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Orígenes de replicación (ORI) La duplicación del ADN en células procariotas se origina en los ORI → en estos orígenes de replicación se lleva a cabo la APERTURA LOCAL DE LA HÉLICE DE ADN → es un proceso costoso desde el punto de vista energético ya que se deben romper los PdH que se establecen entre las bases. EL proceso de apertura se ve favorecido cuando hay secuencias ricas en el par de bases A-T → ya que solo poseen 2 PdH y que por lo tanto la energía necesaria para la apertura sea menor. ENTONCES → una vez que se realiza la apertura local de la hélice de ADN a partir de los ORI → se lleva a cabo la extensión de una de las horquillas de replicación en sentido 5’ → 3’ (flecha verde) al igual que otra horquilla de replicación en sentido 5’ → 3’ (flecha bordo). A PARTIR DE ESTAS DOS HORQUILLAS DE REPLICACIÓN → la primasa lleva a cabo el inicio de la replicación a partir de los cebadores de ARN → lo que constituye una BURBUJA DE REPLICACIÓN → FORMADA POR DOS HORQUILLAS DE REPLICACIÓN QUE CRECEN DE MANERA BIDIRECCIONAL. Procariotas EN EL CASO DE LAS CÉLULAS PROCARIONTES → la célula tiene un único cromosoma constituido por una única molécula de ADN en alfa hélice → pero dispuesta en el espacio de manera circular. Se va a extender la burbuja de replicación hasta llegar a completar la duplicación de esa única molécula de ADN dispuesta de manera circular. ENTONCES → se van a formar nuevas cadenas a partir de las cadenas cebadoras → que copiaran todo el cromosoma. Este crecimiento, esta replicación bidireccional genera: una HORQUILLA DE REPLICACIÓN 1 que tendrá un crecimiento de la hebra conductora en 5’ → 3’ y la rezagada correspondiente. 13° T E O R I C O una HORQUILLA DE REPLICACIÓN 2 → que tiene una cadena conductora 2 y una rezagada 2. Los ORI, además de presentar, en su secuencia nucleotídica, un fragmento rico en A-T de manera tal de poder ser abierta mediante la ruptura de los 2 PdH permitiendo así el acceso de los complejos enzimáticos que llevan adelante la replicación → los ORI de las células procariotas PRESENTAN UNA SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS QUE INTERACCIONAN DE MANERA ESPECÍFICA CON LAS DENOMINADAS PROTEÍNAS INICIADORAS → SE ESTABLECE UNA INTERACCIÓN ENTRE PROTEÍNAS QUE INICIARAN EL PROCESO DE DUPLICACIÓN Y SECUENCIAS ESPECÍFICAS EN EL ORI → y cuando se produce esta interacción, el ADN se curva en el espacio → y este reordenamiento funcional de ese segmento de la molécula de ADN en el cromosoma procariota posibilita la interacción con la enzima HELICASA (HELICASA ADN B es la que participa en la apertura de ADN)→ ésta helicasa está unida a un CARGADOR DE HELICASA → la unión del cargador de helicasa- helicasa evita que tome contacto con el ADN → y solo puede interaccionar con el ADN en el ORI en el momento en donde se produjo ese cambio conformacional que desencadeno la unión de las proteínas iniciadoras. UNA VEZ QUE SE UNEN LAS PROTEÍNAS INICIADORAS → el ADN adquiere una conformación en el espacio que permite la interacción con la helicasa ADN B → al interaccionar con esta secuencia de ADN → tiene mayor afinidad que por el cargador, con lo cual el cargador se desprende y de esta manera la helicasa queda activa para iniciar todo su proceso de apertura de la molécula de ADN y permitir la entrada de la primasa → y de esta manera, a partir de la PRIMASA COMENZAR EL PROCESO DE SÍNTESIS DE LA CADENA REZAGADA (según el ejemplo del gráfico) a