Sao aminoácidos são formados por um carbono, um ácido carboxílico, uma amina e um radical, o qual varia de aminoácido para aminoácido
A estrutura da proteína também os torna adequados para a formação de materiais biológicos funcionais, bem como a sua capacidade de auto-montagem. Os desenvolvimentos resultantes na nanotecnologia baseada em proteínas incluem proteínas sendo utilizadas como elementos importantes em aplicações de nanotecnologia, juntamente com a aplicação de nanodispositivos ao ambiente biológico onde as proteínas estão contidas.
As proteínas são adequadas para uso no desenvolvimento de materiais e para a construção de máquinas em nanoescala, porque elas fornecem papéis semelhantes na biologia. As complexas formações de proteínas que ocorrem no ambiente biológico incluem anéis, tubos e gaiolas, potenciais blocos de construção para nanomáquinas. A montagem de componentes em nanoescala é problemática porque as pequenas dimensões envolvidas causam dificuldade na manipulação.
A utilização de proteínas fornece uma solução, pois elas mostram afinidade natural com outras biomoléculas e podem espontaneamente se auto-montar. Por meio da engenharia de afinidades de proteínas, os nanodispositivos podem se auto-montar quando componentes individuais são misturados.
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