Como os anticorpos reconhecem os antígenos que devem "atacar"? E como um antígeno se torna tolerante?

Porque as células de defesa do nosso organismo, quando são maturadas, ficam a saber o que é "nosso" (self). Logo, conseguem distinguir o self do que é estranho (non-self).

Quando vêem que o antigénio é estranho, atacam, provocando uma reação imunológica.

Há antigénios imunogenos e antigenios que não são imunogénios (não provocam reações imunológicas).

Mas há doenças autoimunes que levam a que a defesa do organismo não identifique os antigénios self, logo irá ve-los como imunogénios e atacará as próprias células da pessoa. Essas pessoas tem de ser medicadas.