partir de la polimerasa delta. EN EL CROMOSOMA PROCARIONTE LA REPLICACIÓN SUCEDE UNA ÚNICA VEZ → para que a partir del cromosoma original se obtenga una copia idéntica de ese cromosoma formado por la hebra parental y la hebra recientemente formada → de manera tal que las células hijas reciban una sola copia de ese cromosoma único. Recién duplicado el cromosoma → aparece en sus ORI, además de la secuencia rica en A-T y de la secuencia que reconoce a las proteínas iniciadoras → HAY UNA SECUENCIA QUE ES LA SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS GATC QUE ES SENSIBLE A LA METILACIÓN. Entonces → en el cromosoma parental original habrá secuencias GATC en el ORI metiladas tanto en una como en la otra hebra. Cuando se inicia el proceso de duplicación del ADN (imagen del centro) a partir de la formación de la burbuja de replicación → la hebra parental superior sigue estando metilada en esas secuencias GATC al igual que la hebra parental inferior → PERO LA METILACIÓN NO OCURRE EN LAS HEBRAS HIJAS → a medida que se inicia y avanza la replicación, las hebras parentales permanecen metiladas mientras que las hebras recién sintetizadas no. Entonces, esta HEMIMETILACIÓN (metilación presente en solo una hebra y solo en las parentales) → MARCA DE MANERA MOLECULAR CUAL ES LA HEBRA PARENTAL → y esta hemimetilación PERMITE LA INTERACCIÓN DE LOS RESTOS METILOS CON UNA PROTEÍNA LLAMADA SeqA → y la hemimetilación interaccionando con la proteína SeqA provoca una inhibición conformacional estérica en el espacio que evita que nuevas proteínas iniciadoras interaccionen con los ORI. Si la proteína iniciadora no puede interaccionar con la secuencias de los ORI no podrán iniciar nuevas horquillas de replicación y consecuentemente nuevas burbujas de replicación → ES UNA MANERA DE CONTROLAR QUE LA DUPLICACIÓN SE INICIE UNA ÚNICA VEZ. La hemimetilación se mantiene por un corto tiempo → hasta que una enzima llamada ADN METILTRANSFERASA (DAM) comienza a metilar a las hebras hijas → ahora se tiene metiladas tanto las hebras parentales como a las recién sintetizadas → DANDO LUGAR A UN NUEVO ORI. Cada uno de estos cromosomas generados por duplicación única del cromosoma procarionte → presenta en sus ORI las secuencias ricas en A-T, secuencias de unión a proteínas iniciadoras y secuencias GATC que puedan ser metiladas → las secuencias GATC no participan solamente en el control por la hemimetilación del proceso de replicación único del cromosoma procarionte sino que también están distribuidos a lo largo de todo el cromosoma y PARTICIPAN EN LA DETECCIÓN DE ERRORES DURANTE EL PROCESO DE REPLICACIÓN PROCARIONTE Y LA POSTERIOR REPARACIÓN. Eucariotas En el caso de las células eucariotas hay entre 20 a 80 orígenes de replicación (ORI) por cromosoma → cada uno de estos ORI da lugar a la formación de una burbuja de replicación. IMAGEN → en las burbujas aparecen las hebras de ADN hijas (en rosa) mientras que el ADN paterno está en negro. En la célula eucariota estos 20 a 80 ORI se activan en grupos para iniciar el proceso de replicación → hay grupos que se activan a determinados períodos de tiempo dentro de la fase S → estos grupos se llaman UNIDADES DE REPLICACIÓN y cada una de ellas presenta varios ORI. Cultivo de células eucariontes sincronizadas en una fase del ciclo celular (en este caso, la S). Para sincronizarlas, en el medio de cultivo se las restringe del suero fetal bobino → se saca del medio de cultivo el SFB → al no suplementar con mitógenos, todas