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PROPIEDADES ACIDO BASE PUNTO ISOELECTRICO DE UN AMINOÁCIDO PROPIEDADES ACIDO BASE Al disolverse en agua existen como un ión dipolar o zwitterion. Carga neta de cero (neutral). Actúan como ácidos o bases=sustancias anfotéricas; se llaman anfólitos. Exhiben curvas de titulación. Ionic forms of amino acids C H COO - H3N + R C H COO - H2N R C H COOH H3N + R Zwitterion pH 7 Net charge 0 pH 1 Net charge +1 pH 13 Net charge -1 H+ H+ Titration Solution of an amino acid PROPIEDADES ACIDO BASE Al disolverse en agua existen como un ión dipolar o zwitterion. Carga neta de cero (neutral). Actúan como ácidos o bases=sustancias anfotéricas; se llaman anfólitos. Exhiben curvas de titulación. La glicina se caracteriza por dos pKa: uno corresponde a la posición más ácida (pKa1) y el otro a la menos ácida (pKa2). Otros aminoácidos con cadenas laterales neutras presentan valores de pKa similares a los de la glicina. El punto isoeléctrico pI corresponde al valor de pH para el cual el aminoácido no tiene carga neta, corresponde a un máximo en la concentración del zwitterión. 4. Propiedades Aminoácido pKa1 pKa2 pI Glicina 2.34 9.60 5.97 Alanina 2.34 9.69 6.00 Valina 2.32 9,62 5.96 Leucina 2.36 9,60 5.98 Isoleucina 2.36 9,60 6.02 Metionina 2.28 9,21 5.74 Prolina 1.99 10.60 6.30 fenilalanina 1.83 9,13 5.48 Triptofan 2.83 9,39 5.89 Asparagina 2.02 8,80 5.41 Glutamina 2.17 9,13 5.65 Serina 2.21 9,15 5.68 Treonina 2.09 9,10 5.60 pKa1:ionización del grupo carboxílico; pKa2: desprotonación del ión amonio Pka 1 pKa2 pKa3 pI Ácido Aspártico 1.88 3.65 9.60 2.77 Ácido Glutámico 2.19 4.25 9.67 3.22 Tirosina 2.20 9.11 10.07 5.66 Cisteína 1.96 8.18 10.28 5.07 Aminoácido Lisina 2.18 8.95 10.53 9.74 Arginina 2.17 9.04 12.48 10.76 Histidina 1.82 6.00 9.17 7.59 Pka 3 Pka 2 pI = ½ (pK 1+pK 2) pI =½ (pK 1+pK 3) pI = ½ (pK 2 +pK 3) PUNTO ISOELECTRICO Es el pH donde el amino ácido tiene una carga neta de cero. Todos los amino ácidos, péptidos y proteínas tienen una carga neta positiva a pH bajo el pI y una carga neta negativa a pH sobre el pI. Cada grupo disociable de un aminoácido tiene un pK característico y se puede estimar la proporción de moléculas disociadas y no disociadas a un pH cualquiera por la ecuación: pH = pK + log Forma protonada/ no protonada. 13 pI = pKax + pKay 2 pI = pKa2 + pKa3 2 pI = 9.7 pI = pKa1 + pKa3 2 pI = 2.7 pI = pKa1 + pKa2 2 pI = 6.0 pH Fisiológico de los aminoácidos proteicos pK1 pK2 pK3 pI Carga al pH Plásmático Neutros 2 a 3 9 a 10 - 6.0 δ (-) Cys 1.7 10.8 8.3 5.0 δ (-) Tyr 2.2 9.1 10.1 6.15 δ (-) Asp - Glu 2 a 3 9 a 10 3 a 4 3 -1 neta Lys - Arg 2 a 3 9 10.5 –12.5 10.5 + 1 neta His 1.8 9.2 6 7.6 Casi nula Histidine has 3 pKa’s 16 How to Calculate the pI When the Side Chain is Ionizable Identify species that carries a net zero charge Identify pKa value that defines the acid strength of this zwitterion: (pK2) Identify pKa value that defines the base strength of this zwitterion: (pK1) Take the average of these two pKa values What is the pI of histidine? 