No que diz respeito à localização das placas de Payer no organismo, pode-se dizer que são encontradas:

As placas de Payer são encontradas no Ìleo.

Placas de Peyer ou Conglomerados Linfonodulares Ileais são agregados de nódulos linfáticos que constituem um componente principal do tecido linfático associado ao intestino (em inglês Gut Associated Linfoid Tissue ou GALT e são particularmente grandes no Íleo(parte terminal do intestino delgado, localizada entre o jejuno e a primeira porção do intestino grosso), onde se encontram principalmente na parte do intestino oposta ao mesentério (borde anti-mesentérico intestinal).

Possuem alguns centímetros, logo podem ser identificados mesmo sem ajuda de instrumentos. São tecidos ovalados e densos localizados na membrana mucosa do intestino, formando áreas alongadas e a sua superfície está livre das vilosidades e depressões (glândulas Lieberkühn) que caracterizam a parede intestinal. Como possuem capacidade de transportar os antígenos luminais e bactérias podem ser considerados como os sensores do sistema imunológico do intestino.

Portanto, no que diz respeito à localização das placas de Payer no organismo, pode-se dizer que são encontradas entre as células intestinais, especialmente no Íleo.