las células irán sincronizándose en una etapa del ciclo celular → CUANDO LLEGAN A ESA ETAPA SE LAS LLEVA A FASE S VOLVIENDO A ADMINISTRAR SFB Y TODAS ESTARÁN SINCRONIZADAS. Cuando las células en cultivo están sincronizadas en fase S → se hacen pulsos de periodos cortos en los cuales al medio de cultivo se le adiciona BROMO DE OXIURIDINA (BrdU) → es análogo a la timidina, lo que hace es incorporarse durante la replicación en fase S a las nuevas hebras de ADN hijas → luego se lo lava, se incorpora TIMIDINA y se deja que siga avanzando en la fase S. Luego, ya en la fase M, los cromosomas alcanzan su máxima condensación → en este cromosoma mitótico se busca ver la formación de bandas a partir de la aparición en cada uno de estos cromosomas, de una hebra que haya incorporado bromo de oxiuridina y en la otra hebra timidina → se verán brillantes; mientras que aquellas bandas en dondese haya incorporado bromo de oxiuridina en ambas hebras → serán más opacas. Aparece un patrón de bandas brillantes señaladas con flechas que corresponden a la BrdU-timidina en la fase S temprana → diferente al patrón de bandas que aparece en la fase S media y que a su vez es diferente al patrón que aparece en la fase S tardía. HAY GRUPOS DE ORI QUE SE ACTIVAN EN LA FASE S TEMPRANA, DIFERENTES A LOS QUE SE ACTIVAN EN LA FASE S MEDIA Y TARDÍA → los grupos de orígenes de replicación se activan de diferente manera a lo largo de la fase S del ciclo de la célula eucarionte. Particularmente → LA FASE S TARDÍA SE CARACTERIZA POR ACTIVAR LAS UNIDADES DE REPLICACIÓN RELACIONADAS A LAS ÁREAS DE HETEROCROMATINA EN EL CROMOSOMA → es decir, aquellas ÁREAS DE MÁXIMA CONDENSACIÓN QUE CORRESPONDEN A LOS TELÓMEROS Y CENTRÓMEROS → las unidades de replicación más tardías que se replican son las que corresponden, también, al cromosoma X (en las hembras uno de ellos está desactivado por heterocromatización → si se debe duplicar ese cromosoma, corresponderá a las unidades de replicación más tardías). Entonces → PARA LAS CÉLULAS EUCARIOTAS → se requiere de unidades de replicación, cada una integrada de 20 a 80 ORI por cromosoma → LA ACTIVACIÓN DE LOS ORI NO ES SECUENCIAL SINO QUE VARÍA A LO LARGO DE TODO EL PROCESO DE SÍNTESIS. A lo largo del proceso de replicación hay un remodelamiento de la cromatina para permitir el avance de la horquilla de replicación y para heredar en las copias hijas el patrón de modificación de histonas que controla de manera epigenética la expresión del genoma a través de la heterocromatización → a medida que avanza la horquilla de replicación → las hebras de ADN parental mantienen una asociación con los tetrámeros de histonas H3 y H4 mientras que los dímeros de H2A y de H2B son disociados del core del nucleosoma → cuando se re-ensamblan se tiene algunas hebras que presentan tetrámeros H3-H4 y a su vez otras que incorporan nuevos tetrámeros H3-H4 junto a nuevos dímeros H2A-H2B. INICIALMENTE HAY NUCLEOSOMAS PATERNOS MODIFICADOS (metilación, acetilación, incorporación de molécula de ubiquitina) → cuando se produce la horquilla de replicación y la reformulación de nucleosomas en los cuales en algunos se mantendrán los tetrámeros H3-H4 y en otros no → el patrón de modificaciones aparece tanto en una molécula de ADN como en la otra → algunos van a mantener las modificaciones de los nucleosomas paternos y otros no. PERO ESTAS MODIFICACIONES QUE SE MANTIENEN LUEGO DE LA REPLICACIÓN → PUEDEN SER AHORA LEÍDOS EN LOS NUCLEOSOMAS HEREDADOS POR LOS COMPLEJOS RECTORES