17 Proteínas Composición Estructura Función Son las macromoléculas biológicas más abundantes Se encuentran en todas las células y en todas partes dentro de las células Existen miles de diferentes tipos y tamaños de proteínas Exhiben una gran cantidad de diversidad de funciones Función biológica de las proteínas Función Ejemplo Enzimas Hexoquinasas, isomerasas, hidrolasas Transporte Ingreso de nutrientes en las bacterias Contráctiles pilina (cilias y flagelos) Toxinas Venenos, diftérica Estructurales Recubrimiento viral, pared celular, Hormonas crecimiento Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón Segundo nivel Tercer nivel Cuarto nivel Quinto nivel Función ESTRUCTURAL -Algunas proteinas constituyen estructuras celulares: Ciertas glucoproteinas forman parte de las membranas celulares y actuan como receptores o facilitan el transporte de sustancias. Las histonas, forman parte de los cromosomas que regulan la expresión de los genes. -Otras proteinas confieren elasticidad y resistencia a órganos y tejidos: El colágeno del tejido conjuntivo fibroso. La elastina del tejido conjuntivo elástico. La queratina de la epidermis. Proteins- Levels of Structure Amino acids can undergo condensation reactions in any order, thus making it possible to form large numbers of proteins. Structurally, proteins can be described in four ways. Primary Secondary Tertiary Quaternary structure. 23 23 El esqueleto de toda proteína esta constituido por una repetición de HN-Ca-C=O. Esta unidad de repetición está enlazada mediante enlaces peptídicos Unidos al esqueleto del polipéptido encontramos, hidrógenos del grupo amino, oxígenos del grupo carbonilo e hidrógenos y las cadenas laterales de los carbonos alfa. Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón Segundo nivel Tercer nivel Cuarto nivel Quinto nivel 24 Ser Gly Tyr Ala Leu -COO y –NH están comprometidos en el enlace peptídico La carga neta e hidrofobicidad de la proteína dependerá de los grupos R Conformación de las proteínas Todas las proteínas poseen un estado NATIVO, una forma tridimiensional característica conocida como CONFORMACIÓN. La conformación se puede describir en términos de niveles estructurales Estructuras 1ria, 2ria, 3ria y 4ria Ordenamiento tridimensional ESTRUCTURAS DE LAS PROTEINAS Las proteínas tienen 4 estructuras, la estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. A continuación son definidas y explicadas ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS La estructura primaria es la secuencia de aminoáciodos de la proteína. Nos indica qué aminoácidos componen la cadena polipeptí-dica y el orden en que dichos aminoácidos se encuentran. La función de una proteína depende de su secuencia y de la forma que ésta adopte. insulina ESTRUCTURA SECUNDARIA: ALFA HÉLICE La estructura secundaria es la disposición de la secuencia de aminoácidos en el espacio. Los aminoácidos, a medida que van siendo enlazados durante la síntesis de proteínas y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una disposición espacial estable, la estructura secundaria. alfa-hélice: se forma al enrollarse helicoidalmente sobre sí misma la estructura primaria. Se debe a la formación de enlaces de hidrógeno entre el -C=O de un aminoácido y el -NH- del cuarto aminoácido que le sigue. ESTRUCTURA SECUNDARIA EN PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS La estructura secundaria de un péptido consiste en la relación conformacional del aminoácido vecino más cercano con respecto a otro. L. Pauling y R. B. Corey establecieron que ciertas conformaciones peptídicas eran más estables que otras. Dos disposiciones especialmente estables son: la hélice α y la hoja plegada β. Ambas conformaciones se basan en: La geometría del enlace peptídico es plana y la cadena principal se dispone en conformación anti. Se pueden formar enlaces de hidrógeno cuando el grupo N-H de un residuo y el grupo C=O de otro se encuentran próximos en el espacio. Aquellas conformaciones que maximizan el número de estos enlaces se encuentran particularmente estabilizadas. 