Com exceção dos alcaloides quaternários, é possivel por extração líquido-líquido com variação de pH. O alcaloide em sua forma natural, é solúvel em solventes orgânicos. Uma das formas de extrair é reagi-lo com ácido, ocorrendo uma reação ácido base (por conta do átomo de N do alcaloide) em que é formado um sal de alcaloide. Em seguida, o sal de alcaloide é extraido com água. Ao adicionar à fase aquosa uma base mais forte que o alcaloide, ele retorna à sua forma natural, sendo possível extraí-lo em solvente orgânico.
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