DE HISTONAS → LOS COMPLEJOS LECTORES DE HISTONAS, AL RECONOCER LAS MODIFICACIONES → PUEDEN INTERACCIONAR CON COMPLEJOS PROTEICOS ENCARGADOS DE ACTIVAR FUNCIONES BIOLÓGICAS → en este caso, COPIARÁN EL PATRÓN DE MODIFICACIÓN DE LOS NUCLEOSOMAS PATERNOS Y LO EXTENDERÁN A TODOS LOS NUCLEOSOMAS DE LAS DOS MOLÉCULAS DE ADN GENERADAS A PARTIR DE LA REPLICACIÓN DE ESE CROMOSOMA EUCARIONTE. La célula eucariota posee varios ORI que se activan de manera grupal formando unidades de replicación. Imagen → cromosoma 3 de la levadura → en este cromosoma se observan las zonas correspondientes a los telómeros en ambos extremos y el centrómero marcado en negro; también aparecen bandas verdes que corresponden a los ORI (hay varios) → si se analiza uno de estos ORI se observa que en la secuencia de nucleótidos aparece una región fácil de desenrollar debido a la presencia de A-T. También → hay una SECUENCIA DE ADN (marcada en rojo) → que es un SITIO DE UNIÓN PARA LA PROTEÍNA ORC (complejo de reconocimiento del origen de replicación) → esta secuencia de ADN interacciona de manera específica con el complejo de reconocimiento del origen o proteína ORC. Y a su vez → el origen de replicación de las células eucariotas tiene una secuencia de nucleótidos en azul → que en este caso corresponde a una SECUENCIA DE RECONOCIMIENTO DE PROTEÍNAS AUXILIARES → permiten el inicio de la replicación en la célula eucariota en cada uno de los ORI. ¿Cuántas veces se duplicará cada cromosoma? → por cada ciclo celular, cada cromosoma se duplicará en la fase S una sola vez para asegurarse que el número de copias que llegue a cada célula hija sea idéntica al número de cromosomas que tiene la célula madre. ENTONCES → LAS CÉLULAS EUCARIOTAS DEBEN DESARROLLAR UN MECANISMO DE CONTROL QUE PERMITA QUE SOLAMENTE SE DUPLIQUE CADA CROMOSOMA UNA SOLA VEZ POR CICLO CELULAR. Cuando el complejo ORC interacciona con la secuencia con la secuencia del ADN que reconoce por complementariedad molecular → el complejo sufre un cambio conformacional que permite la asociación de dos proteínas cargadoras de helicasa denominadas CDC6 Y CDT1 → entonces se tiene, en fase G1 del ciclo celular, el COMPLEJO DE RECONOCIMIENTO DEL ORIGEN (ORC) interaccionando con la secuencia en el origen de replicación y a su vez interaccionando con las dos cargadoras de helicasas CDC6 y CDT1 → esta asociación ORC-cargadoras de helicasas tiene una disposición tridimensional en el espacio que permite la unión de 2 helicasas (MCM) → por cada unión de la proteína ORC a su secuencia en el ORI interaccionan las proteínas cargadoras de dos helicasas → esta estructura se denomina COMPLEJO PREREPLICATIVO → HAY TANTOS COMPLEJOS PREREPLICATIVOS COMO ORIGENES DE REPLICACIÓN TENGA CADA CROMOSOMA EUCARIONTE. Al no formarse nuevos complejos pre- replicativos → LA CÉLULA SE ASEGURA QUE VA A DUPLICAR CADA CROMOSOMA SOLO UNA VEZ → una vez que se forme la célula hija luego de la mitosis, la actividad será de fosfatasas que cliven ese fosfato y entonces puedan en fase G1 volver a la disposición del complejo pre-replicativo. Telómeros Cadena paterna rezagada en posición 5’ → 3’ y la hebra hija que debe copiarse de la rezagada en sentido 5’ → 3’. El principal problema es que el extremo 3’ corre siempre el riesgo de perder información debido a que en ese extremo 3’ en la cadena rezagada es muy difícil localizar a los cebadores de ARN → siempre existe la posibilidad de pérdida de información. Esos extremos teloméricos son más largos que