6.3. Estructura de péptidos y proteínas Hoja plegada β o lámina β En esta disposición los aminoácidos forman una cadena en forma de zigzag, mediante la formación de enlaces de hidrógeno entre los grupos N-H y los C=O de cadenas adyacentes antiparalelas. Ej: fibroína de la seda. Hélice α Se forma al enrollarse la estructura primaria helicoidalmente sobre sí misma. Se debe a la formación de enlaces de hidrógeno entre el -C=O de un aminoácido y el -NH- del cuarto aminoácido que le sigue. Ej: queratina del pelo, cuernos,uñas, lana. 6.3. Estructura de péptidos y proteínas ESTRUCTURA TERCIARIA EN PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS La estructura terciaria de una proteína consiste en el plegamiento de la cadena. La forma en que se pliega la cadena afecta tanto a sus propiedades físicas como a su función biológica. Las proteínas estructurales, tales como las presentes en la piel, el pelo, los tendones, la lana o la seda, pueden tener una estructura secundaria tanto de hélice como de hoja plegada β, pero en general tienen una forma alargada de longitud varias veces el diámetro de la cadena. Se denominan proteínas fibrosas y tienden a no ser solubles en agua. Otras proteínas, incluyendo la mayoría de los enzimas, operan en agua. Éstas se denominan globulares y tienen una forma más o menos esférica: Mioglobina 6.3. Estructura de péptidos y proteínas Estructura 3ria Se refiere al modo en que la cadena polipeptídica se pliega o se curva para formar la estructura plegada o compacta de las proteínas solubles ESTRUCTURA TERCIARIA Aparecen varios tipos de enlaces: puente disulfuro. puentes de hidrógeno puentes eléctricos interacciones hidrófobas. La estructura terciaria informa sobre la disposición de la estructura secundaria de un polipéptido al plegarse sobre sí misma originando una conformación globular. Esta conformación globular facilita la solubilidad en agua y así realizar funciones de transporte, enzimáticas, hormonales, etc. Se mantiene estable gracias a la existencia de enlaces entre los radicales R de los aminoácidos. Puentes de H2 ESTRUCTURA CUATERNARIA Esta estructura informa de la unión , mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero. El número de protómeros varía desde dos como en la hexoquinasa, cuatro como en la hemoglobina, o muchos como la cápsida del virus de la poliomielitis, que consta de 60 unidades proteicas. La estructura terciaria de una proteína depende de diversos factores: Su estructura primaria y secundaria. Su entorno. En proteínas globulares la parte lipofílica se sitúa hacia el interior y los grupos polares en la superficie. El estado nativo de una proteína es la estructura terciaria en la cual expresan su actividad biológica. - Conocer el plegamiento de la proteína permite entender el mecanismo por el que un enzima cataliza las reacciones. Ej: carboxipeptidasa. La región interna del enzima donde se localizan los grupos funcionales que participan en la actividad catalítica se conoce con el nombre de sitio activo. 6.3. Estructura de péptidos y proteínas ESTRUCTURA CUATERNARIA DE LAS PROTEÍNAS: HEMOGLOBINA Algunas proteínas están formadas por ensamblaje de dos o más cadenas. La forma en que estas subunidades se encuentran organizadas se denomina estructura cuaternaria. La hemoglobina es una proteína de la sangre encargada del transporte de oxígeno, uniéndose a éste y transportándolo hasta los músculos donde se almacena en la mioblobina. La hemoglobina se une a oxígeno de la misma forma que la mioglobina, a través del grupo hemo, pero es mucho más grande que ésta. La