Um Juiz pode escolher, após os 2 anos como Juiz Substituto, a área que quer seguir ?

O Juiz não pode escolher a área, e o processo é diferente em casa nível (estadual, federal, justiças especial)

Juiz da Justiça Estadual (TJ's) - O Juiz substituto, que é aquele no estágio probatório, acaba pulando de galho em galho, sendo quase um tapa buraco. Ele não necessáriamente ficará os 3 anos numa mesma Vara. Geralmente ele passa por várias varas para cobrir as férias dos Juizes titulares, em licença, etc. Depois que o juiz passa a ser vitalício ele não escolhe a área (vara) mas se ele quiser trocar ele pode se inscrever em um processo interno que se chama "remoção" para ir para outra vara que abra vaga, podendo ser na mesma Comarca ou não. Ness processo há uma série de preferências para ser chamado, como por exemplo tempo de carreira (os mais antigos tem preferencia). O juiz também pode ser promovido em alguns casos.

Juiz da Justiça Federal -  a mesma história, com diferença do substituto que não será necessariamente o juiz em estágio probatório. Pode também pedir remoção ou outros procedimentos para mudança de vara.

Juiz da Justiça Especial (Justiça do Trabalho, Justiça Eleitoral, Justiça Militar) - Neste caso o juiz também não pode escolher a Vara que ele quer, porém o que diferencia é que, como trata-se de uma Justiça especializada, a pessoa quando passa no concurso já sabe a área que vai atuar. Ex. Se aguém faz concuso na Justiça no trabalho (TRT) ele vai obviamente atuar na área trabalhista. 

Espero ter ajudado! ;*

Não. Não há tempo certo no qual o juiz pode se candidatar a uma promoção.

Após dois anos de atividade, o que ocorre é que o juiz adquire vitaliciedade. 

Todos os juízes iniciam como substitutos, auxiliando e aprendendo junto aos juízes titulares. Sua atuação se dá inicialmente em pequenas cidades, onde estão sediadas as chamadas Comarcas de primeira entrância. Com o passar do tempo, podem ser alçados a titularidade de uma vara ou comarca, ou se candidatar à remoção ou promoção para Comarcas de entrância superior, sediadas, em geral, em cidades maiores e capitais dos Estados.

As promoções se dão de acordo com a disponibilidade das vagas e seguem os critérios de merecimento ou antiguidade.