el resto de la molécula de ADN → se tiene una molécula de ADN con un extremo de cadena simple que tiene a curvarse y formar un lazo → y esa extensión de cadena simple 3’ se mete dentro de la alfa hélice formando el lazo. CADENA REZAGADA PATERNA EN SU EXTREMO 3’ → presenta secuencias tándem ricas en G y T → estas secuencias son reconocidas en el sitio activo de la enzima TELOMERASA. Las repeticiones del telómero en la cadena paterna en posición 3’ resultan un mecanismo que aporta a la célula un sistema de recuento que impide la proliferación ilimitada de la célula → LA LONGITUD DEL TELÓMERO CONTROLA EL NÚMERO DE PROLIFERACIONES. Esto se observa muy bien en CÉLULAS SOMÁTICAS → nacen y completan un número de repeticiones de telómeros que da una idea de cuantas veces se dividirá → es un número ilimitado de divisiones. Otras células → como las CÉLULAS MADRE → retienen una actividad de telomerasa invariable que asegure sus sucesivas divisiones. En OTROS TIPOS CELULARES → esa actividad de la telomerasa disminuye → hay menos actividad a medida que mayores duplicaciones sufrió el cromosoma → determina cuantas veces se duplicara ese cromosoma. ENTONCES SE TIENE 2 PARÁMETROS: LA LONGITUD DEL TELÓMERO EL NIVEL O ACTIVIDAD DE LA TELOMERASA Entonces → después de muchas generaciones celulares las células descendientes heredarán cromosomas defectuosos o con menor longitud de telómeros o con menor actividad en la telomerasa → esto hace que se vaya perdiendo información, los cromosomas que hereden las células hijas serán defectuosos → y en consecuencia frenarán su ciclo celular y dejarán de dividirse → y cuando dejen de dividirse entran en SENESCENCIA CELULARREPLICATIVA → el mecanismo molecular de entrada a la senescencia replicativa es la menor longitud de las regiones teloméricas y la menor actividad de la telomerasa. La replicación de ADN no puede tener errores Existen INESTABILIDADES EN LA MOLÉCULA DEL ADN QUE PROVOCAN MUTACIONES PUNTUALES → una vez replicada la molécula de ADN y dividida luego de la mitosis, los cromosomas en las células hijas pueden sufrir constantemente procesos o agresiones de tipo: radiaciones ionizantes radiaciones ultravioletas movimiento de electrones en la cadena mitocondrial agresión de agentes ambientales oxidación de lípidos en los peroxisomas Todos estos factores pueden provocar mutaciones o alteraciones que pueden llegar a ser SILENCIOSAS, SIN SENTIDO o pueden ser ALTERACIONES QUE MODIFIQUEN EL CONTROL DE LA TRANSCRIPCIÓN → la célula constantemente trata de prevenir que no se acumulen estas modificaciones puntuales y para ello cuenta con MECANISMOS DE REPARACIÓN DEL ADN → que podrán llevarse a cabo durante el proceso de replicación o luego de él. MECANISMO DE CORRECIÓN DE PRUEBAS El primer mecanismo de reparación del ADN → es el mecanismo de corrección de pruebas y OCURRE DIRECTAMENTE DURANTE EL PROCESO DE REPLICACIÓN. Cuando se ubica el nuevo nucleótido en el dominio de la polimerasa → la enzima realiza un cambio conformacional antes de formársela unión covalente ester-difosfato → y este cambio conformacional es producto de un cambio conformacional en las unidades regulatorias que establecen que → A TRAVÉS DE UNA CORRECTA SELECCIÓN DEL NUCLEÓTIDO INCORPORADO ESTE SERÁ COMPLEMENTARIO A LA CADENA PATERNA Y CONSECUENTEMENTE ES EL MÁS FAVORABLE DESDE EL PUNTO DE VISTA ENERGÉTICO. LA ENZIMA CONTROLA, ANTES DEL ESTABLECIMIENTO DE LA UNIÓN COVALENTE FOSFODIÉSTER, SI ES EL NUCLEÓTIDO ADECUADO PARA SER INCORPORADO EN