídio, proflavina, etc) que mimetizam pares de bases, ligando-se nas pontes de hidrogênio para inserir-se entre as bases nitrogenadas do DNA e, nessa posição, pode ocorrer uma inserção ou deleção de um único par de nucleotideos • Brometo de etídio: Marcação do DNA para eletroforense, que fluorese sob luz ultravioleta
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