Vamos analisar as alternativas uma a uma: A) "Os microrganismos interferem no desenvolvimento das plantas, porém as plantas não interferem no desenvolvimento dos microrganismos." - Essa afirmação é incorreta, pois as plantas também podem influenciar os microrganismos. B) "As plantas interferem no desenvolvimento dos microrganismos, porém os microrganismos não interferem no desenvolvimento das plantas." - Essa afirmação também é incorreta, pois os microrganismos têm um papel importante no desenvolvimento das plantas. C) "Sobre essa interação, os microrganismos possuem sempre vantagem em relação às plantas." - Essa afirmação é exagerada e não reflete a complexidade das interações. D) "As plantas não são capazes de se associar beneficamente com microrganismos." - Essa afirmação é falsa, pois muitas plantas formam associações benéficas com microrganismos, como as micorrizas. E) "Da mesma forma que os microrganismos interferem no desenvolvimento das plantas, as plantas também interferem no desenvolvimento dos microrganismos." - Essa afirmação é correta, pois reconhece a interação mútua entre plantas e microrganismos. Portanto, a alternativa correta é: E.