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Universidade do Estado do Rio de Janeiro Curso de Ciências Biológicas – Bioquímica – Avaliação 1 Nome: Thainá Santos 1) As enzimas A e B, que catalisam a reação X ↔ Y foram isoladas de 2 espécies de fungos. O efeito da concentração de substrato na velocidade inicial de cada uma das enzimas está registrado no gráfico abaixo: Qual enzima, A ou B, possui a maior afinidade pelo substrato? Justifique. R: A enzima (A) tem maior afinidade pelo substrato. Pois ela possui um menor km e quanto menor o Km, maior será a concentração com o substrato, portanto, precisa de menos substrato para atingir uma velocidade razoável, que é a metade da velocidade máxima. 2) Qual a diferença entre inibição enzimática e alosteria. Contextualize sua resposta considerando os vários tipos de inibidores e de reguladores alostéricos. R: Os inibidores de enzimas são fármacos projetados para agir em certos substratos específicos. Existem duas classes de inibição enzimática: reversível e irreversível. No grupo reversível, temos as competitivas, que é quando a molécula inibidora se liga ao sitio ativo da enzima, sendo assim, o substrato não consegue se "encaixar" no sítio ativo, e quando não ocorre esse "encaixe" a reação não ocorre, ou seja, a molécula inibidora compete com o substrato pelo sítio ativo, formando o complexo "enzima-inibidor", é importante falar que esse inibidor é parecido com o substrato e que para a inibição competitiva funcionar de maneira eficaz, é preciso que a quantidade de inibidor seja maior do que a do substrato, pois ambos então competindo pelo sitio ativo. No entanto, na inibição incompetitiva não ocorre essa competição pelo sitio ativo, o complexo liga-se a uma região diferente da enzima, porém, como esse inibidor se liga nessa outra região da enzima, o formato da enzima muda, não deixando o substrato entrar, nesse caso, não ocorre competição, mas como o substrato não entra na enzima, não há reação. Há também uma competição denominada de mista, pois ela pode se ligar tanto na região diferente do sitio ativo, como no complexo "ES" formando o "ESI". No caso da inibição irreversível a enzima não retorna a funcionar novamente, havendo a necessidade da síntese de uma nova enzima, pois esse tipo de inibição ocorre quando um inibidor se liga covalente ao sitio ativo ou a um sitio alostérico importante para o funcionamento da enzima. Em relação a inibidores alostéricos, o organismo irá regular a atividade enzimática através de reguladores alostéricos, tais como a presença de sítios alostéricos que modulam de forma positiva ou negativa as enzimas que possuem mais de uma subunidade, a fosforilação e desfoforilação de certos resíduos de enzima podem aumentar ou diminuir a afinidade da enzima por um substrato, regulando sua atividade enzimática, desta forma, as enzimas alostéricas atuam através ligações reversíveis e não covalentes com compostos regulatórios chamados moduladores alostéricos ou efetores alostéricos, que geralmente são metabólitos pequenos ou cofatores. Há enzimas que também são reguladas por modificações covalentes reversíveis. 3) Após uma cirurgia de emergência, devido à presença de grande quantidade de cálculos biliares, uma pessoa teve retirada sua vesícula biliar. Explique a importância da bile na digestão. R: A bile é muito importante para a digestão e absorção da gordura, pois os sais biliares presentes nos componentes da bile auxiliam na emulsificação das partículas de gordura, ou seja, a fase lipídica se dispersa em gotículas menores e é mediada pelos sais biliares. Essas gotículas são chamadas de emulsões e ocorrem mais fortemente após a secreção de sais biliares. Essas gotículas de emulsão são convertidas em partículas menores carregadas chamadas micelas. Essas micelas são importantes porque aumentam a superfície de contato das enzimas digestivas e, portanto, absorvem os produtos da digestão. 