LA CADENA → ESTE CONTROL ES PROPIO DE LA ENZIMA (POLIMERASA) Y SE DA MIENTRAS ESTÁ REALIZANDO EL PROCESO DE POLIMERIZACIÓN, DE EXTENSÓN DE LA CADENA HIJA. En las ADN polimerasas existe un dominio de polimerización que chequea si el nucleótido es el adecuado → si no es el correcto, o sea, si no es favorable desde el punto de vista energético por no ser el complementario a la cadena paterna → LA ENZIMA DESPLAZA A LA CADENA HACIA EL DOMINIO EXONUCLEOTÍDICO → donde se realiza la corrección → en el dominio corrector, la enzima tiene acción exonucleotídica → rompe, lisa, el extremo de la cadena de ADN recientemente sintetizada, la que incorporo el nucleótido inadecuado → luego lo desplaza nuevamente al dominio de polimerización para nuevamente incorporar el nucleótido que corresponda. ESTA CORRECCIÓN DE PRUEBAS QUE SUCEDE DURANTE EL PROCESO DE LA REPLICACIÓN: SE ESTABLECE A TRAVÉS DE UNA ALTA AFINIDAD DEL NUCLEÓTIDO CORRECTO POR LA POLIMERASA EN MOVIMIENTO → las unidades regulatorias van a censar que el nucleótido por incorporar sea el más favorable desde el punto de vista energético → esto lo hace mediante la comprobación de la correcta interacción a través de las subunidades regulatorias → Y SI NO ES EL CORRECTO, SERÁ DESPLAZADO HACIA EL DOMINIO EXONUCLÉOTIDICO donde la actividad exonucleotidica es en sentido 3’ → 5’ ya que es el último nucleótido incorporado. En esta actividad de corrección de pruebas es fundamentalmente importante en la POLIMERASA ÉPSILON (que actúa sobre la hebra conductora) y la POLIMERASA DELTA (que actúa sobre la hebra rezagada); pero el dominio exonucleotídico no aparece en la primasa → esto debido a que la actividad de la primasa no requiere de corrección porque ya de por sí incorpora ribonucleótidos → que desde un punto de vista estructural son mucho más inestables y son marcadores del inicio de la replicación pero luego van a ser degradados. MECANISMO DE REPARACIÓN POR ESCISIÓN DE BASES Muchas mutaciones espontáneas son mutaciones puntuales que implican un cambio en un único par de bases de la secuencia de ADN → la célula intenta reparar las mutaciones puntuales LUEGO DEL PROCESO DE LA REPLICACIÓN a través de un sistema de reparación del ADN por escisión. Los sistemas de reparación del ADN por escisión pueden ser por ESCISIÓN DE BASES → en el caso de la 5-metilcitosina puede desaminarse dando lugar a la 2-desoxirribosa de la timina → entonces, una mutación puntual espontanea puede formarse por desaminación de la 5-metilcistosina para formar timina. Si el par de bases Timina-Guanina resultante no se restablece al par de bases normales (o sea, Citosina- Guanina) por un mecanismo de reparación por escisión → ESTE CAMBIO LLEVARÁ A UN CAMBIO PERMANENTE EN LA SECUENCIA (mutación). LA CÉLULA DEBE PREVENIR EL MAL COPIADO EN EL ADN MUTANTE Y CORREGIRLO ANTES DE LA REPLICACIÓN → antes de la replicación, debe reconocer esta distorsión. El apareamiento incorrecto G-T es reconocido por una ADN GLUCOSILADA que proyecta a la timina hacia el exterior de la hélice de la molécula de ADN → y luego hidroliza el enlace que conecta a la Timina con el esqueleto azúcar fosfato del ADN. UNA ENDONUCLEASA CORTA A LA HEBRA DE ADN CERCA DEL SITIO SIN LA BASE (QUE YA FUE ESCINDIDA) → y ahora que el esqueleto desoxirribosa carece de la base → es reemplazado por una citosina mediante una ADN POLIMERASA DE TIPO β → una vez incorporada la nueva citosina, la enzima LIGASA la une al esqueleto desoxirribosa → permite el establecimiento