AVALIAÇÃO GENÉTICA

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Melhoramento Animal
Maria Eduarda Rocha 
AVALIAÇÃO GENÉTICA
· Pais não transmitem o seu genótipo, mas transmitem amostra de genes.
· Os diferentes gametas produzidos por um mesmo animal vão possuir materiais genéticos diferentes.
 
DEP – Diferença esperada na progênie 
- Bovino de corte e outras espécies
PTA – Predicted Transmiting Ability 
- Bovino de leite
BLUP – best linear unbiased prediciton (Melhores Preditores Lineares não Viciados)
- Método usado para gerar a DEP, através de informações da performance do indivíduo, progênie e parentes. 
- O conjunto de dados utilizados nestas avaliações é composto das mais variadas fontes, como diversos pesos, datas e outras informações observadas nos animais, em seus em parentes e seus contemporâneos. A teoria BLUP possibilita a correta ponderação destas diversas fontes para obtenção da DEP para características de importância econômica e gerencial de todos os animais envolvidos nos dados.
- Consiste na avaliação de informações do próprio indivíduo, informações dos ancestrais e colaterais do indivíduo, informações da progênie do indivíduo, combinando todas elas e assim gerando o BLUP, possibilitando a garantia de valor de DEP para cada característica/animal. 
REML – Máxima Verossimilhança Restrita
- Metodologia para se chegar ao BLUP. 
- Mais utilizada para avaliações entre rebanhos.
- Baixa confiabilidade
- Não calcula diferença entre os ambientes
- Maior número de animais
- Mais utilizado por grandes empresas 
Bayesiana
- Metodologia para se chegar ao BLUP.
- Mais utilizada para avaliações intra-rebanho.
- Maior confiabilidade
- Estima parâmetro genético
- Menor número de animais
- Mais utilizado em fazendas
Modelo Touro 
- Metodologia para se chegar ao REML e Bayesiana. 
- Efeitos fixos e aleatórios
- Utiliza dados das progênies
- Produzidas só DEP’s para touros
- A equação leva em consideração a família paterna. 
Modelo Animal
- Metodologia para se chegar ao REML e Bayesiana.
- Modelo misto (efeitos fixos e aleatórios)
- Utiliza informações de touros, matrizes e progênies e a relação entre eles
- Resultados mais precisos
- Produção de DEP’s para todos os indivíduos
- Comparar animais nascidos em épocas diferentes
- A equação leva em consideração a família paterna e materna.
DIFERENÇA ESPERADA NA PROGÊNIE (DEP)
- Metodologia utilizada para comparar o mérito genético de animais para várias características, além de predizer a habilidade de transmissão genética de um animal avaliado como progenitor (pai). 
- Expressa na unidade da característica (ex: kg para peso, cm para perímetro escrotal, meses para idade ao primeiro parto, etc), com sinal positivo ou negativo.
- Avaliação feita nos pais para estimar o que se espera de superioridade ou inferioridade nos filhos.
- Diferença de desempenho que é esperada para a futura progênie de um touro quando comparado com os filhos de outros touros inseridos na base de dados.
 (
Touro B (DEP365 = +10 kg
)
Estima-se
 que os filhos do touro B tenham em média 
10 kg a mais
 aos 365 dias de idade, 
do que os filhos dos outros touros avaliados. 
) (
Touro A (DEP365 = - 5
 kg
)
Estima-se
 que os filhos do touro A tenham em média 
5 kg a menos
 aos 365 dias de idade, 
do que os filhos dos outros touros avaliados. 
)
Comparação entre o touro A e touro B:
DEP365 = +10 – (-5) = + 10 + 5 = + 15 kg 
Estima-se que os filhos do touro B tenham em média 15 kg a mais aos 365 dias de idade, do que os filhos do touro A. 
OBS: ao fazer o cálculo pegar primeiro o valor do melhor touro. 
 (
SEMPRE
 colocar 
“estima-se” ou “espera-se”!
 
