Começa mais ou menos no 18º dia, com a formação da placa neural, e acaba por volta da 5ª semana, com os somitos. Nesse ponto o tubo neural já fechou (espera-se).
A posição e o arranjo das camadas germinativas são altamente específicos para cada espécie, dependendo do tipo de embrião produzido. Nos vertebrados, uma população especial de células embrionárias chamada crista neural foi proposto como uma "quarta camada germinativa" e acredita-se que tenha sido uma novidade importante na evolução das estruturas da cabeça.
Durante a organogênese, as interações moleculares e celulares entre as camadas germinativas, combinadas com o potencial de desenvolvimento das células, ou a competência para responder, estimulam a diferenciação adicional dos tipos de células específicas de órgãos. Por exemplo, na neurogênese, uma subpopulação de células ectodérmicas é reservada para se tornar o cérebro, medula espinhal e nervos periféricos.
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