hemoglobina es un ensamblaje de cuatro grupos hemo y cuatro cadenas protéicas, dos llamadas α y dos β. Algunas sustancias, por ejemplo CO, mucho más fuertemente al Fe que el oxígeno por lo que interfieren con el transporte y almacenamiento de oxígeno pudiendo provocar resultados letales. hemoglobin protease, Escherichia coli (http://www.pdb.org/) DOI:10.1074/jbc.M412885200 6.3. Estructura de péptidos y proteínas ESTRUCTURA SECUNDARIA: ALFA HÉLICE ESTRUCTURA SECUNDARIA: BETA PLANAR Paralela Antiparalela hélice-vuelta-hélice cremallera de leu horquilla b barril b b-a-b CONFORMACIÓN DE LAS PROTEÍNAS estructura jerárquica Estructura 1ria Estructura 2ria Estructura 3ria Estructura 4ria Secuencia de aa del esqueleto del peptídico y S-S Arreglo / distribución/ordenamiento del esqueleto y las cadenas laterales de la proteína en el espacio Describe el ordenamiento tridimensional de las proteínas DESNATURALIZACIÓN Desnaturalización. Consiste en la pérdida de la estructura terciaria, por romperse los puentes que forman dicha estructura. Todas las proteínas desnaturalizadas tienen una conformación muy abierta y con máxima interacción con el disolvente, por lo que una proteína soluble en agua cuando se desnaturaliza se hace insoluble. Se puede producir por cambios de temperatura, (huevo cocido o frito), variaciones del pH. En algunos casos, una proteína desnaturalizada puede renaturalizarse. CUANTIFICACION DE PROTEINAS ELECTROFORESIS Cuando se aplica un campo eléctrico a un medio que contiene partículas cargadas, las partículas cargadas negativamente migran hacia el ánodo o polo positivo mientras que, las cargadas positivamente migran hacia el electrodo negativo (cátodo). Este principio se puede aplicar para separar las fracciones de proteínas La cantidad de carga neta en la molécula es variable y depende del pH del amortiguador. Si el pH del medio es menor que el punto isoeléctrico, las proteínas se comportan como cationes y, si el pH del medio es superior al pI, se comportan como aniones. La carga de la proteína se hace más negativa a medida que el pH del amortiguador se hace más básico . ELECTROFORESIS Los pasos a seguir en una electroforesis se pueden resumir en: 1.Separación electroforética mediante un campo eléctrico 2. Fijación de las proteínas sobre el soporte 3. Revelado de las proteínas para identificar su presencia y separación. Se realiza mediante colorantes ácidos, negro amido, rojo Ponceau... Que se fijan sobre las funciones básicas de las proteínas. El exceso de colorante se arrastra con mezclas acético-agua, o metanol-acético, según el colorante utilizado con tal de que se decolore el soporte sin elución del colorante fijado a las proteínas. 4. Cuantificación de las fracciones electroforéticas mediante fotómetros especiales (densitómetros) que permiten cuantificar el colorante fijado a diferentes distancias del punto de aplicación, y con ello la representación gráfica de la separación (proteinograma: gráfica que representa las fracciones proteícas del suero sanguíneo). Propiedades Funcionales de las Proteínas Propiedad Función Hidratación Solubilidad, dispersión, absorción de agua, espesante, gelificante, viscosidad, formación de masas y propiedades reológicas en general. Estructural y Reológica Elasticidad, cohesión, formación de redes tridimensionales, formación de fibras, viscosidad, agregación, gelificación. Sensorial Color, sabor, olor, textura, turbidez, arenosidad, etc. Superficie Emulsificación, espumante, estabilización, formación de complejos lípido-proteínicos Otras Compatibilidad con