)Exemplo: 
DEP365 touro A = + 35 kg 
DEP365 touro B = + 20 kg 
Comparação entre o touro A e touro B:
DEP365 = +35 – (+20) = +35 – 20 = + 15 kg 
Estima-se que os filhos do touro A tenham em média 15 kg a mais aos 365 dias de idade, do que os filhos do touro B. 
· Acurácia
• Grau de confiabilidade que se tem do valor da DEP.
• 0 a 100% (porém nunca será 100%). 
• Os valores da acurácia dependem da quantidade e distribuição das informações que se tem sobre o animal. 
• Quanto maior o valor, maior é a confiança de que a DEP não sofrerá grandes alterações com a inclusão de novas informações.
- Numa situação em que se têm dois animais de mesmo valor de DEP, porém com acurácias diferentes, o animal de maior acurácia será mais valorizado. 
- Geralmente animais mais velhos possuem maior acurácia, pois o banco de dados possuirá mais informações sobre eles. 
- Em alguns casos torna-se interessante o uso de touro jovem com acurácia não tão alta, mas com um valor de DEP muito bom, pois por ser um animal jovem, é possível melhorar a DEP e acurácia através de acasalamentos e seleção genética, provando que o animal tem potencialidade para melhorar. 
 (
O uso da genômica pode aumentar a acurácia. 
)
Sistemas de seleção:
• Desempenho
• Pedigree
• Progênie
• Uso de média de vida
► DEP de Pedigree
• É calculada a partir da genealogia do animal.
• Pode ser feita para animais que ainda nem nasceram.
• Nem sempre o maior valor será o escolhido.
• Permite descobrir potenciais reprodutores. 
• Baixa acurácia, pois ainda não foi considerado o desempenho do próprio animal e de suas progênies. 
• DEP pode sofrer alterações com a inclusão dessas informações.
• Animais jovens sem desempenho fenotípico e animais FIV ou TE sem progênies.
► DEP Interina
• É calculada pelas informações de genealogia, associadas ao desempenho do animal dentro de grupos contemporâneos (genealogia + desempenho). 
• Acurácia média.
► DEP de Progênie
• Calculada com as informações de genealogia, desempenho do animal e de suas progênies (genealogia + desempenho + progênies). 
• Quanto maior o número de progênies avaliadas e mais ampla a distribuição em diferentes grupos de contemporâneos e de rebanhos, maior a acurácia desta estimativa.
► DEP Genômica
• Calculada com informações acrescidas dos valores moleculares. 
• A interpretação é igual a da DEP tradicional 
• Será acrescida nas outras DEP’s. 
• Vantagens: aumentar a acurácia dos animais jovens e diminuir o intervalo de gerações
• Seleção para variações de DNA específicas que estão associadas a uma característica particular
· Marcadores moleculares:
• Locais ao longo do genoma bovino, onde os animais diferem em genótipos
• A maioria são apenas “marcadores” e não “mutações funcionais”
• Valor molecular predito ou genômico
• Combinação com demais DEPs
• DEP Genômica
• Atualmente, um teste genômico custa em torno de 150 reais. 
Espera-se que a progênie do touro A seja em média superior às progênies dos outros touros em: 
+3,44 kg em relação a B 
+4,64 kg em relação a C 
+2,24 kg em relação a D
· Percentil
• Auxilia o criador a situar a DEP apresentada no rol de animais avaliados de cada raça. 
• Quanto menor o valor do percentil, melhor o animal será naquela característica. 
• Exemplos: 
» TOP 5% = o animal está entre os 50 melhores a cada 1000 animais avaliados. 
» TOP 0,5% = o animal está entre os 5 melhores a cada 1000 animais avaliados. 
» TOP 0,1% = o animal é o melhor a cada 1000 animais avaliados.
AVALIAÇÃO GENÉTICA
• Avaliações dentro do rebanho (intra-rebanho): 
 Relatórios periódicos de acompanhamento
• Avaliações entre rebanhos: 
 Sumário de reprodutores