Qual a diferença de proteína recombinante com proteína de fusão?

Apesar de não ter estudado isso ainda, pelo pouco que sei sobre, Proteínas Recombinantes são oriundas da tradução de genes Recombinantes (produzidas artificialmente por DNA's Recombinantes.
As Proteínas de Fusão são divididas em outros subtipos, como de membrana... ela tem como função se acoplar, se aderir a uma substrato ou a uma molécula. 
Umas proteína de Fusão pode ser Recombinante ou não, uma vez que independe do tipo de proteína para ser feita a técnica de REcombinação gênica e sua posterior transcrição e tradução. Assim, qualquer tipo de proteína pode ou não ser Recombinante, contudo, as Proteínas de Fusão são características e possuem uma função específica. 

Espero ter ajudado de alguma forma e apesar de responder sei que a resposta não está completa e talvez possua até algum erro, mas espero que já te acrescente algo...