correcto de la secuencia y la estructura de la molécula de ADN. ADN POLIMERASA BETA → forma parte de la familia de las ADN polimerasas → corresponde a la familia de polimerasas de tipo X → ya que el entorno de la molécula, la conformación tridimensional de la molécula de ADN es diferente al de una horquilla de replicación típica → participa en el proceso de reparación del ADN por escisión de bases. MECANISMO DE REPARACIÓN POR ESCISIÓN DE nucleótidos Además del sistema de reparación del ADN por escisión de bases → la célula puede también reparar el ADN LUEGO DE LA REPLICACIÓN por un sistema de reparación de ADN por escisión de nucleótidos → específicamente, este sistema de reparación se produce sobre los DÍMEROS TIMINA-TIMINA. La RADIACIÓN ULTRAVIOLETA provoca la formación de dímeros o aductos entre dos timinas propias en el esqueleto de desoxirribofosfato de la molécula de ADN → estos constituyen una DISTORSIÓN EN LA MOLÉCULA DE ADN. Estas distorsiones en la estructura tridimensional en la molécula de ADN es reconocido por un complejo de proteínas: EL FACTOR TRANSCRIPCIONAL 2H → posibilita la actividad de endonucleasas → va a clivar a toda una secuencia nucleotídica que incluye al dímero T-T. Luego, una vez retirada esta secuencia → las POLIMERASAS DE ADN DE REPARACIÓN van a copiar la hebra parental, evitando la formación de dímero. Luego la LIGASA va a sellar la nueva secuencia recién sintetizada, complementaria a la hebra parental, sin dímeros T-T → reparando el daño producido por la radiación UV. MECANISMO DE REPARACIÓN PARA LA RUPTURA DE LAS DOS HEBRAS Existen también sistemas de reparación del ADN que se ponen en marcha cuando se ROMPEN AMBAS HEBRAS DEL ADN → estos sistemas de reparación pueden darse a través de dos mecanismos diferentes: Cuando se produce la escisión, la ruptura de las dos hebras en la molécula de ADN en el cromosoma → pueden ser unidos sus extremos no homólogos (IZQUIERDA EN EL ESQUEMA) → EXISTEN ENDONUCLEASAS QUE DEGRADAN ESTOS EXTREMOS DEJANDO EXTREMOS QUE PUEDEN UNIRSE LUEGO POR ACCIÓN DE LAS LIGASAS. UNIÓN DE EXTREMOS NO HOMÓLOGOS El INCONVENIENTE DE ESTE MECANISMO DE REPARACIÓN → es la PÉRDIDA DE UNA PEQUEÑA SECUENCIA DE INFORMACIÓN EN LA MOLÉCULA DE ADN → por lo tanto, si bien es un mecanismo que permite la reparación, es un mecanismo que provoca la pérdida de información. ESQUEMA DERECHA → RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA → lo que permite la reparación de lamolécula de ADN que presenta una doble ruptura es el mecanismo por recombinación homóloga → PARA REPARAR Y PRESERVAR LA INFORMACIÓN DEL ADN DE ESA MOLÉCULA QUE SUFRIÓ UNA ROTURA DE LAS DOS HEBRAS. Recombinación homóloga Una hebra de ADN rota en celeste → cuando la horquilla de replicación avanza y llega al punto de ruptura → se produce un COLAPSO DE LA HORQUILLA DE REPLICACIÓN → si no se repara la ruptura antes de que la horquilla pase por ahí → el resultado será un cromosoma duplicado donde se tenga una de las moléculas de ADN con una longitud normal y otra con una longitud menor → HABRÍA UNA PÉRIDIDA CONSIDERABLE DE LA INFORMACIÓN. Para evitar esto → la cromátide que involucra a la hebra parental → invade a la cromátide intacta para copiarla → esto lo hace a través de una primera digestión nucleotídica de ese extremo (la hebra parental está más corta en el SEGUNDO PASO) → ese extremo más prolongado puede invadir a la cromátide intacta → en EL PASO 3, la hebra rosada tiene la misma secuencia que la hebra parental rota → la hebra conductora roja trata de invadir a la cromátide intacta para copiar la misma secuencia faltante en el espacio roto. 1. se establece el COLAPSO EN LA HORQUILLA DE REPLICACIÓN debido a que una de las hebras parentales está rota. 2. existe una DEGRADACIÓN DEL EXTREMO 5’ de la hebra rota a través de la acción de exonucleasas → se libera un fragmento más largo en la hebra conductora en posición 3’. 