O NADH molecula aceptora de eletrons mais energizada transfere seus eletrons ao complexo I da cadeia de eletrons na matriz mitocondrial através da catalisação da enzina NADH oxidase, onde ocorre a redução de NADH em NAD+ e protóns H+ são bombeados para fora devido a energia liberada . E a FADH2 transfere seus eletrons para o complexo II da cadeia de eletrons , trata-se de uma molecula menos energetica , contudo também muito importante na sintese de ATP , no proscesso de fosforilação oxidativa .
O NADH transfere os elétrons de alta energia e, com isso, energia, para o primeiro dos três complexos proteicos localizados na membrana interna das mitocôndrias, responsável por bombear H+ para o espaço intermembranar.
Os elétrons de alta energia do FADH2 serão transferidos para o segundo complexo proteico bombeador de íons H+ nas membranas internas das mitocôndrias. Assim, ao contrário dos elétrons fornecidos pelo NADH, que passam pelas três bombas de H+, os do FADH2 passam por duas. Por isso, às vezes se lê que os elétrons do FADH2 têm menos energia ou algo do tipo.
A respiração aeróbia é o processo pelo qual a célula degrada compostos orgânicos (carboidratos) para obtenção de energia metabólica armazenada na molécula de Adenosina Trifosfato - ATP, com produção de compostos inorgânicos dióxido de carbono (CO2) e água (H2O).
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