Qual a diferença entre Fossa abissal e bacia oceânica?

Bacia oceânica:
Corresponde à maior superfície e se estende a partir do limite do talude continental até, aproximadamente, 5 mil metros de profundidade. É formada por extensas bacias.

Fossas abissais:
As fossas abissais estão localizadas próximas aos continentes, e formam as regiões mais profundas do relevo submarino.

Logo a diferença é a profunidade em relação ao Talude. 

Referência: http://mundoeducacao.bol.uol.com.br/geografia/relevo-submarino.htm

Bacia Oceânica domínio fisiográfico localizado ápos o pé do talude. Já Fossa Abissal região ultraprofunda formada na região de colisão da placas tectônica, em área de subdução.  

Bacia Oceânica refere-se à totalidade da área coberta por águas, compondo o conjunto dos oceanos. Do ponto de vista da sedimentologia, é a região onde ocorre os processos de erosão, transporte e deposição dos sedimentos (marinhos).

Fossa é um termo estrutural (normalmente linear, em planta) com origem e evolução tectônica. A Fossa das Marianas possui as maiores profundidades dos planeta.