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Biologia Molecular e Celular Isabel Lima TRANSCRIÇÃO DO DNA Está perdido? As anotações que eu fiz durante a aula estão em preto. Já as anotações feitas durante a leitura do Alberts estão em azul! Em verde estão algumas observações feitas nas aulas para tirar as dúvidas! Referências utilizadas: ALBERTS, B.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; et al. Biologia molecular da célula. Artmed, 2010. INTRODUÇÃO ESTRUTURA DO RNA ● Se difere ligeiramente do DNA ● É um polímero linear ● Ribose no lugar da desóxirrobose ○ A presença de uma nova hidroxila dá ao RNA uma função catalítica ● Nas bases temos a Uracila no lugar da timina, ligando com a adenina ● O RNA pode se enovelar de diferentes maneiras a depender da sua função, formando estruturas tridimensionais que exercem funções específicas A TRANSCRIÇÃO ● Utiliza uma fita de DNA como molde ● O promotor determina o início e o sentido da síntese ● Não são necessários os primers ● O RNA é sintetizado pela RNA polimerase ○ Não possui uma fase de correção complexo. Mas ele pode retroceder até um erro e iniciar uma fase de excisão e readição, sendo um mecanismo de correção muito simples quando comparado à DNA polimerase Biologia Molecular e Celular Isabel Lima ● A síntese também é 5’ → 3’ enquanto que a sua leitura é 3’ → 5’ ● Acontece a abertura da dupla hélice e terminada a síntese daquele par, a fita dupla volta a se fechar ○ Isso permite a leitura de vários genes ● A síntese segue de acordo com o pareamento de bases complementares entre a fita de DNA molde e a fita de RNA a ser sintetizada. TIPOS DE RNA ● RNAm → Mensageiro, serve de molde para a tradução ● Os RNA não codificadores são aqueles que não originam uma proteína ● rRNA → Ribossômicos ● tRNA → Transportador, forma o adaptador que seleciona os aminoácidos e os colocam no local adequado nos ribossomos durante a tradução ● snRNA → RNA nucleares, promovem o splicing do pré-RNAm para formar o RNAm maduro ● snoRNA, miRNA, siRNA, piRNA, IncRNA…. ATENDE À SINAIS 1. Promotor procura uma sequência de bases reconhecível pelo fator sigma da RNA polimerase procariotica por meio da holoenzima RNA-polimerase 2. Esse sigma coloca-se o promotor no ponto +1, sendo que ele é um promotor downstream 3. Inicia-se a síntese 4. Até a chegada à um ponto de terminação ● Promotor ⇒ fica a -10, sendo uma sequência de ATATAA na fita molde ou a -35, sendo uma sequência de AACTGT na fita molde ● Ponto de finalização ⇒ CGGCGGTC seguindo para uma sequência de Adeninas (4) ○ Essa sequência AAAA é uma sequência mais frágil Biologia Molecular e Celular Isabel Lima FASES DA TRANSCRIÇÃO EM PROCARIOTOS 1. Helicases abrem a dupla fita (10 / 14 bases) ⇒ complexo promotor aberto 2. RNA polimerase + sigma procurando o promotor 3. Encontra-se o promotor 4. Inicia a transcrição a. Pode ser abortiva, liberando a RNA poli + sigma 5. A RNA polimerase lê o molde de DNA no sentido 3’ → 5’ 6. Convoca um ribonucleotídeo complementar 7. Reação de polimerização acontece por uma desidratação no sentido 5’ → 3’ 8. Forma-se a fita de RNA⇒ fita simples complementar à fita dupla hélice a. Troca das bases → ao ler Adenina, coloca-se uma Uracila. 9. Alongamento 10.Encontrado o ponto de terminação a. Região rica e invertida de citocinas e guaninas seguidas de uma região rica em adeninas b. Os que são transcritos formam um grampo que desestabiliza a ligação polimerase e encerra a síntese 11. Liberação da RNA poli + sigma 12.Fechamento da dupla-hélice ● O sentido da transcrição depende do promotor (ordem de -35, -10 e +1) ○ Para os genes na fita 3’ → 5’, a transcrição ocorre no mesmo sentido, produzindo uma fita 5’ → 3’ ○ Para os genes na fita 5’ → 3’, a transcrição ocorre no sentido oposto, preservando a produção da fita no sentido 5’ → 3’ ● A fita usada como molde varia de gene para gene, sendo que o promotor que determina qual será a fita molde Biologia Molecular e Celular Isabel Lima ● Nos procariotos pode acontecer uma sobreposição gênica, em que dois genes diferentes que podem ser transcritos estão na mesma localização EM EUCARIOTOS TIPOS DE RNA POLIMERASE ● RNA poli I → Genes do rRNA, 5, 8s, 18s, 28s ● RNA poli II → Todos os genes que codificam proteínas (RNAm) + snoRNA, miRNA, incRNA e snRNA ● RNA poli III → Genes de tRNA, rRNA 5S, alguns snRNA e outros pequenos RNAs ● Esses RNA poli dependem de fatores gerais de transcrição para iniciar a transcrição. ○ RNA poli II → Fatores II ⇒ TF II A, TF II B, TF II C… ○ Eles exercem diversas funções como reconhecimento do promotor, abertura da dupla hélice, recrutamento da RNA polimerase e etc ○ Se ligam à sequências ricas em AT para iniciar a transcrição ⇒ TATABOX O PROCESSO 1. Reconhece-se o TATA-box (TATAA) pela ação TF2D + TBP 2. Depois liga-se o TF2B 3. São convocados os ativadores transcricionais que se ligam à sequência de DNA estimulador 4. Ação do complexo proteico Mediador, que permite que os ativadores transcricionais se comuniquem adequadamente com a RNA poli II e com os fatores gerais de transcrição. 5. Atração de fatores gerais de transcrição e da RNA poli II Biologia Molecular e Celular Isabel Lima 6. Na sequência, associa-se o TF2E e o TF2H que têm ação de helicase Liga-se o TF2F 7. A TF2H tem uma atividade quinase, que vai fosforilar a cauda c-terminal da RNA polimerase 8. Essa fosforilação ativa a transcrição 9. Alguns fatores II estão relacionados ao alongamento da fita SEQUÊNCIAS CONSENSO ● São derivadas de muitas comparações entre sequências diversas que apresentam a mesma função básica e que apresentam o mesmo alinhamento de nucleotídeos em cada posição. ● BRE → -35 ● TATA → -30 ● INR → Ponto de início ● DPE → +30 EXISTEM AINDA ● O mediador, interagindo com os fatores seguintes, promovendo uma dobra do DNA, e a RNA poli ● Outros fatores específicos → se ligam à estimuladores ● Fatores gerais Não esqueça de conferir o arquivo com questões sobre esse assunto no meu perfil!
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