4) Uma enzima foi retirada de um dos órgãos do sistema digestório de um porco e, após ser purificada, foi diluída em solução fisiológica e distribuída em três tubos de ensaio com os seguintes conteúdos: Tubo 1: carne Tubo 2: macarrão Tubo 3: banha Em todos os tubos foi adicionado ácido clorídrico (HCl), alterando o pH da solução. Além disso, os tubos foram mantidos por duas horas a uma temperatura de 37 °C. Após esse tempo, observou-se que a digestão do alimento ocorreu somente no tubo 1. a) De qual órgão foi retirada a enzima, e sugira qual enzima poderia ser responsável por esse fenômeno, justificando sua resposta. R: Foi retirada do estômago, porque o estômago digere compostos proteicos em um ambiente de pH ácido. Portanto, a pepsina poderia ser responsável pela digestão das proteínas. b) Se ao invés de ter sido adicionado aos tubos HCl, fosse adicionado NaHCO3, qual seria o resultado esperado? Justifique. R: Como o estômago só pode funcionar em um ambiente de pH ácido, ele não iria digerir nenhum alimento, portanto, a adição de bicarbonato prejudicaria as funções das enzimas presentes no estômago pois o PH ficaria básico. 5) Em um determinado experimento utilizando células tumorais foi induzida uma mutação no gene da triose fosfato isomerase (5ª reação da via glicolítica) levando à inativação dessa enzima. De que forma essa mutação afetaria a produção de ATP? A célula tumoral com essa mutação é capaz de sobreviver? R: Como ocorre essa mutação da enzima fosfotriose isomerase, ela não conseguirá exercer sua função na via glicolítica, que é converter o Di-hidroxiacetona em gliceraldeido 3 fosfato, sendo assim, só terá um gliceraldeido 3 fosfato e consequentemente só será produzido 1 piruvato, com um saldo de 2 ATP, e esses 2 ATP serão usados para compensar os 2 ATP gastos durante a fase de "início" do processo. Desta forma, o saldo de ATP será igual a zero. À medida que o ciclo segue, é produzido 1 piruvato. As células tumorais usarão o piruvato e farão a fermentação do ácido lático para converter o piruvato em lactato. Esse processo produzirá 1 NAD, que retornará ao estado glicolítico, mas o saldo de energia não permanecerá positivo, portanto, mesmo se a célula fizer fermentação, a glicólise não fornecerá energia para a célula sobreviver, causando a morte das células tumorais. Porém, há hipóteses de que a celúla tumoral consegue obter energia através de outras vias, como por exemplo, o metabolismo lipídico, no entanto, todas essas questões ainda estão em discursão. 6) Um aluno de Ciências Biológicas em seu estágio visa estudar a atividade da fosfofrutoquinase-1 (PFK-1) de células musculares de rato. Nesse experimento o aluno adicionou no tubo de ensaio a PFK-1 purificada, frutose-6-fosfato e fosfato inorgânico em solução salina com pH 7,4 a 37 ºC. Com base nos seus conhecimentos de bioenergética proponha qual o resultado do experimento acima e discuta. R: A reação catalisada pela PFK-1 não iria ocorrer, pois não há ATP nessa reação, ou seja, o fosfato inorgânico existente não possui energia e essa energia seria proveniente da clivagem do ATP, que doaria um fosfato para a frutose-6-fosfato virar 1,6 bifosfato, porém como não há ATP, a PFK-1 não consegue realizar essa reação, pois a PFK-1 tem a função de promover reações endergônicas, sendo assim, é necessário energia para acontecer. Portanto, para que essa reação acontecesse precisaria que a reação endergônica estivesse junto de a uma reação exergônica que seria a clivagem ao ATP, liberando energia. Porém como já foi mencionado, não é o caso desse experimento. 