É um polissacarídeo formado por resíduos de glicose com ligações glicosídicas. A parte ramificada contém ligação α-1,6 e a parte linear ligações α-1,4.
O glicogênio se forma a partir de um iniciador, o UDP glicose, ou glicogenina. Esse iniciador é formado a partir da uridinatrifosfato (UTP) que se liga a glicose 1P formando a uridina-difosfato-glicose (UDP), reação catalizada pela UDP-glc-pirofosforilase. Assim cada nova glicose adicionada a ele é uma ligação fosfoglicosil e é catalizada pela glicogenio sintase. As ramificação alfa-1-6 são realizadas pela amilo-(1,4-1,6)-transglicosilase.
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