Para analisar a questão, precisamos entender o que a cooperação federativa representa no contexto do sistema prisional e a relação entre a União e os estados. A cooperação entre o estado e o DEPEN (Departamento Penitenciário Nacional) para capacitar servidores e modernizar o sistema prisional, com repasse de recursos federais, é uma forma de colaboração que visa melhorar a gestão e a eficiência do sistema prisional. Vamos analisar as alternativas: A) Ingerência indevida da União sobre os estados - Essa opção sugere uma interferência negativa, o que não é o caso, já que a cooperação é formal e visa melhorias. B) Violação ao pacto federativo previsto na Constituição - A cooperação não viola o pacto federativo, mas sim o respeita ao buscar melhorias. C) Descentralização ilícita de recursos públicos - A descentralização é uma prática comum e legal quando feita de forma adequada, não se encaixando aqui. D) Intervenção direta do Poder Executivo Federal - A cooperação não é uma intervenção, mas sim um acordo de colaboração. E) Aplicação do princípio da subsidiariedade federativa - Essa opção se refere à ideia de que as ações devem ser realizadas pela instância mais próxima do problema, o que se aplica bem ao contexto de cooperação entre a União e os estados para melhorar o sistema prisional. A alternativa correta é: E) Aplicação do princípio da subsidiariedade federativa.