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DIAGNÓSTICO PRÉ- IMPLANTACIONAL Hellen Caldas - Medicina Indicação: • Oligozoospermia • Mosaicismo gonadal • Idade materna avançada • Mutações gênicas • Rearranjos estruturais • Abortos anteriores – causas desconhecidas Hellen Caldas - Medicina Triagem no óvulo e no espermatozoide CONCEPÇÃO Primeiras divisões celulares Remoção de 1 ou 2 blastômeros Análise genética Evitar implantação de embrião inviável Sem prejuízo: Células totipotentes Hellen Caldas - Medicina FISH • Hibridação in situ por Fluorescência (FISH) • Técnica de citogenética molecular • Sondas de DNA marcadas com fluorescência • Detecta anomalias cromossômicas: microdeleções e rearranjos complexos que estão além do poder de resolução da citogenética clássica. • É possível investigar tecidos preservados, tecidos fixados em formol, preparações para citogenética convencional, amostras de sangue periférico, medula óssea e as amostras pré-natais como vilosidade coriônica, líquido aminiótico, sangue fetal e material de abortamento. Hellen Caldas - Medicina PCR • Modelo de amplificação de DNA in vitro • Baseia-se na amplificação de pequenos fragmentos do DNA (não tem como fazer com todo o genoma, 500 pares de base, no máximo), visando melhor visualização. • Situações em que eu preciso visualizar uma pequena quantidade de DNA. ESTRUTURA DO DNA 2 fitas antiparalelas Bases nitrogenadas, fosfato e pentose. O DNA se transcreve em RNA, que forma proteínas. Hellen Caldas - Medicina Quando eu quiser amplificar o DNA: Extrair o DNA total Adicionar no tubo o primer específico (A PRIMASE NÃO VAI AGIR NESSE CASO!!) para sequência que eu quero identificar. Se o primer conseguir se alinhar: processos normais começam → amostra testada é PCR positivo. Os primers mostram qual região do DNA vai ser amplificada. Processo in vivo: Toda a molécula de DNA tem que ser amplificada para completar a replicação. Primers: sequências que vão se ligar nas regiões de interesse, iniciando a duplicação do DNA. São BEM específicos. Se o desenho do primer for ruim, pode dar errado, porque vai afetar a especificidade. Quanto maior o primer, mais específico ele vai ser (também não pode ser muito grande, pois dificulta o trabalho dele). Hellen Caldas - Medicina • Vários ciclos com variações de temperatura • Só vou trabalhar com a polimerase. • As demais enzimas? Substituídas por variações de temperatura. • O de temperatura rompe as pontes de hidrogênio → Descarta helicase e girase. • A da temperatura promove o reanelamento→ Descarta primase Hellen Caldas - Medicina Reagentes da reação de PCR: • DNA a ser amplificado; • Primers (forward e reverse) – tornam a reação específica; • dNTPs (nucleotídeos que a polimerase utiliza para fazer a extensão da fita de DNA depois que o primer é colocado); • DNA polimerase (extraída de bactérias que tem resistência à variação de temperatura); • MgCl2 – cofator para o funcionamento da DNA polimerase, ativando-a; • H2O RNAse e DNAse free (água sem essas enzimas que digerem material genético); • Tampão – mantém o pH ideal constante para o funcionamento da DNA polimerase. Hellen Caldas - Medicina • Polimerase: depois da ação do primer (necessário para sua ação), duplica uma fita simples de DNA. • Taq polimerase: enzima polimerase do Thermus aquaticus. Sua temperatura de duplicação é de 70-72 graus. Adiciona uma adenina ao final da duplicação da sequência de DNA. Hellen Caldas - Medicina ETAPAS DA REAÇÃO 1. Aquecimento a mais de 90 graus para a separação da dupla fita (desnaturação). Separa tanto a fita de DNA original, quanto seus produtos de amplificação. Permite o anelamento dos primers. 2. Anelamento/hibridização dos primers: Temperatura varia entre 40-70 graus, conforme o par de primers. Determina a especificidade da ligação. 3. Extensão dos primers (duplicação do DNA): Temperatura ótima em torno de 72 graus. Termociclador é utilizado na reação. 4. Ao final da reação, a quantidade de DNA amplificado em relação ao DNA inicial é igual a 2^n, sendo que n= número de ciclos da PCR. 5. -Efeito Plateau: desvio da quantidade teórica - perda da atividade da polimerase, acúmulo de inibidores, limitação dos componentes, competição entre produtos, pareamento produto X molde, competição com anelamento dos primers. Hellen Caldas - Medicina Hellen Caldas - Medicina
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