como sera indiciado um deputado federal ao matar alguém, tendo agido com seu babao?

Pergunta complexa para se responder, tendo em vista a insegurança juridica causada pelo ativismo do STF. 

Em tese existem duas possibilidade:

1º Ambos responderiam perante o STF, pois o deputado detém foro especial;

2º Apenas o deputado responderia perando o STF e o "babão" iria para o júri popular em primeira instância. 

Lembrando que com a recente decisão do STF, que ainda não terminou, mas já é maioria, o foro "privilegiado" só se aplica aos casos que envolvam o exercicio do mandato parlamentar. 

No caso se o crime foi por motivação politica, o STF continua sendo o responsável, se não guardar relação com o mandato o parlamentar iria ser julgado também pelo rito do júri popular em primeira instância.