3. este fragmento de la hebra conductora más largo en el extremo 3’ es una hebra de ADN DE CADENA SIMPLE → por lo tanto podrá interaccionar con proteínas de unión a cadena simple del tipo Rec A y Rad51 según el organismo → dirigirán el proceso de invasión de la hebra conductora del extremo 3’ → que invadirá la cromátide intacta para poder copiar en la otra horquilla de replicación la secuencia faltante. LA RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA QUE PERMITE LA REPARACIÓN DEL ADN → SE BASA EN EL INTERCAMBIO DE SECUENCIAS DE ADN PRÁCTICAMENTE SIMILARES. Un requerimiento del proceso es la NECESIDAD DE APAREAMIENTO DE BASES → los dos bucles de ADN que sufrirán recombinación necesitan comparar sus secuencias entre sí para permitir un cierto acoplamiento por complementariedad. La molécula que invade a la molécula simple de ADN → como es ADN de cadena simple se unirá a proteínas de unión a cadena simple (RecA y Rad51) → pero para poder quedar libre y formar la cadena simple que puede invadir → el extremo 5’ fue previamente degradado por exonucleasas. Todo este proceso → la generación del extremo 3’ libre, la interacción con proteínas de unión de cadena simple → DIRIGE LA INVASIÓN DE LA CADENA DE ADN SIMPLE HACIA EL DÚPLEX DE ADN PARA CONSTITUIR UN HETERODUPLEX → LA CADENA SENCILLA DE ADN BUSCA EN EL HETERODUPLEX LA SECUENCIA HOMÓLOGA COMPLEMENTARIA → hace el proceso de invasión y migra y trata de reconocer cual es la secuencia homóloga para poder copiarla → TODAVÍA NO ESTÁ ESTABLECIDO EL MECANISMO DE LA BUSQUEDA DE LA SECUENCIA HOMOLOGA PARASU COPIADO → una vez que encuentra a la secuencia homóloga, la cadena sencilla se desplaza en dúplex para formar los pares de bases complementarias. Entonces, en el HETERODUPLEX → es una región del ADN de doble hélice formada por dos cadenas de ADN en la que la horquilla de replicación formaba partir de dos moléculas de ADN diferentes. La complementariedad en el heteroduplex se da entre dos moléculas del ADN que formaban partes de horquillas de replicación diferentes. UNA VEZ QUE SE DETECTA EL PUNTO DE RUPTURA → la actividad de las exonucleasas degrada los extremos 5’ → se generan extremos de cadena simple 3’ que serán los que interaccionen con proteínas de unión a cadena simple del tipo RecA o Rad51 → estos extremos 3’ unidos a proteínas de unión a cadena simple van a invadir la otra cromátide hermana complementaria y copiarán el fragmento de ADN complementario faltante debido a la ruptura. Entonces → si sintetizará la molécula de ADN complementaria a la otra cromátide hermana en el heteroduplex (imagen de la derecha en verde) → y una vez sintetizado el fragmento faltante por la ruptura, la acción de ligasas permitirá la continuidad y la unión de ese fragmento al resto de la hebra parental que tenía esta ruptura de la doble cadena → DE ESTE MANERA SE REPARA SIN PÉRDIDA DE LA INFORMACIÓN Y POR LO TANTO SE MANTIENEN POR RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA LA CARACTERÍSTICAS ESTRUCTURALES DE CADA MOLÉCULA DE ADN.
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