Do mesmo modo que em um trem cada vagão está engatado ao seguinte, em uma proteína cada aminoácido está ligado a outro por uma ligação peptídica. Por meio dessa ligação, o grupo amina de um aminoácido une-se ao grupo carboxila do outro, havendo a liberação de uma molécula de água. Os dois aminoácidos unidos formam um dipeptídio.
A ligação peptídica envolve a perda de uma molécula de água e a formação de uma ligação covalente de CO-NH. É, na realidade, uma ligação amida substituída. A formação deste elo requer fornecimento de energia, enquanto sua quebra ( hidrólise) libera ela.
Podemos continuar adicionando aminoácidos ao peptídeo, mas sempre na extremidade terminal do COOH. Para nomear o peptídeo, comece com o terminal NH2 por acordo. Se o primeiro aminoácido do nosso peptídeo fosse a alanina e a segunda serina , teríamos o peptídeo alanil-serina.
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