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08/05/2013 1 Clonagem de DNA DNA Recombinante MSc Eliamara Barroso Sabino DNA Clonagem Processo que permite isolar, do DNA total de uma célula, determinada seqüência de DNA e multiplicá-la indefinidamente em clones exatamente iguais Consiste em um processo de múltiplas etapas, envolvendo a inserção de fragmentos de DNA em moléculas especializadas de DNA (vetores), que são capazes de serem introduzidas, replicadas e/ou expressas no interior de células hospedeiras vivas específicas; selecionar o clone com o fragmento de interesse Clonagem Um modo de se obter as inúmeras cópias de um fragmento de DNA é colocar o DNA de interesse em uma bactéria e deixar que ela replique o DNA Vetores •Moléculas que transportam fragmentos de DNA para dentro da célula hospedeira • Vetor ideal: plasmídeos capacidade natural de penetrar em bactérias Plasmídeo Bacteriófagos Cosmídeo 08/05/2013 2 Classes de Vetores de Clonagem • Vetores plasmidiais – pequenas moléculas circulares de DNA que replicam o seu DNA independente do DNA do cromossomo bacteriano – DNA de até 15 kb • Bacteriófagos vetores – mais utilizado é o bacteriófago l, que infecta E. coli. fragmentos de até 23 kb; transferem DNA exógeno para células hospedeira mais eficientemente Classes de Vetores de Clonagem • Cosmídeos vetores –clonam fragmentos de cerca de 44 kb. •Vetores de expressão – quando a meta da clonagem é replicar o gene e expressa-lo (produzir a proteína que ele codifica). Vetores de Clonagem Vetor efetivo de clonagem - 3 características: • Origem de replicação - seqüência de DNA que garante a replicação do vetor dentro da célula (DNA polimerase da E. coli e outras proteínas necessárias para iniciar a síntese de DNA ligam-se ao ori). Na ausência de uma origem de replicação, o DNA inserido é degradado ou diluído no interior da cultura. • Marcadores selecionáveis - permitem que todas as células que contenham o vetor sejam selecionadas ou identificadas; genes de resistência aos antibióticos. Vetor efetivo de clonagem - 3 características: • um ou mais sítios únicos de restrição nos quais um fragmento de DNA possa ser inserido; os sítios de restrição usados para clonagem devem ser únicos. Vetor de clonagem Plasmídeo Região onde o DNA exógeno será inserido Região de Restrição 08/05/2013 3 CLONAGEM VETOR: Molécula de DNA usada como um veículo para transportar seqüências de DNA alheio para uma célula hospedeira; PLASMÍDIO: Molécula circular de DNA encontrada em bactérias, que se duplica independentemente do cromossomo principal e que é transferido naturalmente de uma espécie à outra (utilizado como vetor) - tamanho: 1000 - 200 000 pb - transportam genes que conferem resistência à antibióticos Marcadores selecionáveis • Gene de resistência a antibiótico • Gene LacZ – codificante para a enzima β- galactosidase: quebra lactose para produzir glicose + galactose PLASMÍDEOS UTILIZADOS EM CLONAGEM Vetores de inativação insercional • Bactérias transformadas semeadas em meio de cultura contendo o substrato cromatogênico X-GAL (5-bromo-4-cloro- 3-indolil-β-galactosidase) formam colônias azuis: β-galactosidase hidrolisa substrato X-GALproduz precipitado azul no meio de cultura apropriado • Inserção de DNA exógeno no sítio de policlonagem do plasmídeo inativa o gene Lac Z colônias brancas Clonagem gênica http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Plasmids.png 08/05/2013 4 Clonagem gênica – etapas básicas A clonagem envolve 6 etapas: 1. A obtenção e preparo do DNA: corte com enzima de restrição (fragmento de interesse e vetor) 2. Inserção do fragmento de interesse (inserto) em um vetor de clonagem. 3. Introdução do vetor recombinante recém formado em uma célula hospedeira apropriada Clonagem gênica – etapas básicas 4. Replicação do vetor recombinante no interior de células hospedeiras transformadas por suas propagações em cultura in vitro 5. Seleção e expansão de clones individuais de células portadoras dos recombinantes desejáveis 6.Isolamento e análise dos insertos de DNA ou produtos protéicos expressos Clonagem Molecular • DNA alvo • Vetor – plasmídeo • Enzima de restrição • DNA ligase • Transformação bacteriana • Seleção de gene expresso • Bibliotecas de DNA Enzima de Restrição • Endonucleases: -Reconhecem seqüências curtas e específicas no DNA; -Clivam as duas fitas do DNA: -posições diferentes (extremidades coesivas);-mesma posição (extremidade cega); - Sequências palindrômicas. 08/05/2013 5 Animação Aplicação médica transformation2.exe transformation2.exe 08/05/2013 6 Animação Purificação de fragmentos de restrição PCR e Eletroforese Biblioteca de DNA e cDNA transformation1.exe 08/05/2013 7
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