aditivos, acción enzimática y modificación de propiedades de los alimentos PROPIEDADES FISICOQUÍMICAS CARGAS DE LAS PROTEÍNAS: La cadena está salpicada de muchas cargas procedentes de los grupos ácidos y básicos colaterales de loa Aa y de los grupos –NH2 y COOH inicial y final. Las cargas varía con el pH. Hay un pH (punto isoeléctrico) en el que la molécula tiene mismo número de cargas + que – (proteína neutra). PROPIEDADES FISICOQUÍMICAS SOLUBILIDAD: Las proteínas aumentan su solubilidad a concentraciones salinas bajas y precipitan a concentraciones salinas altas. El pH influye en la solubilidad. En el pI es mínima y la capacidad de cristalización es máxima; a pH extremos la solubilidad es máxima. PROTEINAS EN ALGUNOS ALIMENTOS PROTEÍNAS DEL HUEVO: El huevo está constituido por 10,5% cáscara; 58,5% de albumen o clara y 31% yema; los sólidos de su parte comestible (albumen +yema) están integrados básicamente por proteínas y lípidos. (95%materia seca) Componente Huevo entero (%) Yema (%) Clara (%) Agua 74 49 87,8 Proteínas 12,9 16 10,9 Hidratos de carbono 0,4 0,6 0,2 Lípidos 11,5 30,6 0,2 Cenizas0,7 2 0,3 PROTEINAS EN ALGUNOS ALIMENTOS La Ovoalbumina es la mas abundante. Albumen Proteínas sin actividad biológica: Ovoalbúmina Globulinas G2 G3 Macroglobulina Proteínas con actividad biológica: Enzimática Lisozima Glucosidasas Catalasas Peptidasas Esterasas No Enzimática Quelantes Conalbúmina Flavoproteínas Avidina Inhibidores Ovomucoide Ovoinhibidor Ovomucina Otros Ovoglucoproeína PROTEINAS EN ALGUNOS ALIMENTOS PROTEÍNAS DE LA CARNE: Proteínas contráctiles o microfibriales: conforman estructuralmente el tejido muscular y transforman la energía química en mecánica durante la contracción y relajación de músculos. Miosina, actina, tropomiosina, troponina y actinina. Proteínas solubles: miogeno (albúminas y globulinas que pertenecen a los sistemas del metabolismo celular, tal: glucólisis). Proteínas insolubles: conforman el tejido conectivo fuerte de los tendones, la piel, el hueso y las capas más rígidas que envuelven y soportan los músculos. Componentes Análisis aproximado de la mayoría de las carnes (%) Agua 70 Proteínas 20 Hidratos de carbono y sustancias no nitrogenadas 1,5 Lípidos 6 Sustancias nitrogenadas no proteicas 1,5 Sales inorgánicas 0,7 PROTEINAS EN ALGUNOS ALIMENTOS PROTEÍNAS DEL TRIGO: Su capacidad de esponjamiento se debe a las proteínas, aunque influyen otros constituyentes como: el almidón y los lípidos. La harina contiene entre 10 a 12% de proteínas. Son básicamente glutelinas y prolaminas.(presentes en el citoplasma de las células del endospermo). Actúan como componentes estructurales y de reserva de nitrógeno para el crecimiento. En menor proporción, hay albúminas y globulinas, que representan el 15% (favorecen las reacciones de oscurecimiento no enzimático responsables del color y del aroma típicos de los productos de panadería). El gluten en su conjunto tiene una composición de aminoácidos de aproximadamente 6%ionizables, 45% polares y 49% apolares. La tenacidad de las harinas se debe a la composición del gluten. CO2 CH3 H H3NCO2H CH3 H H3N low pH CO2 CH3 H H2N + + high pH pKa1 (2.3) pKa2 (9.7) CO2H CH2 H H3N CO2H pKa3 (3.6) CO2 H H3N CH2 CO2H CO2 H H3N CH2 CO2 pKa2 (9.6) pKa1 (1.9) CO2 H H2N CH2 CO2 low pH high pH CO2H (CH2)4 H H3N NH3 pKa2 (9.0) CO2 H H3N (CH2)4 NH3 CO2 H H2N (CH2)4 NH3 pKa3 (10.5) pKa1 (2.2) CO2 H H2N (CH2)4 NH2 low pH high pH H 3 N C H C C H 3 N H O P é p t i d o C H C O O R O H H Z n 2 + H 2 N C H 2 N A r g - 1 4 5
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