7) O Ciclo do Ácido Tricarboxílico envolve um conjunto de importantes reações do metabolismo energético. Descreva esta importância considerando o compartimento em que ocorre, os principais tipos de reações encontradas e as principais moléculas formadas com o objetivo deste ciclo. R: A impotância do ciclo do ácido tricarboxílico é que eleoxida a molécula do piruvato, molécula na qual foi gerada pela glicólise, convertendo-a em mais energia, liberando ATP e liberando NAD e FAD, que produzirão mais ATP por meio da fosforilação oxidativa. Portanto, tanto o ciclo de Krebs quanto os processos de fosforilação oxidativa estão amplamente relacionados. É válido lembrar, que o ciclo do ácido tricarboxílico acontece na matriz mitocondrial, sendo assim, todo o ciclo consiste em oito reações que irão liberar elétrons e íons H + nas reações que serão capturadas pelas moléculas de NAD, que se tornarão NADH, e também serão capturadas por FAD, que se tornará FADH. Os principais tipos de reações que ocorrem neste ciclo incluem: a saída de CO2 que torna possível a entrada da CoA e assim, a união do acetil-CoA com oxaloacetato que ocorre no início do ciclo, formando o citrato e para fazer citrato é necessário a saída do CoA pois é ele que fornece energia e torna possível unir o acetil ao oxalacetato, há também hidratação por inserção de uma molécula de H2O fornecendo H + que será removido por desidrogenação, que leva à liberação de FADH e NADH, e fosforilação ao nível do substrato, gerando ATP, resultando consequentemente na produção de energia através do ATP gerado e pela oxidação do NADH e FADH, que se seguirá posteriormente na fosforilação oxidativa que ocorre na membrana, delimitando a matriz mitocondrial, por conta da participação próxima entre os dois ciclos. Portanto, o ciclo tricarboxílico é uma via anfibólica, uma vez que este ciclo tem função anabólica e catabólica simultaneamente com a função de oxidar uma grande proporção de carboidratos, ácidos graxos e aminoácidos. Sendo assim, o saldo total é de 2CO2 liberado para atmosfera, 3NADH e 1FADH2 para cadeia de elétrons e consequente transformação em energia, e 1ATP, a cada volta no ciclo. 8) O gráfico abaixo representa o consumo de oxigênio de mitocôndrias isoladas de fibras cardíacas de coelhos submetidos a uma dieta rica em carboidratos. Para a avaliação do controle respiratório (celular) do miocárdio foi realizada uma avaliação do fluxo de oxigênio através da técnica de respirometria de alta resolução. Linha azul: concentração O2 na câmara [nmol/mL]; linha vermelha: consumo de O [pmol s-1 10-6 células]. Os números de 1 a 4 representam as adições de: INIBIDORES, SUBSTRATOS DOS COMPLEXOS MITOCONDRIAIS E DESACOPLADORES. Indique o que representa cada número justificando sua resposta de acordo com seus conhecimentos bioquímicos. R: Ao analisarmos o gráfico, podemos observar que nos pontos 1 e 2, eles são correspondente a adição de um substrato nos complexos mitocôndrias. Sendo assim, no ponto 3 ocorre uma adição de um desacoplar e no ponto 4 é uma adição de um inibidor. Portanto, esses fatores ocorrem por conta de um termo denominado de "acoplamento quimiosmotico", onde se diz que a síntese de ATP e o fluxo de elétrons estão constantemente conectados, então, como no ponto 1 e 2 ocorre o aumento do consumo de oxigênio, podemos inferir que a adição de um substrato dará continuidade aos ciclos que geram ATP e assim, dando continuidade a respiração celular. No ponto 3, o consumo de oxigênio se tornou maior que a concentração do oxigênio, deste modo, há a adição de um desacoplador que tem a função de inibir a síntese de ATP dos ciclos, causando uma pequena pausa no fornecimento de elétrons para que a respiração celular continue. Embora que, os agentes de desacoplamento causam redução à síntese de ATP, o valor consumido ainda é superior à concentração de oxigênio, indicando a existência de um ambiente anaeróbio. E por fim, no ponto 4, é adicionado um inibidor, que pode ser um inibidor alostérico. Esse inibidor está sujeito ao controle de um feedback de certos componentes, resultando em uma diminuição no consumo de oxigênio, já que ele se liga aos complexos da cadeia transportadora de elétrons, e isso impende a passagem de elétrons pela cadeia e por consequência ao aceptor final, que é o oxigênio, isso explica essa alta diminuição nos níveis de consumo do oxigênio. Tempo min/h 3) Após uma cirurgia de emergência, devido à presença de grande quantidade de cálculos biliares, uma pessoa teve retirada sua vesícula biliar. Explique a importância da bile na digestão.
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